CLSTN1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLSTN1, ALC-ALPHA, CDHR12, CSTN1, PIK3CD, XB31alpha, alcalpha1, alcalpha2, CST-1, calsyntenin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611321 MGI: 1929895 HomoloGene: 8814 GeneCards: CLSTN1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • X11-like protein binding • calcium ion binding • amyloid-beta binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • cell projection • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • синапс • extracellular region • cell surface • міжклітинні контакти • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • postsynaptic endosome • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic density membrane • integral component of spine apparatus membrane |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • positive regulation of synaptic transmission • regulation of cell growth • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • positive regulation of synapse assembly • regulation of synapse maturation • neurotransmitter receptor transport to postsynaptic membrane • vesicle-mediated transport in synapse |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_014944 NM_001009566 NM_001302883 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001009566 NP_001289812 NP_055759 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 9.73 – 9.82 Mb | Хр. 4: 149.67 – 149.73 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLSTN1 (англ. Calsyntenin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 981 амінокислот, а молекулярна маса — 109 793[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLRRPAPALA | | PAARLLLAGL | | LCGGGVWAAR | | VNKHKPWLEP | | TYHGIVTEND |
NTVLLDPPLI | | ALDKDAPLRF | | AESFEVTVTK | | EGEICGFKIH | | GQNVPFDAVV |
VDKSTGEGVI | | RSKEKLDCEL | | QKDYSFTIQA | | YDCGKGPDGT | | NVKKSHKATV |
HIQVNDVNEY | | APVFKEKSYK | | ATVIEGKQYD | | SILRVEAVDA | | DCSPQFSQIC |
SYEIITPDVP | | FTVDKDGYIK | | NTEKLNYGKE | | HQYKLTVTAY | | DCGKKRATED |
VLVKISIKPT | | CTPGWQGWNN | | RIEYEPGTGA | | LAVFPNIHLE | | TCDEPVASVQ |
ATVELETSHI | | GKGCDRDTYS | | EKSLHRLCGA | | AAGTAELLPS | | PSGSLNWTMG |
LPTDNGHDSD | | QVFEFNGTQA | | VRIPDGVVSV | | SPKEPFTISV | | WMRHGPFGRK |
KETILCSSDK | | TDMNRHHYSL | | YVHGCRLIFL | | FRQDPSEEKK | | YRPAEFHWKL |
NQVCDEEWHH | | YVLNVEFPSV | | TLYVDGTSHE | | PFSVTEDYPL | | HPSKIETQLV |
VGACWQEFSG | | VENDNETEPV | | TVASAGGDLH | | MTQFFRGNLA | | GLTLRSGKLA |
DKKVIDCLYT | | CKEGLDLQVL | | EDSGRGVQIQ | | AHPSQLVLTL | | EGEDLGELDK |
AMQHISYLNS | | RQFPTPGIRR | | LKITSTIKCF | | NEATCISVPP | | VDGYVMVLQP |
EEPKISLSGV | | HHFARAASEF | | ESSEGVFLFP | | ELRIISTITR | | EVEPEGDGAE |
DPTVQESLVS | | EEIVHDLDTC | | EVTVEGEELN | | HEQESLEVDM | | ARLQQKGIEV |
SSSELGMTFT | | GVDTMASYEE | | VLHLLRYRNW | | HARSLLDRKF | | KLICSELNGR |
YISNEFKVEV | | NVIHTANPME | | HANHMAAQPQ | | FVHPEHRSFV | | DLSGHNLANP |
HPFAVVPSTA | | TVVIVVCVSF | | LVFMIILGVF | | RIRAAHRRTM | | RDQDTGKENE |
MDWDDSALTI | | TVNPMETYED | | QHSSEEEEEE | | EEEEESEDGE | | EEDDITSAES |
ESSEEEEGEQ | | GDPQNATRQQ | | QLEWDDSTLS | | Y |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, апараті гольджі, синапсах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17447 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O94985 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |