ERC1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ERC1, Cast2, ELKS, ERC-1, RAB6IP2, ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607127 MGI: 2151013 HomoloGene: 14229 GeneCards: ERC1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • leucine zipper domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • PDZ domain binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • presynaptic active zone • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • синапс • IkappaB kinase complex • presynaptic membrane • мембрана • центросома • ciliary basal body • центр організації мікротрубочок • цитоскелет |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • protein transport • retrograde transport, endosome to Golgi • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • I-kappaB phosphorylation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of apoptotic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001301248 NM_178039 NM_178040 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001288177 NP_829883 NP_829884 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 0.99 – 1.5 Mb | Хр. 6: 119.57 – 119.85 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ERC1 (англ. ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 116 амінокислот, а молекулярна маса — 128 086[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYGSARSVGK | | VEPSSQSPGR | | SPRLPRSPRL | | GHRRTNSTGG | | SSGSSVGGGS |
GKTLSMENIQ | | SLNAAYATSG | | PMYLSDHENV | | GSETPKSTMT | | LGRSGGRLPY |
GVRMTAMGSS | | PNIASSGVAS | | DTIAFGEHHL | | PPVSMASTVP | | HSLRQARDNT |
IMDLQTQLKE | | VLRENDLLRK | | DVEVKESKLS | | SSMNSIKTFW | | SPELKKERAL |
RKDEASKITI | | WKEQYRVVQE | | ENQHMQMTIQ | | ALQDELRIQR | | DLNQLFQQDS |
SSRTGEPCVA | | ELTEENFQRL | | HAEHERQAKE | | LFLLRKTLEE | | MELRIETQKQ |
TLNARDESIK | | KLLEMLQSKG | | LSAKATEEDH | | ERTRRLAEAE | | MHVHHLESLL |
EQKEKENSML | | REEMHRRFEN | | APDSAKTKAL | | QTVIEMKDSK | | ISSMERGLRD |
LEEEIQMLKS | | NGALSTEERE | | EEMKQMEVYR | | SHSKFMKNKV | | EQLKEELSSK |
EAQWEELKKK | | AAGLQAEIGQ | | VKQELSRKDT | | ELLALQTKLE | | TLTNQFSDSK |
QHIEVLKESL | | TAKEQRAAIL | | QTEVDALRLR | | LEEKETMLNK | | KTKQIQDMAE |
EKGTQAGEIH | | DLKDMLDVKE | | RKVNVLQKKI | | ENLQEQLRDK | | EKQMSSLKER |
VKSLQADTTN | | TDTALTTLEE | | ALAEKERTIE | | RLKEQRDRDE | | REKQEEIDNY |
KKDLKDLKEK | | VSLLQGDLSE | | KEASLLDLKE | | HASSLASSGL | | KKDSRLKTLE |
IALEQKKEEC | | LKMESQLKKA | | HEAALEARAS | | PEMSDRIQHL | | EREITRYKDE |
SSKAQAEVDR | | LLEILKEVEN | | EKNDKDKKIA | | ELERQVKDQN | | KKVANLKHKE |
QVEKKKSAQM | | LEEARRREDN | | LNDSSQQLQD | | SLRKKDDRIE | | ELEEALRESV |
QITAEREMVL | | AQEESARTNA | | EKQVEELLMA | | MEKVKQELES | | MKAKLSSTQQ |
SLAEKETHLT | | NLRAERRKHL | | EEVLEMKQEA | | LLAAISEKDA | | NIALLELSSS |
KKKTQEEVAA | | LKREKDRLVQ | | QLKQQTQNRM | | KLMADNYEDD | | HFKSSHSNQT |
NHKPSPDQII | | QPLLELDQNR | | SKLKLYIGHL | | TTLCHDRDPL | | ILRGLTPPAS |
YNLDDDQAAW | | ENELQKMTRG | | QLQDELEKGE | | RDNAELQEFA | | NAILQQIADH |
CPDILEQVVN | | ALEESS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.
Література
- Nakata T., Yokota T., Emi M., Minami S. (2002). Differential expression of multiple isoforms of the ELKS mRNAs involved in a papillary thyroid carcinoma. Genes Chromosomes Cancer. 35: 30—37. PMID 12203787 DOI:10.1002/gcc.10095
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ko J., Na M., Kim S., Lee J.R., Kim E. (2003). Interaction of the ERC family of RIM-binding proteins with the liprin-alpha family of multidomain proteins. J. Biol. Chem. 278: 42377—42385. PMID 12923177 DOI:10.1074/jbc.M307561200
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17072 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IUD2 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |