DNAJC13 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | DNAJC13, RME8, PARK21, DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614334 MGI: 2676368 HomoloGene: 13574 GeneCards: DNAJC13 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • lysosomal membrane • ендосома • WASH complex • early endosome membrane • endosome membrane • екзосома • early endosome • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • гіалоплазма • клітинна мембрана • secretory granule membrane • azurophil granule membrane |
---|
Біологічний процес | • protein transport • regulation of early endosome to late endosome transport • regulation of early endosome to recycling endosome transport • osteoblast differentiation • endosome organization • neutrophil degranulation • рецептор-опосередкований ендоцитоз • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_015268 NM_001329126 NM_173823 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 132.42 – 132.54 Mb | Хр. 9: 104.03 – 104.14 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DNAJC13 (англ. DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 243 амінокислот, а молекулярна маса — 254 415[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNIIRENKDL | | ACFYTTKHSW | | RGKYKRVFSV | | GTHAITTYNP | | NTLEVTNQWP |
YGDICSISPV | | GKGQGTEFNL | | TFRKGSGKKS | | ETLKFSTEHR | | TELLTEALRF |
RTDFSEGKIT | | GRRYNCYKHH | | WSDSRKPVIL | | EVTPGGFDQI | | NPATNRVLCS |
YDYRNIEGFV | | DLSDYQGGFC | | ILYGGFSRLH | | LFASEQREEI | | IKSAIDHAGN |
YIGISLRIRK | | EPLEFEQYLN | | LRFGKYSTDE | | SITSLAEFVV | | QKISPRHSEP |
VKRVLALTET | | CLVERDPATY | | NIATLKPLGE | | VFALVCDSEN | | PQLFTIEFIK |
GQVRKYSSTE | | RDSLLASLLD | | GVRASGNRDV | | CVKMTPTHKG | | QRWGLLSMPV |
DEEVESLHLR | | FLATPPNGNF | | ADAVFRFNAN | | ISYSGVLHAV | | TQDGLFSENK |
EKLINNAITA | | LLSQEGDVVA | | SNAELESQFQ | | AVRRLVASKA | | GFLAFTQLPK |
FRERLGVKVV | | KALKRSNNGI | | IHAAVDMLCA | | LMCPMHDDYD | | LRQEQLNKAS |
LLSSKKFLEN | | LLEKFNSHVD | | HGTGALVISS | | LLDFLTFALC | | APYSETTEGQ |
QFDMLLEMVA | | SNGRTLFKLF | | QHPSMAIIKG | | AGLVMKAIIE | | EGDKEIATKM |
QELALSEGAL | | PRHLHTAMFT | | ISSDQRMLTN | | RQLSRHLVGL | | WTADNATATN |
LLKRILPPGL | | LAYLESSDLV | | PEKDADRMHV | | RDNVKIAMDQ | | YGKFNKVPEW |
QRLAGKAAKE | | VEKFAKEKVD | | LVLMHWRDRM | | GIAQKENINQ | | KPVVLRKRRQ |
RIKIEANWDL | | FYYRFGQDHA | | RSNLIWNFKT | | REELKDTLES | | EMRAFNIDRE |
LGSANVISWN | | HHEFEVKYEC | | LAEEIKIGDY | | YLRLLLEEDE | | NEESGSIKRS |
YEFFNELYHR | | FLLTPKVNMK | | CLCLQALAIV | | YGRCHEEIGP | | FTDTRYIIGM |
LERCTDKLER | | DRLILFLNKL | | ILNKKNVKDL | | MDSNGIRILV | | DLLTLAHLHV |
SRATVPLQSN | | VIEAAPDMKR | | ESEKEWYFGN | | ADKERSGPYG | | FHEMQELWTK |
GMLNAKTRCW | | AQGMDGWRPL | | QSIPQLKWCL | | LASGQAVLNE | | TDLATLILNM |
LITMCGYFPS | | RDQDNAIIRP | | LPKVKRLLSD | | STCLPHIIQL | | LLTFDPILVE |
KVAILLYHIM | | QDNPQLPRLY | | LSGVFFFIMM | | YTGSNVLPVA | | RFLKYTHTKQ |
AFKSEETKGQ | | DIFQRSILGH | | ILPEAMVCYL | | ENYEPEKFSE | | IFLGEFDTPE |
AIWSSEMRRL | | MIEKIAAHLA | | DFTPRLQSNT | | RALYQYCPIP | | IINYPQLENE |
LFCNIYYLKQ | | LCDTLRFPDW | | PIKDPVKLLK | | DTLDAWKKEV | | EKKPPMMSID |
DAYEVLNLPQ | | GQGPHDESKI | | RKAYFRLAQK | | YHPDKNPEGR | | DMFEKVNKAY |
EFLCTKSAKI | | VDGPDPENII | | LILKTQSILF | | NRHKEDLQPY | | KYAGYPMLIR |
TITMETSDDL | | LFSKESPLLP | | AATELAFHTV | | NCSALNAEEL | | RRENGLEVLQ |
EAFSRCVAVL | | TRASKPSDMS | | VQVCGYISKC | | YSVAAQFEEC | | REKITEMPSI |
IKDLCRVLYF | | GKSIPRVAAL | | GVECVSSFAV | | DFWLQTHLFQ | | AGILWYLLGF |
LFNYDYTLEE | | SGIQKSEETN | | QQEVANSLAK | | LSVHALSRLG | | GYLAEEQATP |
ENPTIRKSLA | | GMLTPYVARK | | LAVASVTEIL | | KMLNSNTESP | | YLIWNNSTRA |
ELLEFLESQQ | | ENMIKKGDCD | | KTYGSEFVYS | | DHAKELIVGE | | IFVRVYNEVP |
TFQLEVPKAF | | AASLLDYIGS | | QAQYLHTFMA | | ITHAAKVESE | | QHGDRLPRVE |
MALEALRNVI | | KYNPGSESEC | | IGHFKLIFSL | | LRVHGAGQVQ | | QLALEVVNIV |
TSNQDCVNNI | | AESMVLSSLL | | ALLHSLPSSR | | QLVLETLYAL | | TSSTKIIKEA |
MAKGALIYLL | | DMFCNSTHPQ | | VRAQTAELFA | | KMTADKLIGP | | KVRITLMKFL |
PSVFMDAMRD | | NPEAAVHIFE | | GTHENPELIW | | NDNSRDKVST | | TVREMMLEHF |
KNQQDNPEAN | | WKLPEDFAVV | | FGEAEGELAV | | GGVFLRIFIA | | QPAWVLRKPR |
EFLIALLEKL | | TELLEKNNPH | | GETLETLTMA | | TVCLFSAQPQ | | LADQVPPLGH |
LPKVIQAMNH | | RNNAIPKSAI | | RVIHALSENE | | LCVRAMASLE | | TIGPLMNGMK |
KRADTVGLAC | | EAINRMFQKE | | QSELVAQALK | | ADLVPYLLKL | | LEGIGLENLD |
SPAATKAQIV | | KALKAMTRSL | | QYGEQVNEIL | | CRSSVWSAFK | | DQKHDLFISE |
SQTAGYLTGP | | GVAGYLTAGT | | STSVMSNLPP | | PVDHEAGDLG | | YQT |
Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у мембрані, ендосомах.
Література
- Girard M., Poupon V., Blondeau F., McPherson P.S. (2005). The DnaJ-domain protein RME-8 functions in endosomal trafficking. J. Biol. Chem. 280: 40135—40143. PMID 16179350 DOI:10.1074/jbc.M505036200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Girard M., McPherson P.S. (2008). RME-8 regulates trafficking of the epidermal growth factor receptor. FEBS Lett. 582: 961—966. PMID 18307993 DOI:10.1016/j.febslet.2008.02.042
- Freeman C.L., Hesketh G., Seaman M.N. (2014). RME-8 coordinates the activity of the WASH complex with the function of the retromer SNX dimer to control endosomal tubulation. J. Cell Sci. 127: 2053—2070. PMID 24643499 DOI:10.1242/jcs.144659
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30343 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O75165 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |