EHMT2

EHMT2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2O8J, 3DM1, 3K5K, 3RJW, 4NVQ, 5JJ0, 5JHN, 5JIN

Ідентифікатори
Символи EHMT2, BAT8, C6orf30, G9A, GAT8, KMT1C, NG36, euchromatic histone lysine methyltransferase 2
Зовнішні ІД OMIM: 604599 MGI: 2148922 HomoloGene: 48460 GeneCards: EHMT2
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity
transferase activity
histone methyltransferase activity (H3-K9 specific)
promoter-specific chromatin binding
zinc ion binding
C2H2 zinc finger domain binding
histone-lysine N-methyltransferase activity
зв'язування з іоном металу
histone methyltransferase activity (H3-K27 specific)
protein-lysine N-methyltransferase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
p53 binding

Клітинна компонента

нуклеоплазма
хромосома
клітинне ядро
nuclear speck

Біологічний процес

regulation of DNA replication
cellular response to starvation
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Метилювання ДНК
Метилювання
peptidyl-lysine dimethylation
histone lysine methylation
histone methylation
histone H3-K27 methylation
histone H3-K9 methylation
negative regulation of G0 to G1 transition
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
regulation of signal transduction by p53 class mediator

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10919
110147
Ensembl
ENSG00000238134
ENSG00000224143
ENSG00000206376
ENSG00000204371
ENSG00000227333
ENSG00000232045
ENSG00000236759
ENSMUSG00000013787
UniProt
Q96KQ7
Q9Z148
RefSeq (мРНК)
NM_001289413
NM_006709
NM_025256
NM_001318833
NM_001363689
NM_001395160
NM_001395161
NM_001395162
NM_001395163
NM_001395164
NM_001395165
NM_001286573
NM_001286575
NM_145830
NM_147151
RefSeq (білок)
NP_001276342
NP_001305762
NP_006700
NP_079532
NP_001350618
NP_001273502
NP_001273504
NP_665829
NP_671493
NP_001390796
NP_001390798
NP_001390799
Локус (UCSC) Хр. 6: 31.88 – 31.9 Mb Хр. 17: 35.12 – 35.13 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EHMT2 (англ. Euchromatic histone lysine methyltransferase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 210 амінокислот, а молекулярна маса — 132 370[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAAAGAAAAAAAEGEAPAEMGALLLEKETRGATERVHGSLGDTPRSEET
LPKATPDSLEPAGPSSPASVTVTVGDEGADTPVGATPLIGDESENLEGDG
DLRGGRILLGHATKSFPSSPSKGGSCPSRAKMSMTGAGKSPPSVQSLAMR
LLSMPGAQGAAAAGSEPPPATTSPEGQPKVHRARKTMSKPGNGQPPVPEK
RPPEIQHFRMSDDVHSLGKVTSDLAKRRKLNSGGGLSEELGSARRSGEVT
LTKGDPGSLEEWETVVGDDFSLYYDSYSVDERVDSDSKSEVEALTEQLSE
EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEDEESGNQSDRSGSSGRRKAKKKWRKDS
PWVKPSRKRRKREPPRAKEPRGVNGVGSSGPSEYMEVPLGSLELPSEGTL
SPNHAGVSNDTSSLETERGFEELPLCSCRMEAPKIDRISERAGHKCMATE
SVDGELSGCNAAILKRETMRPSSRVALMVLCETHRARMVKHHCCPGCGYF
CTAGTFLECHPDFRVAHRFHKACVSQLNGMVFCPHCGEDASEAQEVTIPR
GDGVTPPAGTAAPAPPPLSQDVPGRADTSQPSARMRGHGEPRRPPCDPLA
DTIDSSGPSLTLPNGGCLSAVGLPLGPGREALEKALVIQESERRKKLRFH
PRQLYLSVKQGELQKVILMLLDNLDPNFQSDQQSKRTPLHAAAQKGSVEI
CHVLLQAGANINAVDKQQRTPLMEAVVNNHLEVARYMVQRGGCVYSKEED
GSTCLHHAAKIGNLEMVSLLLSTGQVDVNAQDSGGWTPIIWAAEHKHIEV
IRMLLTRGADVTLTDNEENICLHWASFTGSAAIAEVLLNARCDLHAVNYH
GDTPLHIAARESYHDCVLLFLSRGANPELRNKEGDTAWDLTPERSDVWFA
LQLNRKLRLGVGNRAIRTEKIICRDVARGYENVPIPCVNGVDGEPCPEDY
KYISENCETSTMNIDRNITHLQHCTCVDDCSSSNCLCGQLSIRCWYDKDG
RLLQEFNKIEPPLIFECNQACSCWRNCKNRVVQSGIKVRLQLYRTAKMGW
GVRALQTIPQGTFICEYVGELISDAEADVREDDSYLFDLDNKDGEVYCID
ARYYGNISRFINHLCDPNIIPVRVFMLHQDLRFPRIAFFSSRDIRTGEEL
GFDYGDRFWDIKSKYFTCQCGSEKCKHSAEAIALEQSRLARLDPHPELLP
ELGSLPPVNT

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

  • Brown S.E., Campbell R.D., Sanderson C.M. (2001). Novel NG36/G9a gene products encoded within the human and mouse MHC class III regions. Mamm. Genome. 12: 916—924. PMID 11707778 DOI:10.1007/s00335-001-3029-3
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Milner C.M., Campbell R.D. (1993). The G9a gene in the human major histocompatibility complex encodes a novel protein containing ankyrin-like repeats. Biochem. J. 290: 811—818. PMID 8457211 DOI:10.1042/bj2900811
  • Tachibana M., Sugimoto K., Fukushima T., Shinkai Y. (2001). Set domain-containing protein, G9a, is a novel lysine-preferring mammalian histone methyltransferase with hyperactivity and specific selectivity to lysines 9 and 27 of histone H3. J. Biol. Chem. 276: 25309—25317. PMID 11316813 DOI:10.1074/jbc.M101914200
  • Ogawa H., Ishiguro K., Gaubatz S., Livingston D.M., Nakatani Y. (2002). A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells. Science. 296: 1132—1136. PMID 12004135 DOI:10.1126/science.1069861
  • Vassen L., Fiolka K., Moeroey T. (2006). Gfi1b alters histone methylation at target gene promoters and sites of gamma-satellite containing heterochromatin. EMBO J. 25: 2409—2419. PMID 16688220 DOI:10.1038/sj.emboj.7601124

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14129 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, Q96KQ7 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.