DDR2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2a/Protein_DDR2_PDB_2WUH.png/250px-Protein_DDR2_PDB_2WUH.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2WUH, 2Z4F | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DDR2, MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, discoidin domain receptor tyrosine kinase 2, WRCN |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 191311 MGI: 1345277 HomoloGene: 68505 GeneCards: DDR2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
spondyloepimetaphyseal dysplasia-short limb-abnormal calcification syndrome[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
сорафеніб[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase collagen receptor activity • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • collagen binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • integral component of plasma membrane • екзосома • apical plasma membrane • клітинна мембрана • actin cytoskeleton • receptor complex |
---|
Біологічний процес | • collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway • осифікація • фосфорилювання • collagen fibril organization • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • regulation of bone mineralization • positive regulation of fibroblast proliferation • biomineral tissue development • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • extracellular matrix organization • regulation of extracellular matrix disassembly • positive regulation of extracellular matrix disassembly • protein phosphorylation • адгезія клітин • positive regulation of osteoblast differentiation • chondrocyte proliferation • positive regulation of cell population proliferation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • endochondral bone growth • positive regulation of fibroblast migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of protein kinase activity • protein autophosphorylation • regulation of cell-matrix adhesion • cell-matrix adhesion • диференціація клітин • regulation of extracellular matrix organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6c/PBB_GE_DDR2_205168_at_fs.png/250px-PBB_GE_DDR2_205168_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001014796 NM_006182 NM_001354982 NM_001354983 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001014796 NP_006173 NP_001341911 NP_001341912 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 162.63 – 162.79 Mb | Хр. 1: 169.8 – 169.94 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DDR2 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 96 736[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MILIPRMLLV | | LFLLLPILSS | | AKAQVNPAIC | | RYPLGMSGGQ | | IPDEDITASS |
QWSESTAAKY | | GRLDSEEGDG | | AWCPEIPVEP | | DDLKEFLQID | | LHTLHFITLV |
GTQGRHAGGH | | GIEFAPMYKI | | NYSRDGTRWI | | SWRNRHGKQV | | LDGNSNPYDI |
FLKDLEPPIV | | ARFVRFIPVT | | DHSMNVCMRV | | ELYGCVWLDG | | LVSYNAPAGQ |
QFVLPGGSII | | YLNDSVYDGA | | VGYSMTEGLG | | QLTDGVSGLD | | DFTQTHEYHV |
WPGYDYVGWR | | NESATNGYIE | | IMFEFDRIRN | | FTTMKVHCNN | | MFAKGVKIFK |
EVQCYFRSEA | | SEWEPNAISF | | PLVLDDVNPS | | ARFVTVPLHH | | RMASAIKCQY |
HFADTWMMFS | | EITFQSDAAM | | YNNSEALPTS | | PMAPTTYDPM | | LKVDDSNTRI |
LIGCLVAIIF | | ILLAIIVIIL | | WRQFWQKMLE | | KASRRMLDDE | | MTVSLSLPSD |
SSMFNNNRSS | | SPSEQGSNST | | YDRIFPLRPD | | YQEPSRLIRK | | LPEFAPGEEE |
SGCSGVVKPV | | QPSGPEGVPH | | YAEADIVNLQ | | GVTGGNTYSV | | PAVTMDLLSG |
KDVAVEEFPR | | KLLTFKEKLG | | EGQFGEVHLC | | EVEGMEKFKD | | KDFALDVSAN |
QPVLVAVKML | | RADANKNARN | | DFLKEIKIMS | | RLKDPNIIHL | | LAVCITDDPL |
CMITEYMENG | | DLNQFLSRHE | | PPNSSSSDVR | | TVSYTNLKFM | | ATQIASGMKY |
LSSLNFVHRD | | LATRNCLVGK | | NYTIKIADFG | | MSRNLYSGDY | | YRIQGRAVLP |
IRWMSWESIL | | LGKFTTASDV | | WAFGVTLWET | | FTFCQEQPYS | | QLSDEQVIEN |
TGEFFRDQGR | | QTYLPQPAIC | | PDSVYKLMLS | | CWRRDTKNRP | | SFQEIHLLLL |
QQGDE |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як остеогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen. Mol. Cell. 1: 13—23. PMID 9659899 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
- Wall S.J., Werner E., Werb Z., DeClerck Y.A. (2005). Discoidin domain receptor 2 mediates tumor cell cycle arrest induced by fibrillar collagen. J. Biol. Chem. 280: 40187—40194. PMID 16186104 DOI:10.1074/jbc.M508226200
- Vogel W.F., Abdulhussein R., Ford C.E. (2006). Sensing extracellular matrix: an update on discoidin domain receptor function. Cell. Signal. 18: 1108—1116. PMID 16626936 DOI:10.1016/j.cellsig.2006.02.012
- Leitinger B. (2011). Transmembrane collagen receptors. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27: 265—290. PMID 21568710 DOI:10.1146/annurev-cellbio-092910-154013
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з DDR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2731 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q16832 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|