GDNF

GDNF
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2V5E, 3FUB, 4UX8

Ідентифікатори
Символи GDNF, ATF1, ATF2, HFB1-HSCR3, glial cell derived neurotrophic factor, ATF
Зовнішні ІД OMIM: 600837 HomoloGene: 433 GeneCards: GDNF
Пов'язані генетичні захворювання
феохромоцитома[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

protein homodimerization activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
growth factor activity
signaling receptor binding
chemoattractant activity involved in axon guidance

Клітинна компонента

extracellular region
внутрішньоклітинний
міжклітинний простір

Біологічний процес

перистальтика
ureteric bud development
regulation of dopamine uptake involved in synaptic transmission
peripheral nervous system development
sympathetic nervous system development
organ induction
adult locomotory behavior
positive regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis
regulation of stem cell differentiation
regulation of morphogenesis of a branching structure
mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis
negative regulation of apoptotic process
нейробіологія розвитку
positive regulation of monooxygenase activity
enteric nervous system development
mRNA stabilization
branching involved in ureteric bud morphogenesis
postganglionic parasympathetic fiber development
positive regulation of dopamine secretion
neural crest cell migration
postsynaptic membrane organization
positive regulation of cell population proliferation
positive regulation of cell differentiation
positive regulation of ureteric bud formation
ureteric bud formation
регуляція експресії генів
negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand
metanephros development
neuron projection development
GO:0072468 сигнальна трансдукція
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
MAPK cascade
axon guidance
GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
regulation of signaling receptor activity
dorsal spinal cord development
embryonic organ development
chemoattraction of axon
commissural neuron axon guidance
regulation of semaphorin-plexin signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2668
25453
Ensembl
ENSG00000168621
ENSRNOG00000012819
UniProt
P39905
Q07731
RefSeq (мРНК)
NM_000514
NM_001190468
NM_001190469
NM_001278098
NM_199231
NM_199234
NM_019139
RefSeq (білок)
NP_000505
NP_001177397
NP_001177398
NP_001265027
NP_954701
NP_062012
NP_001388709
Локус (UCSC) Хр. 5: 37.81 – 37.84 Mb н/д
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GDNF (англ. Glial cell derived neurotrophic factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 23 720[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKLWDVVAVCLVLLHTASAFPLPAGKRPPEAPAEDRSLGRRRAPFALSSD
SNMPEDYPDQFDDVMDFIQATIKRLKRSPDKQMAVLPRRERNRQAAAANP
ENSRGKGRRGQRGKNRGCVLTAIHLNVTDLGLGYETKEELIFRYCSGSCD
AAETTYDKILKNLSRNRRLVSDKVGQACCRPIAFDDDLSFLDDNLVYHIL
RKHSAKRCGCI

Кодований геном білок за функцією належить до факторів росту. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

  • Lin L.-F.H., Doherty D.H., Lile J.D., Bektesh S., Collins F. (1993). GDNF: a glial cell line-derived neurotrophic factor for midbrain dopaminergic neurons. Science. 260: 1130—1132. PMID 8493557 DOI:10.1126/science.8493557
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Baecker P.A., Lee W.H., Verity A.N., Eglen R.M., Johnson R.M. (1999). Characterization of a promoter for the human glial cell line-derived neurotrophic factor gene. Brain Res. Mol. Brain Res. 69: 209—222. PMID 10366742 DOI:10.1016/S0169-328X(99)00106-0
  • Parkash V., Goldman A. (2009). Comparison of GFL-GFRalpha complexes: further evidence relating GFL bend angle to RET signalling. Acta Crystallogr. F. 65: 551—558. PMID 19478429 DOI:10.1107/S1744309109017722
  • Ivanchuk S.M., Myers S.M., Eng C., Mulligan L.M. (1996). De novo mutation of GDNF, ligand for the RET/GDNFR-alpha receptor complex, in Hirschsprung disease. Hum. Mol. Genet. 5: 2023—2026. PMID 8968758 DOI:10.1093/hmg/5.12.2023
  • Angrist M., Bolk S., Halushka M., Lapchak P.A., Chakravarti A. (1996). Germline mutations in glial cell line-derived neurotrophic factor (GDNF) and RET in a Hirschsprung disease patient. Nat. Genet. 14: 341—344. PMID 8896568 DOI:10.1038/ng1196-341

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з GDNF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4232 (англ.) . Архів оригіналу за 23 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
  5. UniProt, P39905 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»