HMCN1

HMCN1
Ідентифікатори
Символи HMCN1, ARMD1, FBLN6, FIBL-6, FIBL6, hemicentin 1
Зовнішні ІД OMIM: 608548 MGI: 2685047 HomoloGene: 23741 GeneCards: HMCN1
Онтологія гена
Молекулярна функція

calcium ion binding
extracellular matrix structural constituent
signaling receptor activity
protein homodimerization activity
cell adhesion molecule binding

Клітинна компонента

GO:0005578 Позаклітинна матриця
extracellular region
базальна мембрана
міжклітинні контакти
cell cortex
екзосома
цитоплазма
Борозна розщеплення
collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

відповідь на стимул
зір
клітинний цикл
поділ клітини
homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
response to bacterium

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
83872
545370
Ensembl
ENSG00000143341
ENSMUSG00000066842
UniProt
Q96RW7
D3YXG0
RefSeq (мРНК)
NM_031935
NM_001024720
RefSeq (білок)
NP_114141
NP_001019891
Локус (UCSC) Хр. 1: 185.73 – 186.19 Mb Хр. 1: 150.44 – 150.87 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HMCN1 (англ. Hemicentin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 5 635 амінокислот, а молекулярна маса — 613 390[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MISWEVVHTVFLFALLYSSLAQDASPQSEIRAEEIPEGASTLAFVFDVTG
SMYDDLVQVIEGASKILETSLKRPKRPLFNFALVPFHDPEIGPVTITTDP
KKFQYELRELYVQGGGDCPEMSIGAIKIALEISLPGSFIYVFTDARSKDY
RLTHEVLQLIQQKQSQVVFVLTGDCDDRTHIGYKVYEEIASTSSGQVFHL
DKKQVNEVLKWVEEAVQASKVHLLSTDHLEQAVNTWRIPFDPSLKEVTVS
LSGPSPMIEIRNPLGKLIKKGFGLHELLNIHNSAKVVNVKEPEAGMWTVK
TSSSGRHSVRITGLSTIDFRAGFSRKPTLDFKKTVSRPVQGIPTYVLLNT
SGISTPARIDLLELLSISGSSLKTIPVKYYPHRKPYGIWNISDFVPPNEA
FFLKVTGYDKDDYLFQRVSSVSFSSIVPDAPKVTMPEKTPGYYLQPGQIP
CSVDSLLPFTLSFVRNGVTLGVDQYLKESASVNLDIAKVTLSDEGFYECI
AVSSAGTGRAQTFFDVSEPPPVIQVPNNVTVTPGERAVLTCLIISAVDYN
LTWQRNDRDVRLAEPARIRTLANLSLELKSVKFNDAGEYHCMVSSEGGSS
AASVFLTVQEPPKVTVMPKNQSFTGGSEVSIMCSATGYPKPKIAWTVNDM
FIVGSHRYRMTSDGTLFIKNAAPKDAGIYGCLASNSAGTDKQNSTLRYIE
APKLMVVQSELLVALGDITVMECKTSGIPPPQVKWFKGDLELRPSTFLII
DPLLGLLKIQETQDLDAGDYTCVAINEAGRATGKITLDVGSPPVFIQEPA
DVSMEIGSNVTLPCYVQGYPEPTIKWRRLDNMPIFSRPFSVSSISQLRTG
ALFILNLWASDKGTYICEAENQFGKIQSETTVTVTGLVAPLIGISPSVAN
VIEGQQLTLPCTLLAGNPIPERRWIKNSAMLLQNPYITVRSDGSLHIERV
QLQDGGEYTCVASNVAGTNNKTTSVVVHVLPTIQHGQQILSTIEGIPVTL
PCKASGNPKPSVIWSKKGELISTSSAKFSAGADGSLYVVSPGGEESGEYV
CTATNTAGYAKRKVQLTVYVRPRVFGDQRGLSQDKPVEISVLAGEEVTLP
CEVKSLPPPIITWAKETQLISPFSPRHTFLPSGSMKITETRTSDSGMYLC
VATNIAGNVTQAVKLNVHVPPKIQRGPKHLKVQVGQRVDIPCNAQGTPLP
VITWSKGGSTMLVDGEHHVSNPDGTLSIDQATPSDAGIYTCVATNIAGTD
ETEITLHVQEPPTVEDLEPPYNTTFQERVANQRIEFPCPAKGTPKPTIKW
LHNGRELTGREPGISILEDGTLLVIASVTPYDNGEYICVAVNEAGTTERK
YNLKVHVPPVIKDKEQVTNVSVLLNQLTNLFCEVEGTPSPIIMWYKDNVQ
VTESSTIQTVNNGKILKLFRATPEDAGRYSCKAINIAGTSQKYFNIDVLV
PPTIIGTNFPNEVSVVLNRDVALECQVKGTPFPDIHWFKDGKPLFLGDPN
VELLDRGQVLHLKNARRNDKGRYQCTVSNAAGKQAKDIKLTIYIPPSIKG
GNVTTDISVLINSLIKLECETRGLPMPAITWYKDGQPIMSSSQALYIDKG
QYLHIPRAQVSDSATYTCHVANVAGTAEKSFHVDVYVPPMIEGNLATPLN
KQVVIAHSLTLECKAAGNPSPILTWLKDGVPVKANDNIRIEAGGKKLEIM
SAQEIDRGQYICVATSVAGEKEIKYEVDVLVPPAIEGGDETSYFIVMVNN
LLELDCHVTGSPPPTIMWLKDGQLIDERDGFKILLNGRKLVIAQAQVSNT
GLYRCMAANTAGDHKKEFEVTVHVPPTIKSSGLSERVVVKYKPVALQCIA
NGIPNPSITWLKDDQPVNTAQGNLKIQSSGRVLQIAKTLLEDAGRYTCVA
TNAAGETQQHIQLHVHEPPSLEDAGKMLNETVLVSNPVQLECKAAGNPVP
VITWYKDNRLLSGSTSMTFLNRGQIIDIESAQISDAGIYKCVAINSAGAT
ELFYSLQVHVAPSISGSNNMVAVVVNNPVRLECEARGIPAPSLTWLKDGS
PVSSFSNGLQVLSGGRILALTSAQISDTGRYTCVAVNAAGEKQRDIDLRV
YVPPNIMGEEQNVSVLISQAVELLCQSDAIPPPTLTWLKDGHPLLKKPGL
SISENRSVLKIEDAQVQDTGRYTCEATNVAGKTEKNYNVNIWVPPNIGGS
DELTQLTVIEGNLISLLCESSGIPPPNLIWKKKGSPVLTDSMGRVRILSG
GRQLQISIAEKSDAALYSCVASNVAGTAKKEYNLQVYIRPTITNSGSHPT
EIIVTRGKSISLECEVQGIPPPTVTWMKDGHPLIKAKGVEILDEGHILQL
KNIHVSDTGRYVCVAVNVAGMTDKKYDLSVHAPPSIIGNHRSPENISVVE
KNSVSLTCEASGIPLPSITWFKDGWPVSLSNSVRILSGGRMLRLMQTTME
DAGQYTCVVRNAAGEERKIFGLSVLVPPHIVGENTLEDVKVKEKQSVTLT
CEVTGNPVPEITWHKDGQPLQEDEAHHIISGGRFLQITNVQVPHTGRYTC
LASSPAGHKSRSFSLNVFVSPTIAGVGSDGNPEDVTVILNSPTSLVCEAY
SYPPATITWFKDGTPLESNRNIRILPGGRTLQILNAQEDNAGRYSCVATN
EAGEMIKHYEVKVYIPPIINKGDLWGPGLSPKEVKIKVNNTLTLECEAYA
IPSASLSWYKDGQPLKSDDHVNIAANGHTLQIKEAQISDTGRYTCVASNI
AGEDELDFDVNIQVPPSFQKLWEIGNMLDTGRNGEAKDVIINNPISLYCE
TNAAPPPTLTWYKDGHPLTSSDKVLILPGGRVLQIPRAKVEDAGRYTCVA
VNEAGEDSLQYDVRVLVPPIIKGANSDLPEEVTVLVNKSALIECLSSGSP
APRNSWQKDGQPLLEDDHHKFLSNGRILQILNTQITDIGRYVCVAENTAG
SAKKYFNLNVHVPPSVIGPKSENLTVVVNNFISLTCEVSGFPPPDLSWLK
NEQPIKLNTNTLIVPGGRTLQIIRAKVSDGGEYTCIAINQAGESKKKFSL
TVYVPPSIKDHDSESLSVVNVREGTSVSLECESNAVPPPVITWYKNGRMI
TESTHVEILADGQMLHIKKAEVSDTGQYVCRAINVAGRDDKNFHLNVYVP
PSIEGPEREVIVETISNPVTLTCDATGIPPPTIAWLKNHKRIENSDSLEV
RILSGGSKLQIARSQHSDSGNYTCIASNMEGKAQKYYFLSIQVPPSVAGA
EIPSDVSVLLGENVELVCNANGIPTPLIQWLKDGKPIASGETERIRVSAN
GSTLNIYGALTSDTGKYTCVATNPAGEEDRIFNLNVYVTPTIRGNKDEAE
KLMTLVDTSINIECRATGTPPPQINWLKNGLPLPLSSHIRLLAAGQVIRI
VRAQVSDVAVYTCVASNRAGVDNKHYNLQVFAPPNMDNSMGTEEITVLKG
SSTSMACITDGTPAPSMAWLRDGQPLGLDAHLTVSTHGMVLQLLKAETED
SGKYTCIASNEAGEVSKHFILKVLEPPHINGSEEHEEISVIVNNPLELTC
IASGIPAPKMTWMKDGRPLPQTDQVQTLGGGEVLRISTAQVEDTGRYTCL
ASSPAGDDDKEYLVRVHVPPNIAGTDEPRDITVLRNRQVTLECKSDAVPP
PVITWLRNGERLQATPRVRILSGGRYLQINNADLGDTANYTCVASNIAGK
TTREFILTVNVPPNIKGGPQSLVILLNKSTVLECIAEGVPTPRITWRKDG
AVLAGNHARYSILENGFLHIQSAHVTDTGRYLCMATNAAGTDRRRIDLQV
HVPPSIAPGPTNMTVIVNVQTTLACEATGIPKPSINWRKNGHLLNVDQNQ
NSYRLLSSGSLVIISPSVDDTATYECTVTNGAGDDKRTVDLTVQVPPSIA
DEPTDFLVTKHAPAVITCTASGVPFPSIHWTKNGIRLLPRGDGYRILSSG
AIEILATQLNHAGRYTCVARNAAGSAHRHVTLHVHEPPVIQPQPSELHVI
LNNPILLPCEATGTPSPFITWQKEGINVNTSGRNHAVLPSGGLQISRAVR
EDAGTYMCVAQNPAGTALGKIKLNVQVPPVISPHLKEYVIAVDKPITLSC
EADGLPPPDITWHKDGRAIVESIRQRVLSSGSLQIAFVQPGDAGHYTCMA
ANVAGSSSTSTKLTVHVPPRIRSTEGHYTVNENSQAILPCVADGIPTPAI
NWKKDNVLLANLLGKYTAEPYGELILENVVLEDSGFYTCVANNAAGEDTH
TVSLTVHVLPTFTELPGDVSLNKGEQLRLSCKATGIPLPKLTWTFNNNII
PAHFDSVNGHSELVIERVSKEDSGTYVCTAENSVGFVKAIGFVYVKEPPV
FKGDYPSNWIEPLGGNAILNCEVKGDPTPTIQWNRKGVDIEISHRIRQLG
NGSLAIYGTVNEDAGDYTCVATNEAGVVERSMSLTLQSPPIITLEPVETV
INAGGKIILNCQATGEPQPTITWSRQGHSISWDDRVNVLSNNSLYIADAQ
KEDTSEFECVARNLMGSVLVRVPVIVQVHGGFSQWSAWRACSVTCGKGIQ
KRSRLCNQPLPANGGKPCQGSDLEMRNCQNKPCPVDGSWSEWSLWEECTR
SCGRGNQTRTRTCNNPSVQHGGRPCEGNAVEIIMCNIRPCPVHGAWSAWQ
PWGTCSESCGKGTQTRARLCNNPPPAFGGSYCDGAETQMQVCNERNCPIH
GKWATWASWSACSVSCGGGARQRTRGCSDPVPQYGGRKCEGSDVQSDFCN
SDPCPTHGNWSPWSGWGTCSRTCNGGQMRRYRTCDNPPPSNGGRACGGPD
SQIQRCNTDMCPVDGSWGSWHSWSQCSASCGGGEKTRKRLCDHPVPVKGG
RPCPGDTTQVTRCNVQACPGGPQRARGSVIGNINDVEFGIAFLNATITDS
PNSDTRIIRAKITNVPRSLGSAMRKIVSILNPIYWTTAKEIGEAVNGFTL
TNAVFKRETQVEFATGEILQMSHIARGLDSDGSLLLDIVVSGYVLQLQSP
AEVTVKDYTEDYIQTGPGQLYAYSTRLFTIDGISIPYTWNHTVFYDQAQG
RMPFLVETLHASSVESDYNQIEETLGFKIHASISKGDRSNQCPSGFTLDS
VGPFCADEDECAAGNPCSHSCHNAMGTYYCSCPKGLTIAADGRTCQDIDE
CALGRHTCHAGQDCDNTIGSYRCVVRCGSGFRRTSDGLSCQDINECQESS
PCHQRCFNAIGSFHCGCEPGYQLKGRKCMDVNECRQNVCRPDQHCKNTRG
GYKCIDLCPNGMTKAENGTCIDIDECKDGTHQCRYNQICENTRGSYRCVC
PRGYRSQGVGRPCMDINECEQVPKPCAHQCSNTPGSFKCICPPGQHLLGD
GKSCAGLERLPNYGTQYSSYNLARFSPVRNNYQPQQHYRQYSHLYSSYSE
YRNSRTSLSRTRRTIRKTCPEGSEASHDTCVDIDECENTDACQHECKNTF
GSYQCICPPGYQLTHNGKTCQDIDECLEQNVHCGPNRMCFNMRGSYQCID
TPCPPNYQRDPVSGFCLKNCPPNDLECALSPYALEYKLVSLPFGIATNQD
LIRLVAYTQDGVMHPRTTFLMVDEEQTVPFALRDENLKGVVYTTRPLREA
ETYRMRVRASSYSANGTIEYQTTFIVYIAVSAYPY

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19194 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q96RW7 (англ.) . Архів оригіналу за 25 листопада 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»