HNRNPL |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3R27, 3TO8 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HNRNPL, HNRPL, hnRNP-L, P/OKcl.14, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603083 MGI: 104816 HomoloGene: 1174 GeneCards: HNRNPL |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • pre-mRNA intronic binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • mRNA CDS binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ribonucleoprotein granule • екзосома • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • Пронуклеус • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • RNA metabolic process • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • циркадний ритм • cellular response to amino acid starvation • positive regulation of translation • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • response to peptide • positive regulation of mRNA binding |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000104824 ENSG00000282947 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_796275 NP_001389864 NP_001389865 NP_001389866 NP_001389867
| NP_001389868 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 38.84 – 38.85 Mb | Хр. 7: 28.51 – 28.52 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HNRNPL (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 589 амінокислот, а молекулярна маса — 64 133[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSRRLLPRAE | | KRRRRLEQRQ | | QPDEQRRRSG | | AMVKMAAAGG | | GGGGGRYYGG |
GSEGGRAPKR | | LKTDNAGDQH | | GGGGGGGGGA | | GAAGGGGGGE | | NYDDPHKTPA |
SPVVHIRGLI | | DGVVEADLVE | | ALQEFGPISY | | VVVMPKKRQA | | LVEFEDVLGA |
CNAVNYAADN | | QIYIAGHPAF | | VNYSTSQKIS | | RPGDSDDSRS | | VNSVLLFTIL |
NPIYSITTDV | | LYTICNPCGP | | VQRIVIFRKN | | GVQAMVEFDS | | VQSAQRAKAS |
LNGADIYSGC | | CTLKIEYAKP | | TRLNVFKNDQ | | DTWDYTNPNL | | SGQGDPGSNP |
NKRQRQPPLL | | GDHPAEYGGP | | HGGYHSHYHD | | EGYGPPPPHY | | EGRRMGPPVG |
GHRRGPSRYG | | PQYGHPPPPP | | PPPEYGPHAD | | SPVLMVYGLD | | QSKMNCDRVF |
NVFCLYGNVE | | KVKFMKSKPG | | AAMVEMADGY | | AVDRAITHLN | | NNFMFGQKLN |
VCVSKQPAIM | | PGQSYGLEDG | | SCSYKDFSES | | RNNRFSTPEQ | | AAKNRIQHPS |
NVLHFFNAPL | | EVTEENFFEI | | CDELGVKRPS | | SVKVFSGKSE | | RSSSGLLEWE |
SKSDALETLG | | FLNHYQMKNP | | NGPYPYTLKL | | CFSTAQHAS |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Pinol-Roma S., Swanson M.S., Gall J.G., Dreyfuss G. (1989). A novel heterogeneous nuclear RNP protein with a unique distribution on nascent transcripts. J. Cell Biol. 109: 2575—2587. PMID 2687284 DOI:10.1083/jcb.109.6.2575
- Kuninger D.T., Izumi T., Papaconstantinou J., Mitra S. (2002). Human AP-endonuclease 1 and hnRNP-L interact with a nCaRE-like repressor element in the AP-endonuclease 1 promoter. Nucleic Acids Res. 30: 823—829. PMID 11809897 DOI:10.1093/nar/30.3.823
- Shankarling G., Cole B.S., Mallory M.J., Lynch K.W. (2014). Transcriptome-wide RNA interaction profiling reveals physical and functional targets of hnRNP L in human T cells. Mol. Cell. Biol. 34: 71—83. PMID 24164894 DOI:10.1128/MCB.00740-13
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5045 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P14866 (англ.) . Архів оригіналу за 24 квітня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |