HMCN1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | HMCN1, ARMD1, FBLN6, FIBL-6, FIBL6, hemicentin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608548 MGI: 2685047 HomoloGene: 23741 GeneCards: HMCN1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • extracellular matrix structural constituent • signaling receptor activity • protein homodimerization activity • cell adhesion molecule binding |
---|
Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • базальна мембрана • міжклітинні контакти • cell cortex • екзосома • цитоплазма • Борозна розщеплення • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • відповідь на стимул • зір • клітинний цикл • поділ клітини • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • response to bacterium |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 185.73 – 186.19 Mb | Хр. 1: 150.44 – 150.87 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HMCN1 (англ. Hemicentin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 5 635 амінокислот, а молекулярна маса — 613 390[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MISWEVVHTV | | FLFALLYSSL | | AQDASPQSEI | | RAEEIPEGAS | | TLAFVFDVTG |
SMYDDLVQVI | | EGASKILETS | | LKRPKRPLFN | | FALVPFHDPE | | IGPVTITTDP |
KKFQYELREL | | YVQGGGDCPE | | MSIGAIKIAL | | EISLPGSFIY | | VFTDARSKDY |
RLTHEVLQLI | | QQKQSQVVFV | | LTGDCDDRTH | | IGYKVYEEIA | | STSSGQVFHL |
DKKQVNEVLK | | WVEEAVQASK | | VHLLSTDHLE | | QAVNTWRIPF | | DPSLKEVTVS |
LSGPSPMIEI | | RNPLGKLIKK | | GFGLHELLNI | | HNSAKVVNVK | | EPEAGMWTVK |
TSSSGRHSVR | | ITGLSTIDFR | | AGFSRKPTLD | | FKKTVSRPVQ | | GIPTYVLLNT |
SGISTPARID | | LLELLSISGS | | SLKTIPVKYY | | PHRKPYGIWN | | ISDFVPPNEA |
FFLKVTGYDK | | DDYLFQRVSS | | VSFSSIVPDA | | PKVTMPEKTP | | GYYLQPGQIP |
CSVDSLLPFT | | LSFVRNGVTL | | GVDQYLKESA | | SVNLDIAKVT | | LSDEGFYECI |
AVSSAGTGRA | | QTFFDVSEPP | | PVIQVPNNVT | | VTPGERAVLT | | CLIISAVDYN |
LTWQRNDRDV | | RLAEPARIRT | | LANLSLELKS | | VKFNDAGEYH | | CMVSSEGGSS |
AASVFLTVQE | | PPKVTVMPKN | | QSFTGGSEVS | | IMCSATGYPK | | PKIAWTVNDM |
FIVGSHRYRM | | TSDGTLFIKN | | AAPKDAGIYG | | CLASNSAGTD | | KQNSTLRYIE |
APKLMVVQSE | | LLVALGDITV | | MECKTSGIPP | | PQVKWFKGDL | | ELRPSTFLII |
DPLLGLLKIQ | | ETQDLDAGDY | | TCVAINEAGR | | ATGKITLDVG | | SPPVFIQEPA |
DVSMEIGSNV | | TLPCYVQGYP | | EPTIKWRRLD | | NMPIFSRPFS | | VSSISQLRTG |
ALFILNLWAS | | DKGTYICEAE | | NQFGKIQSET | | TVTVTGLVAP | | LIGISPSVAN |
VIEGQQLTLP | | CTLLAGNPIP | | ERRWIKNSAM | | LLQNPYITVR | | SDGSLHIERV |
QLQDGGEYTC | | VASNVAGTNN | | KTTSVVVHVL | | PTIQHGQQIL | | STIEGIPVTL |
PCKASGNPKP | | SVIWSKKGEL | | ISTSSAKFSA | | GADGSLYVVS | | PGGEESGEYV |
CTATNTAGYA | | KRKVQLTVYV | | RPRVFGDQRG | | LSQDKPVEIS | | VLAGEEVTLP |
CEVKSLPPPI | | ITWAKETQLI | | SPFSPRHTFL | | PSGSMKITET | | RTSDSGMYLC |
VATNIAGNVT | | QAVKLNVHVP | | PKIQRGPKHL | | KVQVGQRVDI | | PCNAQGTPLP |
VITWSKGGST | | MLVDGEHHVS | | NPDGTLSIDQ | | ATPSDAGIYT | | CVATNIAGTD |
ETEITLHVQE | | PPTVEDLEPP | | YNTTFQERVA | | NQRIEFPCPA | | KGTPKPTIKW |
LHNGRELTGR | | EPGISILEDG | | TLLVIASVTP | | YDNGEYICVA | | VNEAGTTERK |
YNLKVHVPPV | | IKDKEQVTNV | | SVLLNQLTNL | | FCEVEGTPSP | | IIMWYKDNVQ |
VTESSTIQTV | | NNGKILKLFR | | ATPEDAGRYS | | CKAINIAGTS | | QKYFNIDVLV |
PPTIIGTNFP | | NEVSVVLNRD | | VALECQVKGT | | PFPDIHWFKD | | GKPLFLGDPN |
VELLDRGQVL | | HLKNARRNDK | | GRYQCTVSNA | | AGKQAKDIKL | | TIYIPPSIKG |
GNVTTDISVL | | INSLIKLECE | | TRGLPMPAIT | | WYKDGQPIMS | | SSQALYIDKG |
QYLHIPRAQV | | SDSATYTCHV | | ANVAGTAEKS | | FHVDVYVPPM | | IEGNLATPLN |
KQVVIAHSLT | | LECKAAGNPS | | PILTWLKDGV | | PVKANDNIRI | | EAGGKKLEIM |
SAQEIDRGQY | | ICVATSVAGE | | KEIKYEVDVL | | VPPAIEGGDE | | TSYFIVMVNN |
LLELDCHVTG | | SPPPTIMWLK | | DGQLIDERDG | | FKILLNGRKL | | VIAQAQVSNT |
GLYRCMAANT | | AGDHKKEFEV | | TVHVPPTIKS | | SGLSERVVVK | | YKPVALQCIA |
NGIPNPSITW | | LKDDQPVNTA | | QGNLKIQSSG | | RVLQIAKTLL | | EDAGRYTCVA |
TNAAGETQQH | | IQLHVHEPPS | | LEDAGKMLNE | | TVLVSNPVQL | | ECKAAGNPVP |
VITWYKDNRL | | LSGSTSMTFL | | NRGQIIDIES | | AQISDAGIYK | | CVAINSAGAT |
ELFYSLQVHV | | APSISGSNNM | | VAVVVNNPVR | | LECEARGIPA | | PSLTWLKDGS |
PVSSFSNGLQ | | VLSGGRILAL | | TSAQISDTGR | | YTCVAVNAAG | | EKQRDIDLRV |
YVPPNIMGEE | | QNVSVLISQA | | VELLCQSDAI | | PPPTLTWLKD | | GHPLLKKPGL |
SISENRSVLK | | IEDAQVQDTG | | RYTCEATNVA | | GKTEKNYNVN | | IWVPPNIGGS |
DELTQLTVIE | | GNLISLLCES | | SGIPPPNLIW | | KKKGSPVLTD | | SMGRVRILSG |
GRQLQISIAE | | KSDAALYSCV | | ASNVAGTAKK | | EYNLQVYIRP | | TITNSGSHPT |
EIIVTRGKSI | | SLECEVQGIP | | PPTVTWMKDG | | HPLIKAKGVE | | ILDEGHILQL |
KNIHVSDTGR | | YVCVAVNVAG | | MTDKKYDLSV | | HAPPSIIGNH | | RSPENISVVE |
KNSVSLTCEA | | SGIPLPSITW | | FKDGWPVSLS | | NSVRILSGGR | | MLRLMQTTME |
DAGQYTCVVR | | NAAGEERKIF | | GLSVLVPPHI | | VGENTLEDVK | | VKEKQSVTLT |
CEVTGNPVPE | | ITWHKDGQPL | | QEDEAHHIIS | | GGRFLQITNV | | QVPHTGRYTC |
LASSPAGHKS | | RSFSLNVFVS | | PTIAGVGSDG | | NPEDVTVILN | | SPTSLVCEAY |
SYPPATITWF | | KDGTPLESNR | | NIRILPGGRT | | LQILNAQEDN | | AGRYSCVATN |
EAGEMIKHYE | | VKVYIPPIIN | | KGDLWGPGLS | | PKEVKIKVNN | | TLTLECEAYA |
IPSASLSWYK | | DGQPLKSDDH | | VNIAANGHTL | | QIKEAQISDT | | GRYTCVASNI |
AGEDELDFDV | | NIQVPPSFQK | | LWEIGNMLDT | | GRNGEAKDVI | | INNPISLYCE |
TNAAPPPTLT | | WYKDGHPLTS | | SDKVLILPGG | | RVLQIPRAKV | | EDAGRYTCVA |
VNEAGEDSLQ | | YDVRVLVPPI | | IKGANSDLPE | | EVTVLVNKSA | | LIECLSSGSP |
APRNSWQKDG | | QPLLEDDHHK | | FLSNGRILQI | | LNTQITDIGR | | YVCVAENTAG |
SAKKYFNLNV | | HVPPSVIGPK | | SENLTVVVNN | | FISLTCEVSG | | FPPPDLSWLK |
NEQPIKLNTN | | TLIVPGGRTL | | QIIRAKVSDG | | GEYTCIAINQ | | AGESKKKFSL |
TVYVPPSIKD | | HDSESLSVVN | | VREGTSVSLE | | CESNAVPPPV | | ITWYKNGRMI |
TESTHVEILA | | DGQMLHIKKA | | EVSDTGQYVC | | RAINVAGRDD | | KNFHLNVYVP |
PSIEGPEREV | | IVETISNPVT | | LTCDATGIPP | | PTIAWLKNHK | | RIENSDSLEV |
RILSGGSKLQ | | IARSQHSDSG | | NYTCIASNME | | GKAQKYYFLS | | IQVPPSVAGA |
EIPSDVSVLL | | GENVELVCNA | | NGIPTPLIQW | | LKDGKPIASG | | ETERIRVSAN |
GSTLNIYGAL | | TSDTGKYTCV | | ATNPAGEEDR | | IFNLNVYVTP | | TIRGNKDEAE |
KLMTLVDTSI | | NIECRATGTP | | PPQINWLKNG | | LPLPLSSHIR | | LLAAGQVIRI |
VRAQVSDVAV | | YTCVASNRAG | | VDNKHYNLQV | | FAPPNMDNSM | | GTEEITVLKG |
SSTSMACITD | | GTPAPSMAWL | | RDGQPLGLDA | | HLTVSTHGMV | | LQLLKAETED |
SGKYTCIASN | | EAGEVSKHFI | | LKVLEPPHIN | | GSEEHEEISV | | IVNNPLELTC |
IASGIPAPKM | | TWMKDGRPLP | | QTDQVQTLGG | | GEVLRISTAQ | | VEDTGRYTCL |
ASSPAGDDDK | | EYLVRVHVPP | | NIAGTDEPRD | | ITVLRNRQVT | | LECKSDAVPP |
PVITWLRNGE | | RLQATPRVRI | | LSGGRYLQIN | | NADLGDTANY | | TCVASNIAGK |
TTREFILTVN | | VPPNIKGGPQ | | SLVILLNKST | | VLECIAEGVP | | TPRITWRKDG |
AVLAGNHARY | | SILENGFLHI | | QSAHVTDTGR | | YLCMATNAAG | | TDRRRIDLQV |
HVPPSIAPGP | | TNMTVIVNVQ | | TTLACEATGI | | PKPSINWRKN | | GHLLNVDQNQ |
NSYRLLSSGS | | LVIISPSVDD | | TATYECTVTN | | GAGDDKRTVD | | LTVQVPPSIA |
DEPTDFLVTK | | HAPAVITCTA | | SGVPFPSIHW | | TKNGIRLLPR | | GDGYRILSSG |
AIEILATQLN | | HAGRYTCVAR | | NAAGSAHRHV | | TLHVHEPPVI | | QPQPSELHVI |
LNNPILLPCE | | ATGTPSPFIT | | WQKEGINVNT | | SGRNHAVLPS | | GGLQISRAVR |
EDAGTYMCVA | | QNPAGTALGK | | IKLNVQVPPV | | ISPHLKEYVI | | AVDKPITLSC |
EADGLPPPDI | | TWHKDGRAIV | | ESIRQRVLSS | | GSLQIAFVQP | | GDAGHYTCMA |
ANVAGSSSTS | | TKLTVHVPPR | | IRSTEGHYTV | | NENSQAILPC | | VADGIPTPAI |
NWKKDNVLLA | | NLLGKYTAEP | | YGELILENVV | | LEDSGFYTCV | | ANNAAGEDTH |
TVSLTVHVLP | | TFTELPGDVS | | LNKGEQLRLS | | CKATGIPLPK | | LTWTFNNNII |
PAHFDSVNGH | | SELVIERVSK | | EDSGTYVCTA | | ENSVGFVKAI | | GFVYVKEPPV |
FKGDYPSNWI | | EPLGGNAILN | | CEVKGDPTPT | | IQWNRKGVDI | | EISHRIRQLG |
NGSLAIYGTV | | NEDAGDYTCV | | ATNEAGVVER | | SMSLTLQSPP | | IITLEPVETV |
INAGGKIILN | | CQATGEPQPT | | ITWSRQGHSI | | SWDDRVNVLS | | NNSLYIADAQ |
KEDTSEFECV | | ARNLMGSVLV | | RVPVIVQVHG | | GFSQWSAWRA | | CSVTCGKGIQ |
KRSRLCNQPL | | PANGGKPCQG | | SDLEMRNCQN | | KPCPVDGSWS | | EWSLWEECTR |
SCGRGNQTRT | | RTCNNPSVQH | | GGRPCEGNAV | | EIIMCNIRPC | | PVHGAWSAWQ |
PWGTCSESCG | | KGTQTRARLC | | NNPPPAFGGS | | YCDGAETQMQ | | VCNERNCPIH |
GKWATWASWS | | ACSVSCGGGA | | RQRTRGCSDP | | VPQYGGRKCE | | GSDVQSDFCN |
SDPCPTHGNW | | SPWSGWGTCS | | RTCNGGQMRR | | YRTCDNPPPS | | NGGRACGGPD |
SQIQRCNTDM | | CPVDGSWGSW | | HSWSQCSASC | | GGGEKTRKRL | | CDHPVPVKGG |
RPCPGDTTQV | | TRCNVQACPG | | GPQRARGSVI | | GNINDVEFGI | | AFLNATITDS |
PNSDTRIIRA | | KITNVPRSLG | | SAMRKIVSIL | | NPIYWTTAKE | | IGEAVNGFTL |
TNAVFKRETQ | | VEFATGEILQ | | MSHIARGLDS | | DGSLLLDIVV | | SGYVLQLQSP |
AEVTVKDYTE | | DYIQTGPGQL | | YAYSTRLFTI | | DGISIPYTWN | | HTVFYDQAQG |
RMPFLVETLH | | ASSVESDYNQ | | IEETLGFKIH | | ASISKGDRSN | | QCPSGFTLDS |
VGPFCADEDE | | CAAGNPCSHS | | CHNAMGTYYC | | SCPKGLTIAA | | DGRTCQDIDE |
CALGRHTCHA | | GQDCDNTIGS | | YRCVVRCGSG | | FRRTSDGLSC | | QDINECQESS |
PCHQRCFNAI | | GSFHCGCEPG | | YQLKGRKCMD | | VNECRQNVCR | | PDQHCKNTRG |
GYKCIDLCPN | | GMTKAENGTC | | IDIDECKDGT | | HQCRYNQICE | | NTRGSYRCVC |
PRGYRSQGVG | | RPCMDINECE | | QVPKPCAHQC | | SNTPGSFKCI | | CPPGQHLLGD |
GKSCAGLERL | | PNYGTQYSSY | | NLARFSPVRN | | NYQPQQHYRQ | | YSHLYSSYSE |
YRNSRTSLSR | | TRRTIRKTCP | | EGSEASHDTC | | VDIDECENTD | | ACQHECKNTF |
GSYQCICPPG | | YQLTHNGKTC | | QDIDECLEQN | | VHCGPNRMCF | | NMRGSYQCID |
TPCPPNYQRD | | PVSGFCLKNC | | PPNDLECALS | | PYALEYKLVS | | LPFGIATNQD |
LIRLVAYTQD | | GVMHPRTTFL | | MVDEEQTVPF | | ALRDENLKGV | | VYTTRPLREA |
ETYRMRVRAS | | SYSANGTIEY | | QTTFIVYIAV | | SAYPY |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19194 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q96RW7 (англ.) . Архів оригіналу за 25 листопада 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |