HCFC1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4GO6, 4N39, 4N3A, 4N3B, 4N3C

Ідентифікатори

Символи

HCFC1, CFF, HCF-1, HCF1, HFC1, MRX3, PPP1R89, VCAF, HCF, Host cell factor C1, XLID3, MAHCX

Зовнішні ІД

OMIM: 300019 MGI: 105942 HomoloGene: 3898 GeneCards: HCFC1

Пов'язані генетичні захворювання

methylmalonic acidemia with homocystinuria, type cblX^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific) • histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific) • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific) • cadherin binding • protein-macromolecule adaptor activity • sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • SAGA-type complex • Set1C/COMPASS complex • аксон • neuronal cell body • MLL1 complex • дендрит (нейробіологія) • histone acetyltransferase complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • release from viral latency • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • protein stabilization • mitochondrion organization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H4-K5 acetylation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of cell cycle • клітинний цикл • histone H4-K16 acetylation • GO:0022415 viral process • histone H4-K8 acetylation • GO:0106159 regulation of protein-containing complex assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • blastocyst hatching • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3054


15161

Ensembl


ENSG00000172534


ENSMUSG00000031386

UniProt


P51610


Q61191

RefSeq (мРНК)


NM_005334


NM_008224

RefSeq (білок)


NP_005325


NP_032250

Локус (UCSC)

Хр. X: 153.95 – 153.97 Mb

Хр. X: 72.99 – 73.01 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HCFC1 (англ. Host cell factor C1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 035 амінокислот, а молекулярна маса — 208 732^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASAVSPANL	PAVLLQPRWK	RVVGWSGPVP	RPRHGHRAVA	IKELIVVFGG
GNEGIVDELH	VYNTATNQWF	IPAVRGDIPP	GCAAYGFVCD	GTRLLVFGGM
VEYGKYSNDL	YELQASRWEW	KRLKAKTPKN	GPPPCPRLGH	SFSLVGNKCY
LFGGLANDSE	DPKNNIPRYL	NDLYILELRP	GSGVVAWDIP	ITYGVLPPPR
ESHTAVVYTE	KDNKKSKLVI	YGGMSGCRLG	DLWTLDIDTL	TWNKPSLSGV
APLPRSLHSA	TTIGNKMYVF	GGWVPLVMDD	VKVATHEKEW	KCTNTLACLN
LDTMAWETIL	MDTLEDNIPR	ARAGHCAVAI	NTRLYIWSGR	DGYRKAWNNQ
VCCKDLWYLE	TEKPPPPARV	QLVRANTNSL	EVSWGAVATA	DSYLLQLQKY
DIPATAATAT	SPTPNPVPSV	PANPPKSPAP	AAAAPAVQPL	TQVGITLLPQ
AAPAPPTTTT	IQVLPTVPGS	SISVPTAART	QGVPAVLKVT	GPQATTGTPL
VTMRPASQAG	KAPVTVTSLP	AGVRMVVPTQ	SAQGTVIGSS	PQMSGMAALA
AAAAATQKIP	PSSAPTVLSV	PAGTTIVKTM	AVTPGTTTLP	ATVKVASSPV
MVSNPATRML	KTAAAQVGTS	VSSATNTSTR	PIITVHKSGT	VTVAQQAQVV
TTVVGGVTKT	ITLVKSPISV	PGGSALISNL	GKVMSVVQTK	PVQTSAVTGQ
ASTGPVTQII	QTKGPLPAGT	ILKLVTSADG	KPTTIITTTQ	ASGAGTKPTI
LGISSVSPST	TKPGTTTIIK	TIPMSAIITQ	AGATGVTSSP	GIKSPITIIT
TKVMTSGTGA	PAKIITAVPK	IATGHGQQGV	TQVVLKGAPG	QPGTILRTVP
MGGVRLVTPV	TVSAVKPAVT	TLVVKGTTGV	TTLGTVTGTV	STSLAGAGGH
STSASLATPI	TTLGTIATLS	SQVINPTAIT	VSAAQTTLTA	AGGLTTPTIT
MQPVSQPTQV	TLITAPSGVE	AQPVHDLPVS	ILASPTTEQP	TATVTIADSG
QGDVQPGTVT	LVCSNPPCET	HETGTTNTAT	TTVVANLGGH	PQPTQVQFVC
DRQEAAASLV	TSTVGQQNGS	VVRVCSNPPC	ETHETGTTNT	ATTATSNMAG
QHGCSNPPCE	THETGTTNTA	TTAMSSVGAN	HQRDARRACA	AGTPAVIRIS
VATGALEAAQ	GSKSQCQTRQ	TSATSTTMTV	MATGAPCSAG	PLLGPSMARE
PGGRSPAFVQ	LAPLSSKVRL	SSPSIKDLPA	GRHSHAVSTA	AMTRSSVGAG
EPRMAPVCES	LQGGSPSTTV	TVTALEALLC	PSATVTQVCS	NPPCETHETG
TTNTATTSNA	GSAQRVCSNP	PCETHETGTT	HTATTATSNG	GTGQPEGGQQ
PPAGRPCETH	QTTSTGTTMS	VSVGALLPDA	TSSHRTVESG	LEVAAAPSVT
PQAGTALLAP	FPTQRVCSNP	PCETHETGTT	HTATTVTSNM	SSNQDPPPAA
SDQGEVESTQ	GDSVNITSSS	AITTTVSSTL	TRAVTTVTQS	TPVPGPSVPP
PEELQVSPGP	RQQLPPRQLL	QSASTALMGE	SAEVLSASQT	PELPAAVDLS
STGEPSSGQE	SAGSAVVATV	VVQPPPPTQS	EVDQLSLPQE	LMAEAQAGTT
TLMVTGLTPE	ELAVTAAAEA	AAQAAATEEA	QALAIQAVLQ	AAQQAVMGTG
EPMDTSEAAA	TVTQAELGHL	SAEGQEGQAT	TIPIVLTQQE	LAALVQQQQL
QEAQAQQQHH	HLPTEALAPA	DSLNDPAIES	NCLNELAGTV	PSTVALLPST
ATESLAPSNT	FVAPQPVVVA	SPAKLQAAAT	LTEVANGIES	LGVKPDLPPP
PSKAPMKKEN	QWFDVGVIKG	TNVMVTHYFL	PPDDAVPSDD	DLGTVPDYNQ
LKKQELQPGT	AYKFRVAGIN	ACGRGPFSEI	SAFKTCLPGF	PGAPCAIKIS
KSPDGAHLTW	EPPSVTSGKI	IEYSVYLAIQ	SSQAGGELKS	STPAQLAFMR
VYCGPSPSCL	VQSSSLSNAH	IDYTTKPAII	FRIAARNEKG	YGPATQVRWL
QETSKDSSGT	KPANKRPMSS	PEMKSAPKKS	KADGQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Wilson A.C., Lamarco K., Peterson M.G., Herr W. (1993). The VP16 accessory protein HCF is a family of polypeptides processed from a large precursor protein. Cell. 74: 115—125. PMID 8392914 DOI:10.1016/0092-8674(93)90299-6
Kristie T.M., Pomerantz J.L., Twomey T.C., Parent S.A., Sharp P.A. (1995). The cellular C1 factor of the herpes simplex virus enhancer complex is a family of polypeptides. J. Biol. Chem. 270: 4387—4394. PMID 7876203 DOI:10.1074/jbc.270.9.4387
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vogel J.L., Kristie T.M. (2000). Autocatalytic proteolysis of the transcription factor-coactivator C1 (HCF): a potential role for proteolytic regulation of coactivator function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 9425—9430. PMID 10920196 DOI:10.1073/pnas.160266697
Wilson A.C., Peterson M.G., Herr W. (1995). The HCF repeat is an unusual proteolytic cleavage signal. Genes Dev. 9: 2445—2458. PMID 7590226 DOI:10.1101/gad.9.20.2445
Lu R., Yang P., O'Hare P., Misra V. (1997). Luman, a new member of the CREB/ATF family, binds to herpes simplex virus VP16-associated host cellular factor. Mol. Cell. Biol. 17: 5117—5126. PMID 9271389 DOI:10.1128/MCB.17.9.5117

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HCFC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4839 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P51610 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.