GCC2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GCC2, GCC185, RANBP2L4, REN53, GRIP and coiled-coil domain containing 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612711 MGI: 1917547 HomoloGene: 45639 GeneCards: GCC2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • trans-Golgi network • комплекс Ґольджі • мембрана • гіалоплазма • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • Golgi to plasma membrane protein transport • protein transport • microtubule anchoring • protein targeting to lysosome • retrograde transport, endosome to Golgi • late endosome to Golgi transport • regulation of protein exit from endoplasmic reticulum • microtubule organizing center organization • recycling endosome to Golgi transport • Golgi ribbon formation • protein localization to Golgi apparatus • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 108.45 – 108.51 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GCC2 (англ. GRIP and coiled-coil domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 684 амінокислот, а молекулярна маса — 195 910[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEDLVQDGVA | | SPATPGTGKS | | KLETLPKEDL | | IKFAKKQMML | | IQKAKSRCTE |
LEKEIEELRS | | KPVTEGTGDI | | IKALTERLDA | | LLLEKAETEQ | | QCLSLKKENI |
KMKQEVEDSV | | TKMGDAHKEL | | EQSHINYVKE | | IENLKNELMA | | VRSKYSEDKA |
NLQKQLEEAM | | NTQLELSEQL | | KFQNNSEDNV | | KKLQEEIEKI | | RPGFEEQILY |
LQKQLDATTD | | EKKETVTQLQ | | NIIEANSQHY | | QKNINSLQEE | | LLQLKAIHQE |
EVKELMCQIE | | ASAKEHEAEI | | NKLNELKENL | | VKQCEASEKN | | IQKKYECELE |
NLRKATSNAN | | QDNQICSILL | | QENTFVEQVV | | NEKVKHLEDT | | LKELESQHSI |
LKDEVTYMNN | | LKLKLEMDAQ | | HIKDEFFHER | | EDLEFKINEL | | LLAKEEQGCV |
IEKLKSELAG | | LNKQFCYTVE | | QHNREVQSLK | | EQHQKEISEL | | NETFLSDSEK |
EKLTLMFEIQ | | GLKEQCENLQ | | QEKQEAILNY | | ESLREIMEIL | | QTELGESAGK |
ISQEFESMKQ | | QQASDVHELQ | | QKLRTAFTEK | | DALLETVNRL | | QGENEKLLSQ |
QELVPELENT | | IKNLQEKNGV | | YLLSLSQRDT | | MLKELEGKIN | | SLTEEKDDFI |
NKLKNSHEEM | | DNFHKKCERE | | ERLILELGKK | | VEQTIQYNSE | | LEQKVNELTG |
GLEETLKEKD | | QNDQKLEKLM | | VQMKVLSEDK | | EVLSAEVKSL | | YEENNKLSSE |
KKQLSRDLEV | | FLSQKEDVIL | | KEHITQLEKK | | LQLMVEEQDN | | LNKLLENEQV |
QKLFVKTQLY | | GFLKEMGSEV | | SEDSEEKDVV | | NVLQAVGESL | | AKINEEKCNL |
AFQRDEKVLE | | LEKEIKCLQE | | ESVVQCEELK | | SLLRDYEQEK | | VLLRKELEEI |
QSEKEALQSD | | LLEMKNANEK | | TRLENQNLLI | | QVEEVSQTCS | | KSEIHNEKEK |
CFIKEHENLK | | PLLEQKELRD | | RRAELILLKD | | SLAKSPSVKN | | DPLSSVKELE |
EKIENLEKEC | | KEKEEKINKI | | KLVAVKAKKE | | LDSSRKETQT | | VKEELESLRS |
EKDQLSASMR | | DLIQGAESYK | | NLLLEYEKQS | | EQLDVEKERA | | NNFEHRIEDL |
TRQLRNSTLQ | | CETINSDNED | | LLARIETLQS | | NAKLLEVQIL | | EVQRAKAMVD |
KELEAEKLQK | | EQKIKEHATT | | VNELEELQVQ | | LQKQKKQLQK | | TMQELELVKK |
DAQQTTLMNM | | EIADYERLMK | | ELNQKLTNKN | | NKIEDLEQEI | | KIQKQKQETL |
QEEITSLQSS | | VQQYEEKNTK | | IKQLLVKTKK | | ELADSKQAET | | DHLILQASLK |
GELEASQQQV | | EVYKIQLAEI | | TSEKHKIHEH | | LKTSAEQHQR | | TLSAYQQRVT |
ALQEECRAAK | | AEQATVTSEF | | ESYKVRVHNV | | LKQQKNKSMS | | QAETEGAKQE |
REHLEMLIDQ | | LKIKLQDSQN | | NLQINVSELQ | | TLQSEHDTLL | | ERHNKMLQET |
VSKEAELREK | | LCSIQSENMM | | MKSEHTQTVS | | QLTSQNEVLR | | NSFRDQVRHL |
QEEHRKTVET | | LQQQLSKMEA | | QLFQLKNEPT | | TRSPVSSQQS | | LKNLRERRNT |
DLPLLDMHTV | | TREEGEGMET | | TDTESVSSAS | | TYTQSLEQLL | | NSPETKLEPP |
LWHAEFTKEE | | LVQKLSSTTK | | SADHLNGLLR | | ETEATNAILM | | EQIKLLKSEI |
RRLERNQERE | | KSAANLEYLK | | NVLLQFIFLK | | PGSERERLLP | | VINTMLQLSP |
EEKGKLAAVA | | QGEEENASRS | | SGWASYLHSW | | SGLR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Luke M.R., Kjer-Nielsen L., Brown D.L., Stow J.L., Gleeson P.A. (2003). GRIP domain-mediated targeting of two new coiled-coil proteins, GCC88 and GCC185, to subcompartments of the trans-Golgi network. J. Biol. Chem. 278: 4216—4226. PMID 12446665 DOI:10.1074/jbc.M210387200
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Ganley I.G., Espinosa E., Pfeffer S.R. (2008). A syntaxin 10-SNARE complex distinguishes two distinct transport routes from endosomes to the trans-Golgi in human cells. J. Cell Biol. 180: 159—172. PMID 18195106 DOI:10.1083/jcb.200707136
- Houghton F.J., Chew P.L., Lodeho S., Goud B., Gleeson P.A. (2009). The localization of the Golgin GCC185 is independent of Rab6A/A' and Arl1. Cell. 138: 787—794. PMID 19703403 DOI:10.1016/j.cell.2009.05.048
- Burguete A.S., Fenn T.D., Brunger A.T., Pfeffer S.R. (2008). Rab and Arl GTPase family members cooperate in the localization of the golgin GCC185. Cell. 132: 286—298. PMID 18243103 DOI:10.1016/j.cell.2007.11.048
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIP and coiled-coil domain containing 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23218 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8IWJ2 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |