ELF1

Ідентифікатори

Символи

ELF1, E74 like ETS transcription factor 1, EFTUD1, RIA1

Зовнішні ІД

OMIM: 189973 MGI: 107180 HomoloGene: 7303 GeneCards: ELF1

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0032657 regulation of cytokine production • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of T cell receptor signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • regulation of cytokine-mediated signaling pathway • regulation of B cell receptor signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1997


13709

Ensembl


ENSG00000120690


ENSMUSG00000036461

UniProt


P32519


Q60775

RefSeq (мРНК)

NM_001145353 NM_172373 NM_001370329 NM_001370330 NM_001370331
NM_001370332


NM_001286411 NM_001286412 NM_007920

RefSeq (білок)

NP_001138825 NP_758961 NP_001357258 NP_001357259 NP_001357260
NP_001357261


NP_001273340 NP_001273341 NP_031946

Локус (UCSC)

Хр. 13: 40.93 – 41.06 Mb

Хр. 14: 79.72 – 79.82 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ELF1 (англ. E74 like ETS transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 67 498^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVVQQNDL	VFEFASNVME	DERQLGDPAI	FPAVIVEHVP	GADILNSYAG
LACVEEPNDM	ITESSLDVAE	EEIIDDDDDD	ITLTVEASCH	DGDETIETIE
AAEALLNMDS	PGPMLDEKRI	NNNIFSSPED	DMVVAPVTHV	SVTLDGIPEV
METQQVQEKY	ADSPGASSPE	QPKRKKGRKT	KPPRPDSPAT	TPNISVKKKN
KDGKGNTIYL	WEFLLALLQD	KATCPKYIKW	TQREKGIFKL	VDSKAVSRLW
GKHKNKPDMN	YETMGRALRY	YYQRGILAKV	EGQRLVYQFK	EMPKDLIYIN
DEDPSSSIES	SDPSLSSSAT	SNRNQTSRSR	VSSSPGVKGG	ATTVLKPGNS
KAAKPKDPVE	VAQPSEVLRT	VQPTQSPYPT	QLFRTVHVVQ	PVQAVPEGEA
ARTSTMQDET	LNSSVQSIRT	IQAPTQVPVV	VSPRNQQLHT	VTLQTVPLTT
VIASTDPSAG	TGSQKFILQA	IPSSQPMTVL	KENVMLQSQK	AGSPPSIVLG
PAQVQQVLTS	NVQTICNGTV	SVASSPSFSA	TAPVVTFSPR	SSQLVAHPPG
TVITSVIKTQ	ETKTLTQEVE	KKESEDHLKE	NTEKTEQQPQ	PYVMVVSSSN
GFTSQVAMKQ	NELLEPNSF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang C.Y., Petryniak B., Thompson C.B., Kaelin W.G. Jr., Leiden J.M. (1993). Regulation of the Ets-related transcription factor Elf-1 by binding to the retinoblastoma protein. Science. 260: 1330—1335. PMID 8493578 DOI:10.1126/science.8493578
Mao S., Frank R.C., Zhang J., Miyazaki Y., Nimer S.D. (1999). Functional and physical interactions between AML1 proteins and an ETS protein, MEF: implications for the pathogenesis of t(8;21)-positive leukemias. Mol. Cell. Biol. 19: 3635—3644. PMID 10207087 DOI:10.1128/MCB.19.5.3635
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ELF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3316 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P32519 (англ.) . Архів оригіналу за 21 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.