CYBA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WLP

Ідентифікатори

Символи

CYBA, p22-PHOX, Cytochrome b-245, alpha polypeptide, cytochrome b-245 alpha chain, CGD4

Зовнішні ІД

OMIM: 608508 MGI: 1316658 HomoloGene: 80 GeneCards: CYBA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • heme binding • protein heterodimerization activity • electron transfer activity • oxidoreductase activity • superoxide-generating NAD(P)H oxidase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ендосома • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • клітинна мембрана • perinuclear endoplasmic reticulum • secretory granule • neuronal cell body • НАДФН-оксидаза • дендрит (нейробіологія) • apical plasma membrane • мітохондрія • клітинне ядро • endoplasmic reticulum membrane • stress fiber • focal adhesion • specific granule membrane • tertiary granule membrane
Біологічний процес	• positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process • cellular response to organic substance • positive regulation of phagocytosis • cytochrome complex assembly • response to interleukin-1 • positive regulation of endothelial cell proliferation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • cellular response to tumor necrosis factor • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • negative regulation of glomerular filtration by angiotensin • smooth muscle hypertrophy • positive regulation of defense response to bacterium • cell redox homeostasis • reactive oxygen species metabolic process • superoxide anion generation • respiratory burst • regulation of blood pressure • cellular response to mechanical stimulus • positive regulation of cell growth • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • response to nutrient levels • cellular response to gamma radiation • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of tumor necrosis factor production • cellular response to amino acid stimulus • hydrogen peroxide biosynthetic process • positive regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway • positive regulation of superoxide anion generation • вроджений імунітет • inflammatory response • positive regulation of mucus secretion • cellular response to glucose stimulus • superoxide metabolic process • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • response to aldosterone • positive regulation of NAD(P)H oxidase activity • cellular response to L-glutamine • response to hypoxia • cellular response to angiotensin • response to activity • neutrophil degranulation • cellular response to oxidative stress • Електронтранспортний ланцюг • positive regulation of blood pressure
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1535


13057

Ensembl


ENSG00000051523


ENSMUSG00000006519

UniProt


P13498


Q61462

RefSeq (мРНК)


NM_000101


NM_001301284 NM_007806

RefSeq (білок)


NP_000092


NP_001288213 NP_031832

Локус (UCSC)

Хр. 16: 88.64 – 88.65 Mb

Хр. 8: 123.15 – 123.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CYBA (англ. Cytochrome b-245 alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 195 амінокислот, а молекулярна маса — 21 013^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGQIEWAMWA	NEQALASGLI	LITGGIVATA	GRFTQWYFGA	YSIVAGVFVC
LLEYPRGKRK	KGSTMERWGQ	KYMTAVVKLF	GPFTRNYYVR	AVLHLLLSVP
AGFLLATILG	TACLAIASGI	YLLAAVRGEQ	WTPIEPKPRE	RPQIGGTIKQ
PPSNPPPRPP	AEARKKPSEE	EAAVAAGGPP	GGPQVNPIPV	TDEVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт електронів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом, НАДФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dinauer M.C., Pierce E.A., Bruns G.A.P., Curnutte J.T., Orkin S.H. (1990). Human neutrophil cytochrome b light chain (p22-phox). Gene structure, chromosomal location, and mutations in cytochrome-negative autosomal recessive chronic granulomatous disease. J. Clin. Invest. 86: 1729—1737. PMID 2243141 DOI:10.1172/JCI114898
Ueno N., Takeya R., Miyano K., Kikuchi H., Sumimoto H. (2005). The NADPH oxidase Nox3 constitutively produces superoxide in a p22phox-dependent manner: its regulation by oxidase organizers and activators. J. Biol. Chem. 280: 23328—23339. PMID 15824103 DOI:10.1074/jbc.M414548200
Martyn K.D., Frederick L.M., von Loehneysen K., Dinauer M.C., Knaus U.G. (2006). Functional analysis of Nox4 reveals unique characteristics compared to other NADPH oxidases. Cell. Signal. 18: 69—82. PMID 15927447 DOI:10.1016/j.cellsig.2005.03.023
Hossle J.-P., de Boer M., Seger R.A., Roos D. (1994). Identification of allele-specific p22-phox mutations in a compound heterozygous patient with chronic granulomatous disease by mismatch PCR and restriction enzyme analysis. Hum. Genet. 93: 437—442. PMID 8168815 DOI:10.1007/BF00201671
Ishibashi F., Nunoi H., Endo F., Matsuda I., Kanegasaki S. (2000). Statistical and mutational analysis of chronic granulomatous disease in Japan with special reference to gp91-phox and p22-phox deficiency. Hum. Genet. 106: 473—481. PMID 10914676 DOI:10.1007/s004390000288

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2577 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P13498 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.