DIS3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | DIS3, 2810028N01Rik, EXOSC11, KIAA1008, RRP44, dis3p, DIS3 homolog, exosome endoribonuclease and 3'-5' exoribonuclease |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607533 MGI: 1919912 HomoloGene: 6910 GeneCards: DIS3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nuclease activity • hydrolase activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • exonuclease activity • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • endonuclease activity • 3'-5'-exoribonuclease activity • ribonuclease activity |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • нуклеоплазма • цитоплазма • Екзосома • nuclear exosome (RNase complex) • мембрана • клітинне ядро • гіалоплазма • cytoplasmic exosome (RNase complex) |
---|
Біологічний процес | • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • regulation of mRNA stability • CUT catabolic process • rRNA processing • rRNA catabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • regulation of molecular function • Деградація РНК • RNA phosphodiester bond hydrolysis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001128226 NM_014953 NM_001322348 NM_001322349 |
| | NM_028315 NM_001360050 NM_001360051 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001121698 NP_001309277 NP_001309278 NP_055768 |
| | NP_082591 NP_001346979 NP_001346980 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 72.75 – 72.78 Mb | Хр. 14: 99.31 – 99.34 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DIS3 (англ. DIS3 homolog, exosome endoribonuclease and 3'-5' exoribonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 958 амінокислот, а молекулярна маса — 109 003[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLKSKTFLKK | | TRAGGVMKIV | | REHYLRDDIG | | CGAPGCAACG | | GAHEGPALEP |
QPQDPASSVC | | PQPHYLLPDT | | NVLLHQIDVL | | EDPAIRNVIV | | LQTVLQEVRN |
RSAPVYKRIR | | DVTNNQEKHF | | YTFTNEHHRE | | TYVEQEQGEN | | ANDRNDRAIR |
VAAKWYNEHL | | KKMSADNQLQ | | VIFITNDRRN | | KEKAIEEGIP | | AFTCEEYVKS |
LTANPELIDR | | LACLSEEGNE | | IESGKIIFSE | | HLPLSKLQQG | | IKSGTYLQGT |
FRASRENYLE | | ATVWIHGDNE | | ENKEIILQGL | | KHLNRAVHED | | IVAVELLPKS |
QWVAPSSVVL | | HDEGQNEEDV | | EKEEETERML | | KTAVSEKMLK | | PTGRVVGIIK |
RNWRPYCGML | | SKSDIKESRR | | HLFTPADKRI | | PRIRIETRQA | | STLEGRRIIV |
AIDGWPRNSR | | YPNGHFVRNL | | GDVGEKETET | | EVLLLEHDVP | | HQPFSQAVLS |
FLPKMPWSIT | | EKDMKNREDL | | RHLCICSVDP | | PGCTDIDDAL | | HCRELENGNL |
EVGVHIADVS | | HFIRPGNALD | | QESARRGTTV | | YLCEKRIDMV | | PELLSSNLCS |
LKCDVDRLAF | | SCIWEMNHNA | | EILKTKFTKS | | VINSKASLTY | | AEAQLRIDSA |
NMNDDITTSL | | RGLNKLAKIL | | KKRRIEKGAL | | TLSSPEVRFH | | MDSETHDPID |
LQTKELRETN | | SMVEEFMLLA | | NISVAKKIHE | | EFSEHALLRK | | HPAPPPSNYE |
ILVKAARSRN | | LEIKTDTAKS | | LAESLDQAES | | PTFPYLNTLL | | RILATRCMMQ |
AVYFCSGMDN | | DFHHYGLASP | | IYTHFTSPIR | | RYADVIVHRL | | LAVAIGADCT |
YPELTDKHKL | | ADICKNLNFR | | HKMAQYAQRA | | SVAFHTQLFF | | KSKGIVSEEA |
YILFVRKNAI | | VVLIPKYGLE | | GTVFFEEKDK | | PNPQLIYDDE | | IPSLKIEDTV |
FHVFDKVKVK | | IMLDSSNLQH | | QKIRMSLVEP | | QIPGISIPTD | | TSNMDLNGPK |
KKKMKLGK |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесмнг рРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20604 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y2L1 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |