EBF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3LYR, 3MQI

Ідентифікатори

Символи

EBF1, COE1, EBF, O/E-1, OLF1, early B-cell factor 1, early B cell factor 1, EBF transcription factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 164343 MGI: 95275 HomoloGene: 7297 GeneCards: EBF1

Пов'язані генетичні захворювання

рак молочної залози, ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • C2H2 zinc finger domain binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1879


13591

Ensembl


ENSG00000164330


ENSMUSG00000057098

UniProt


Q9UH73


Q07802

RefSeq (мРНК)

NM_001290360 NM_024007 NM_182708 NM_001324101 NM_001324103
NM_001324106 NM_001324107 NM_001324108 NM_001324109 NM_001324111 NM_001364155 NM_001364156 NM_001364157 NM_001364158 NM_001364159


NM_001290709 NM_001290710 NM_001290711 NM_007897

RefSeq (білок)

NP_001277289 NP_001311030 NP_001311032 NP_001311035 NP_001311036
NP_001311037 NP_001311038 NP_001311040 NP_076870 NP_874367 NP_001351084 NP_001351085 NP_001351086 NP_001351087 NP_001351088

NP_001277638 NP_001277639 NP_001277640 NP_031923 NP_001349498
NP_001349500 NP_001349503 NP_001349504 NP_001349505 NP_001349506 NP_001349507 NP_001349508

Локус (UCSC)

Хр. 5: 158.7 – 159.1 Mb

Хр. 11: 44.62 – 45.01 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EBF1 (англ. Early B-cell factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 591 амінокислот, а молекулярна маса — 64 464^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFGIQESIQR	SGSSMKEEPL	GSGMNAVRTW	MQGAGVLDAN	TAAQSGVGLA
RAHFEKQPPS	NLRKSNFFHF	VLALYDRQGQ	PVEIERTAFV	GFVEKEKEAN
SEKTNNGIHY	RLQLLYSNGI	RTEQDFYVRL	IDSMTKQAIV	YEGQDKNPEM
CRVLLTHEIM	CSRCCDKKSC	GNRNETPSDP	VIIDRFFLKF	FLKCNQNCLK
NAGNPRDMRR	FQVVVSTTVN	VDGHVLAVSD	NMFVHNNSKH	GRRARRLDPS
EGTPSYLEHA	TPCIKAISPS	EGWTTGGATV	IIIGDNFFDG	LQVIFGTMLV
WSELITPHAI	RVQTPPRHIP	GVVEVTLSYK	SKQFCKGTPG	RFIYTALNEP
TIDYGFQRLQ	KVIPRHPGDP	ERLPKEVILK	RAADLVEALY	GMPHNNQEII
LKRAADIAEA	LYSVPRNHNQ	LPALANTSVH	AGMMGVNSFS	GQLAVNVSEA
SQATNQGFTR	NSSSVSPHGY	VPSTTPQQTN	YNSVTTSMNG	YGSAAMSNLG
GSPTFLNGSA	ANSPYAIVPS	SPTMASSTSL	PSNCSSSSGI	FSFSPANMVS
AVKQKSAFAP	VVRPQTSPPP	TCTSTNGNSL	QAISGMIVPP	M

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Gisler R., Jacobsen S.E., Sigvardsson M. (2000). Cloning of human early B-cell factor and identification of target genes suggest a conserved role in B-cell development in man and mouse. Blood. 96: 1457—1464. PMID 10942392

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з EBF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3126 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UH73 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2018. Процитовано 31 серпня 2017.