FCN1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2D39, 2JHH, 2JHI, 2JHK, 2JHL, 2JHM, 2WNP | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FCN1, FCNM, ficolin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601252 MGI: 1341158 HomoloGene: 1518 GeneCards: FCN1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • sialic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled receptor binding • зв'язування з іоном металу • carbohydrate binding • GO:0008329 pattern recognition receptor activity • serine-type endopeptidase activity • carbohydrate derivative binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • клітинна мембрана • колаген • extrinsic component of external side of plasma membrane • мембрана • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • complement activation, lectin pathway • complement activation • G protein-coupled receptor signaling pathway • recognition of apoptotic cell • protein localization to cell surface • cell surface pattern recognition receptor signaling pathway • процес імунної системи • протеоліз • вроджений імунітет • neutrophil degranulation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 134.9 – 134.92 Mb | Хр. 2: 27.97 – 27.97 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FCN1 (англ. Ficolin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 35 078[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MELSGATMAR | | GLAVLLVLFL | | HIKNLPAQAA | | DTCPEVKVVG | | LEGSDKLTIL |
RGCPGLPGAP | | GPKGEAGVIG | | ERGERGLPGA | | PGKAGPVGPK | | GDRGEKGMRG |
EKGDAGQSQS | | CATGPRNCKD | | LLDRGYFLSG | | WHTIYLPDCR | | PLTVLCDMDT |
DGGGWTVFQR | | RMDGSVDFYR | | DWAAYKQGFG | | SQLGEFWLGN | | DNIHALTAQG |
SSELRVDLVD | | FEGNHQFAKY | | KSFKVADEAE | | KYKLVLGAFV | | GGSAGNSLTG |
HNNNFFSTKD | | QDNDVSSSNC | | AEKFQGAWWY | | ADCHASNLNG | | LYLMGPHESY |
ANGINWSAAK | | GYKYSYKVSE | | MKVRPA |
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Lu J., Tay P.N., Kon O.L., Reid K.B. (1996). Human ficolin: cDNA cloning, demonstration of peripheral blood leucocytes as the major site of synthesis and assignment of the gene to chromosome 9. Biochem. J. 313: 473—478. PMID 8573080 DOI:10.1042/bj3130473
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
- Tanio M., Kondo S., Sugio S., Kohno T. (2007). Trivalent recognition unit of innate immunity system: crystal structure of trimeric human M-ficolin fibrinogen-like domain. J. Biol. Chem. 282: 3889—3895. PMID 17148457 DOI:10.1074/jbc.M608627200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3623 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O00602 (англ.) . Архів оригіналу за 1 жовтня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |