FGD4

Ідентифікатори

Символи

FGD4, CMT4H, FRABP, ZFYVE6, FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4

Зовнішні ІД

OMIM: 611104 MGI: 2183747 HomoloGene: 26727 GeneCards: FGD4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • small GTPase binding • actin binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • Філоподія • ruffle • цитоскелет • lamellipodium
Біологічний процес	• GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • filopodium assembly • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • positive regulation of apoptotic process • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • actin cytoskeleton organization • G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


121512


224014

Ensembl


ENSG00000139132


ENSMUSG00000022788

UniProt


Q96M96 Q49A55


Q91ZT5

RefSeq (мРНК)

NM_001304480 NM_001304481 NM_001304483 NM_001304484 NM_139241
NM_001330373 NM_001330374 NM_001370297 NM_001370298 NM_001384126 NM_001384127 NM_001384128 NM_001384130 NM_001384131 NM_001384132 NM_001385118


NM_001301817 NM_001301818 NM_139232 NM_139233 NM_139234

RefSeq (білок)

NP_001291409 NP_001291410 NP_001291412 NP_001291413 NP_001317302
NP_001317303 NP_640334 NP_001357226 NP_001357227 NP_001371055 NP_001371056 NP_001371057 NP_001371059 NP_001371060 NP_001371061 NP_001291412.1


NP_001288746 NP_001288747 NP_631978

Локус (UCSC)

Хр. 12: 32.4 – 32.65 Mb

Хр. 16: 16.23 – 16.42 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FGD4 (англ. FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 766 амінокислот, а молекулярна маса — 86 626^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEIKPASAS	CVSKEKPSKV	SDLISRFEGG	SSLSNYSDLK	KESAVNLNAP
RTPGRHGLTT	TPQQKLLSQH	LPQRQGNDTD	KTQGAQTCVA	NGVMAAQNQM
ECEEEKAATL	SSDTSIQASE	PLLDTHIVNG	ERDETATAPA	SPTTDSCDGN
ASDSSYRTPG	IGPVLPLEER	GAETETKVQE	RENGESPLEL	EQLDQHHEMK
ETNEQKLHKI	ANELLLTERA	YVNRLDLLDQ	VFYCKLLEEA	NRGSFPAEMV
NKIFSNISSI	NAFHSKFLLP	ELEKRMQEWE	TTPRIGDILQ	KLAPFLKMYG
EYVKGFDNAM	ELVKNMTERI	PQFKSVVEEI	QKQKICGSLT	LQHHMLEPVQ
RIPRYEMLLK	DYLRKLPPDS	LDWNDAKKSL	EIISTAASHS	NSAIRKMENL
KKLLEIYEML	GEEEDIVNPS	NELIKEGQIL	KLAARNTSAQ	ERYLFLFNNM
LLYCVPKFSL	VGSKFTVRTR	VGIDGMKIVE	TQNEEYPHTF	QVSGKERTLE
LQASSAQDKE	EWIKALQETI	DAFHQRHETF	RNAIAKDNDI	HSEVSTAELG
KRAPRWIRDN	EVTMCMKCKE	PFNALTRRRH	HCRACGYVVC	WKCSDYKAQL
EYDGGKLSKV	CKDCYQIISG	FTDSEEKKRK	GILEIESAEV	SGNSVVCSFL
QYMEKSKPWQ	KAWCVIPKQD	PLVLYMYGAP	QDVRAQATIP	LLGYVVDEMP
RSADLPHSFK	LTQSKSVHSF	AADSEELKQK	WLKVILLAVT	GETPGGPNEH
PATLDDHPEP	KKKSEC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках.

Література

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19125 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96M96 (англ.) . Архів оригіналу за 21 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.