FNBP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FNBP1, FBP17, formin binding protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606191 MGI: 109606 HomoloGene: 100983 GeneCards: FNBP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинна мембрана • clathrin-coated pit • лізосома • cell cortex • цитоскелет • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • ендоцитоз • membrane organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001038700 NM_001177648 NM_001177649 NM_001177650 NM_019406
| NM_001355105 NM_001355106 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001033789 NP_001171119 NP_001171120 NP_001171121 NP_062279
| NP_001342034 NP_001342035 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 129.89 – 130.04 Mb | Хр. 2: 30.92 – 31.03 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FNBP1 (англ. Formin binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 71 307[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSWGTELWDQ | | FDNLEKHTQW | | GIDILEKYIK | | FVKERTEIEL | | SYAKQLRNLS |
KKYQPKKNSK | | EEEEYKYTSC | | KAFISNLNEM | | NDYAGQHEVI | | SENMASQIIV |
DLARYVQELK | | QERKSNFHDG | | RKAQQHIETC | | WKQLESSKRR | | FERDCKEADR |
AQQYFEKMDA | | DINVTKADVE | | KARQQAQIRH | | QMAEDSKADY | | SSILQKFNHE |
QHEYYHTHIP | | NIFQKIQEME | | ERRIVRMGES | | MKTYAEVDRQ | | VIPIIGKCLD |
GIVKAAESID | | QKNDSQLVIE | | AYKSGFEPPG | | DIEFEDYTQP | | MKRTVSDNSL |
SNSRGEGKPD | | LKFGGKSKGK | | LWPFIKKNKL | | MSLLTSPHQP | | PPPPPASASP |
SAVPNGPQSP | | KQQKEPLSHR | | FNEFMTSKPK | | IHCFRSLKRG | | LSLKLGATPE |
DFSNLPPEQR | | RKKLQQKVDE | | LNKEIQKEMD | | QRDAITKMKD | | VYLKNPQMGD |
PASLDHKLAE | | VSQNIEKLRV | | ETQKFEAWLA | | EVEGRLPARS | | EQARRQSGLY |
DSQNPPTVNN | | CAQDRESPDG | | SYTEEQSQES | | EMKVLATDFD | | DEFDDEEPLP |
AIGTCKALYT | | FEGQNEGTIS | | VVEGETLYVI | | EEDKGDGWTR | | IRRNEDEEGY |
VPTSYVEVCL | | DKNAKDS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, цитоплазматичних везикулах, лізосомі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Richnau N., Aspenstroem P. (2001). Rich, a rho GTPase-activating protein domain-containing protein involved in signaling by Cdc42 and Rac1. J. Biol. Chem. 276: 35060—35070. PMID 11431473 DOI:10.1074/jbc.M103540200
- Fuchs U., Rehkamp G.F., Slany R., Follo M., Borkhardt A. (2003). The formin-binding protein 17, FBP17, binds via a TNKS binding motif to tankyrase, a protein involved in telomere maintenance. FEBS Lett. 554: 10—16. PMID 14596906 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01063-9
- Aspenstroem P., Richnau N., Johansson A.-S. (2006). The diaphanous-related formin DAAM1 collaborates with the Rho GTPases RhoA and Cdc42, CIP4 and Src in regulating cell morphogenesis and actin dynamics. Exp. Cell Res. 312: 2180—2194. PMID 16630611 DOI:10.1016/j.yexcr.2006.03.013
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17069 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96RU3 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |