DEPDC1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DEPDC1, DEP.8, DEPDC1-V2, DEPDC1A, SDP35, DEP domain containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612002 MGI: 1923381 HomoloGene: 9834 GeneCards: DEPDC1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • transcription repressor complex • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001172092 NM_001172093 NM_029523 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001165563 NP_001165564 NP_083799 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 68.47 – 68.5 Mb | Хр. 3: 159.2 – 159.24 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DEPDC1 (англ. DEP domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 811 амінокислот, а молекулярна маса — 92 960[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESQGVPPGP | | YRATKLWNEV | | TTSFRAGMPL | | RKHRQHFKKY | | GNCFTAGEAV |
DWLYDLLRNN | | SNFGPEVTRQ | | QTIQLLRKFL | | KNHVIEDIKG | | RWGSENVDDN |
NQLFRFPATS | | PLKTLPRRYP | | ELRKNNIENF | | SKDKDSIFKL | | RNLSRRTPKR |
HGLHLSQENG | | EKIKHEIINE | | DQENAIDNRE | | LSQEDVEEVW | | RYVILIYLQT |
ILGVPSLEEV | | INPKQVIPQY | | IMYNMANTSK | | RGVVILQNKS | | DDLPHWVLSA |
MKCLANWPRS | | NDMNNPTYVG | | FERDVFRTIA | | DYFLDLPEPL | | LTFEYYELFV |
NILVVCGYIT | | VSDRSSGIHK | | IQDDPQSSKF | | LHLNNLNSFK | | STECLLLSLL |
HREKNKEESD | | STERLQISNP | | GFQERCAKKM | | QLVNLRNRRV | | SANDIMGGSC |
HNLIGLSNMH | | DLSSNSKPRC | | CSLEGIVDVP | | GNSSKEASSV | | FHQSFPNIEG |
QNNKLFLESK | | PKQEFLLNLH | | SEENIQKPFS | | AGFKRTSTLT | | VQDQEELCNG |
KCKSKQLCRS | | QSLLLRSSTR | | RNSYINTPVA | | EIIMKPNVGQ | | GSTSVQTAME |
SELGESSATI | | NKRLCKSTIE | | LSENSLLPAS | | SMLTGTQSLL | | QPHLERVAID |
ALQLCCLLLP | | PPNRRKLQLL | | MRMISRMSQN | | VDMPKLHDAM | | GTRSLMIHTF |
SRCVLCCAEE | | VDLDELLAGR | | LVSFLMDHHQ | | EILQVPSYLQ | | TAVEKHLDYL |
KKGHIENPGD | | GLFAPLPTYS | | YCKQISAQEF | | DEQKVSTSQA | | AIAELLENII |
KNRSLPLKEK | | RKKLKQFQKE | | YPLIYQKRFP | | TTESEAALFG | | DKPTIKQPML |
ILRKPKFRSL | | R |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22949 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q5TB30 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |