DDR2 (ген)

DDR2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2WUH, 2Z4F

Ідентифікатори

Символи

DDR2, MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, discoidin domain receptor tyrosine kinase 2, WRCN

Зовнішні ІД

OMIM: 191311 MGI: 1345277 HomoloGene: 68505 GeneCards: DDR2

Пов'язані генетичні захворювання

spondyloepimetaphyseal dysplasia-short limb-abnormal calcification syndrome^[1]

Реагує на сполуку

сорафеніб^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase collagen receptor activity • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • collagen binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • integral component of plasma membrane • екзосома • apical plasma membrane • клітинна мембрана • actin cytoskeleton • receptor complex
Біологічний процес	• collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway • осифікація • фосфорилювання • collagen fibril organization • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • regulation of bone mineralization • positive regulation of fibroblast proliferation • biomineral tissue development • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • extracellular matrix organization • regulation of extracellular matrix disassembly • positive regulation of extracellular matrix disassembly • protein phosphorylation • адгезія клітин • positive regulation of osteoblast differentiation • chondrocyte proliferation • positive regulation of cell population proliferation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • endochondral bone growth • positive regulation of fibroblast migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of protein kinase activity • protein autophosphorylation • regulation of cell-matrix adhesion • cell-matrix adhesion • диференціація клітин • regulation of extracellular matrix organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4921


18214

Ensembl


ENSG00000162733


ENSMUSG00000026674

UniProt


Q16832


Q62371

RefSeq (мРНК)


NM_001014796 NM_006182 NM_001354982 NM_001354983


NM_022563

RefSeq (білок)


NP_001014796 NP_006173 NP_001341911 NP_001341912


NP_072075

Локус (UCSC)

Хр. 1: 162.63 – 162.79 Mb

Хр. 1: 169.8 – 169.94 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DDR2 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 96 736^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MILIPRMLLV	LFLLLPILSS	AKAQVNPAIC	RYPLGMSGGQ	IPDEDITASS
QWSESTAAKY	GRLDSEEGDG	AWCPEIPVEP	DDLKEFLQID	LHTLHFITLV
GTQGRHAGGH	GIEFAPMYKI	NYSRDGTRWI	SWRNRHGKQV	LDGNSNPYDI
FLKDLEPPIV	ARFVRFIPVT	DHSMNVCMRV	ELYGCVWLDG	LVSYNAPAGQ
QFVLPGGSII	YLNDSVYDGA	VGYSMTEGLG	QLTDGVSGLD	DFTQTHEYHV
WPGYDYVGWR	NESATNGYIE	IMFEFDRIRN	FTTMKVHCNN	MFAKGVKIFK
EVQCYFRSEA	SEWEPNAISF	PLVLDDVNPS	ARFVTVPLHH	RMASAIKCQY
HFADTWMMFS	EITFQSDAAM	YNNSEALPTS	PMAPTTYDPM	LKVDDSNTRI
LIGCLVAIIF	ILLAIIVIIL	WRQFWQKMLE	KASRRMLDDE	MTVSLSLPSD
SSMFNNNRSS	SPSEQGSNST	YDRIFPLRPD	YQEPSRLIRK	LPEFAPGEEE
SGCSGVVKPV	QPSGPEGVPH	YAEADIVNLQ	GVTGGNTYSV	PAVTMDLLSG
KDVAVEEFPR	KLLTFKEKLG	EGQFGEVHLC	EVEGMEKFKD	KDFALDVSAN
QPVLVAVKML	RADANKNARN	DFLKEIKIMS	RLKDPNIIHL	LAVCITDDPL
CMITEYMENG	DLNQFLSRHE	PPNSSSSDVR	TVSYTNLKFM	ATQIASGMKY
LSSLNFVHRD	LATRNCLVGK	NYTIKIADFG	MSRNLYSGDY	YRIQGRAVLP
IRWMSWESIL	LGKFTTASDV	WAFGVTLWET	FTFCQEQPYS	QLSDEQVIEN
TGEFFRDQGR	QTYLPQPAIC	PDSVYKLMLS	CWRRDTKNRP	SFQEIHLLLL
QQGDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як остеогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen. Mol. Cell. 1: 13—23. PMID 9659899 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
Wall S.J., Werner E., Werb Z., DeClerck Y.A. (2005). Discoidin domain receptor 2 mediates tumor cell cycle arrest induced by fibrillar collagen. J. Biol. Chem. 280: 40187—40194. PMID 16186104 DOI:10.1074/jbc.M508226200
Vogel W.F., Abdulhussein R., Ford C.E. (2006). Sensing extracellular matrix: an update on discoidin domain receptor function. Cell. Signal. 18: 1108—1116. PMID 16626936 DOI:10.1016/j.cellsig.2006.02.012
Leitinger B. (2011). Transmembrane collagen receptors. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27: 265—290. PMID 21568710 DOI:10.1146/annurev-cellbio-092910-154013

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DDR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2731 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q16832 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.