EIF5B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | EIF5B, IF2, eukaryotic translation initiation factor 5B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606086 MGI: 2441772 HomoloGene: 134613 GeneCards: EIF5B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GTP binding • hydrolase activity • translation initiation factor activity • RNA binding • GO:0006184 GTPase activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • клітинне ядро • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of translational initiation • translational initiation • Біосинтез білків |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 99.34 – 99.4 Mb | Хр. 1: 38.04 – 38.09 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF5B (англ. Eukaryotic translation initiation factor 5B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 220 амінокислот, а молекулярна маса — 138 827[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGKKQKNKSE | | DSTKDDIDLD | | ALAAEIEGAG | | AAKEQEPQKS | | KGKKKKEKKK |
QDFDEDDILK | | ELEELSLEAQ | | GIKADRETVA | | VKPTENNEEE | | FTSKDKKKKG |
QKGKKQSFDD | | NDSEELEDKD | | SKSKKTAKPK | | VEMYSGSDDD | | DDFNKLPKKA |
KGKAQKSNKK | | WDGSEEDEDN | | SKKIKERSRI | | NSSGESGDES | | DEFLQSRKGQ |
KKNQKNKPGP | | NIESGNEDDD | | ASFKIKTVAQ | | KKAEKKERER | | KKRDEEKAKL |
RKLKEKEELE | | TGKKDQSKQK | | ESQRKFEEET | | VKSKVTVDTG | | VIPASEEKAE |
TPTAAEDDNE | | GDKKKKDKKK | | KKGEKEEKEK | | EKKKGPSKAT | | VKAMQEALAK |
LKEEEERQKR | | EEEERIKRLE | | ELEAKRKEEE | | RLEQEKRERK | | KQKEKERKER |
LKKEGKLLTK | | SQREARARAE | | ATLKLLQAQG | | VEVPSKDSLP | | KKRPIYEDKK |
RKKIPQQLES | | KEVSESMELC | | AAVEVMEQGV | | PEKEETPPPV | | EPEEEEDTED |
AGLDDWEAMA | | SDEETEKVEG | | NKVHIEVKEN | | PEEEEEEEEE | | EEEDEESEEE |
EEEEGESEGS | | EGDEEDEKVS | | DEKDSGKTLD | | KKPSKEMSSD | | SEYDSDDDRT |
KEERAYDKAK | | RRIEKRRLEH | | SKNVNTEKLR | | APIICVLGHV | | DTGKTKILDK |
LRHTHVQDGE | | AGGITQQIGA | | TNVPLEAINE | | QTKMIKNFDR | | ENVRIPGMLI |
IDTPGHESFS | | NLRNRGSSLC | | DIAILVVDIM | | HGLEPQTIES | | INLLKSKKCP |
FIVALNKIDR | | LYDWKKSPDS | | DVAATLKKQK | | KNTKDEFEER | | AKAIIVEFAQ |
QGLNAALFYE | | NKDPRTFVSL | | VPTSAHTGDG | | MGSLIYLLVE | | LTQTMLSKRL |
AHCEELRAQV | | MEVKALPGMG | | TTIDVILING | | RLKEGDTIIV | | PGVEGPIVTQ |
IRGLLLPPPM | | KELRVKNQYE | | KHKEVEAAQG | | VKILGKDLEK | | TLAGLPLLVA |
YKEDEIPVLK | | DELIHELKQT | | LNAIKLEEKG | | VYVQASTLGS | | LEALLEFLKT |
SEVPYAGINI | | GPVHKKDVMK | | ASVMLEHDPQ | | YAVILAFDVR | | IERDAQEMAD |
SLGVRIFSAE | | IIYHLFDAFT | | KYRQDYKKQK | | QEEFKHIAVF | | PCKIKILPQY |
IFNSRDPIVM | | GVTVEAGQVK | | QGTPMCVPSK | | NFVDIGIVTS | | IEINHKQVDV |
AKKGQEVCVK | | IEPIPGESPK | | MFGRHFEATD | | ILVSKISRQS | | IDALKDWFRD |
EMQKSDWQLI | | VELKKVFEII |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, факторів ініціації. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Lee J.H., Choi S.K., Roll-Mecak A., Burley S.K., Dever T.E. (1999). Universal conservation in translation initiation revealed by human and archaeal homologs of bacterial translation initiation factor IF2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4342—4347. PMID 10200264 DOI:10.1073/pnas.96.8.4342
- Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30793 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O60841 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|