EMG1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EMG1, C2F, Grcc2f, NEP1, N1-specific pseudouridine methyltransferase, EMG1 N1-specific pseudouridine methyltransferase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611531 MGI: 1315195 HomoloGene: 4617 GeneCards: EMG1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Bowen-Conradi syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • rRNA (pseudouridine) methyltransferase activity • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • small-subunit processome • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерце |
---|
Біологічний процес | • rRNA base methylation • Метилювання • ribosomal small subunit biogenesis • ribosome biogenesis • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • rRNA processing • blastocyst development • nucleologenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 6: 124.68 – 124.69 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EMG1 (англ. EMG1, N1-specific pseudouridine methyltransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 244 амінокислот, а молекулярна маса — 26 720[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAPSDGFKP | | RERSGGEQAQ | | DWDALPPKRP | | RLGAGNKIGG | | RRLIVVLEGA |
SLETVKVGKT | | YELLNCDKHK | | SILLKNGRDP | | GEARPDITHQ | | SLLMLMDSPL |
NRAGLLQVYI | | HTQKNVLIEV | | NPQTRIPRTF | | DRFCGLMVQL | | LHKLSVRAAD |
GPQKLLKVIK | | NPVSDHFPVG | | CMKVGTSFSI | | PVVSDVRELV | | PSSDPIVFVV |
GAFAHGKVSV | | EYTEKMVSIS | | NYPLSAALTC | | AKLTTAFEEV | | WGVI |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесмнг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.
Література
- Ansari-Lari M.A., Shen Y., Muzny D.M., Lee W., Gibbs R.A. (1997). Large-scale sequencing in human chromosome 12p13: experimental and computational gene structure determination. Genome Res. 7: 268—280. PMID 9074930 DOI:10.1101/gr.7.3.268
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Eschrich D., Buchhaupt M., Koetter P., Entian K.-D. (2002). Nep1p (Emg1p), a novel protein conserved in eukaryotes and archaea, is involved in ribosome biogenesis. Curr. Genet. 40: 326—338. PMID 11935223 DOI:10.1007/s00294-001-0269-4
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з EMG1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16912 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q92979 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |