FBXO6

Ідентифікатори

Символи

FBXO6, FBG2, FBS2, FBX6, Fbx6b, F-box protein 6

Зовнішні ІД

OMIM: 605647 MGI: 1354743 HomoloGene: 9274 GeneCards: FBXO6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • carbohydrate binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • SCF ubiquitin ligase complex • endoplasmic reticulum quality control compartment • гіалоплазма
Біологічний процес	• cellular response to DNA damage stimulus • DNA damage checkpoint signaling • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • response to unfolded protein • GO:0100026 Репарація ДНК • Убіквітин-залежний протеоліз • протеоліз • ubiquitin-dependent ERAD pathway • glycoprotein catabolic process • protein polyubiquitination • посттрансляційна модифікація
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26270


50762

Ensembl


ENSG00000116663


ENSMUSG00000055401

UniProt


Q9NRD1


Q9QZN4

RefSeq (мРНК)


NM_018438


NM_001163704 NM_001163705 NM_001163706 NM_001163707 NM_015797

RefSeq (білок)


NP_060908


NP_001157176 NP_001157177 NP_001157178 NP_001157179 NP_056612

Локус (UCSC)

Хр. 1: 11.66 – 11.67 Mb

Хр. 4: 148.23 – 148.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FBXO6 (англ. F-box protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 33 933^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDAPHSKAAL	DSINELPENI	LLELFTHVPA	RQLLLNCRLV	CSLWRDLIDL
MTLWKRKCLR	EGFITKDWDQ	PVADWKIFYF	LRSLHRNLLR	NPCAEEDMFA
WQIDFNGGDR	WKVESLPGAH	GTDFPDPKVK	KYFVTSYEMC	LKSQLVDLVA
EGYWEELLDT	FRPDIVVKDW	FAARADCGCT	YQLKVQLASA	DYFVLASFEP
PPVTIQQWNN	ATWTEVSYTF	SDYPRGVRYI	LFQHGGRDTQ	YWAGWYGPRV
TNSSIVVSPK	MTRNQASSEA	QPGQKHGQEE	AAQSPYRAVV	QIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як відповідь на порушення конформації білку, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Ilyin G.P., Rialland M., Pigeon C., Guguen-Guillouzo C. (2000). cDNA cloning and expression analysis of new members of the mammalian F-box protein family. Genomics. 67: 40—47. PMID 10945468 DOI:10.1006/geno.2000.6211
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Glenn K.A., Nelson R.F., Wen H.M., Mallinger A.J., Paulson H.L. (2008). Diversity in tissue expression, substrate binding, and SCF complex formation for a lectin family of ubiquitin ligases. J. Biol. Chem. 283: 12717—12729. PMID 18203720 DOI:10.1074/jbc.M709508200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13585 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NRD1 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.