HLA-DRB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1A6A, 1BX2, 1YMM, 2WBJ,%%s1AQD, 1DLH, 1FYT, 1HXY, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1KG0, 1KLG, 1KLU, 1LO5, 1PYW, 1R5I, 1SEB, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2IAN, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2XN9, 3L6F, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3S5L, 4AEN, 4AH2, 4C56, 4E41, 4FQX, 4GBX, 4I5B, 4OV5, 4X5W, 4X5X,%%s1D5M, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1J8H, 2SEB, 3O6F, 3T0E, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4Y19, 4Y1A

Ідентифікатори

Символи

HLA-DRB1, DRB1, DRw10, HLA-DR1B, HLA-DRB, SS1, major histocompatibility complex, class II, DR beta 1

Зовнішні ІД

OMIM: 142857 MGI: 95901 HomoloGene: 136635 GeneCards: HLA-DRB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding • MHC class II receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class II protein complex binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • late endosome membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • MHC class II protein complex • lysosomal membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • лізосома • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane • external side of plasma membrane • cell surface • екзосома
Біологічний процес	• antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • immunoglobulin production involved in immunoglobulin-mediated immune response • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь • negative regulation of interferon-gamma production • inflammatory response to antigenic stimulus • protein tetramerization • regulation of interleukin-4 production • negative regulation of T cell proliferation • T-helper 1 type immune response • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • T cell costimulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3123


14969

Ensembl

ENSG00000236884 ENSG00000206240 ENSG00000229074 ENSG00000196126 ENSG00000206306
ENSG00000228080


ENSMUSG00000060586

UniProt


P01911

P04231 P04230 P18468 P18469 O78196
н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001243965 NM_002124 NM_001359193 NM_001359194


NM_010382

RefSeq (білок)


NP_001230894 NP_002115 NP_001346122 NP_001346123 NP_002115.2


NP_034512

Локус (UCSC)

Хр. 6: 32.58 – 32.59 Mb

Хр. 17: 34.52 – 34.54 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HLA-DRB1 (англ. HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-15 beta chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 29 966^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVCLKLPGGS	CMTALTVTLM	VLSSPLALSG	DTRPRFLWQP	KRECHFFNGT
ERVRFLDRYF	YNQEESVRFD	SDVGEFRAVT	ELGRPDAEYW	NSQKDILEQA
RAAVDTYCRH	NYGVVESFTV	QRRVQPKVTV	YPSKTQPLQH	HNLLVCSVSG
FYPGSIEVRW	FLNGQEEKAG	MVSTGLIQNG	DWTFQTLVML	ETVPRSGEVY
TCQVEHPSVT	SPLTVEWRAR	SESAQSKMLS	GVGGFVLGLL	FLGAGLFIYF
RNQKGHSGLQ	PTGFLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Lock C.B., So A.K., Welsh K.I., Parkes J.D., Trowsdale J. (1988). MHC class II sequences of an HLA-DR2 narcoleptic. Immunogenetics. 27: 449—455. PMID 3259543 DOI:10.1007/BF00364432
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee B.S.M., Rust N.A., McMichael A.J., McDevitt H.O. (1987). HLA-DR2 subtypes form an additional supertypic family of DR beta alleles. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 4591—4595. PMID 2885840 DOI:10.1073/pnas.84.13.4591
Cresswell P. (1996). Invariant chain structure and MHC class II function. Cell. 84: 505—507. PMID 8598037 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81025-9
Villadangos J.A. (2001). Presentation of antigens by MHC class II molecules: getting the most out of them. Mol. Immunol. 38: 329—346. PMID 11684289 DOI:10.1016/S0161-5890(01)00069-4
Menendez-Benito V., Neefjes J. (2007). Autophagy in MHC class II presentation: sampling from within. Immunity. 26: 1—3. PMID 17241953 DOI:10.1016/j.immuni.2007.01.005

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4948 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P01911 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.