KRAS

KRAS
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4WA7, 1D8D, 1D8E, 3GFT, 4DSN, 4DSO, 4EPR, 4EPT, 4EPV, 4EPW, 4EPX, 4EPY, 4L8G, 4LDJ, 4LPK, 4LRW, 4LUC, 4LV6, 4LYF, 4LYH, 4LYJ, 4M1O, 4M1S, 4M1T, 4M1W, 4M1Y, 4M21, 4M22, 4NMM, 4OBE, 4PZY, 4PZZ, 4Q01, 4Q02, 4Q03, 4QL3, 4TQ9, 4TQA, 4DST, 4DSU, 5F2E,%%s2MSC, 2MSD, 2MSE

Ідентифікатори
Символи KRAS, C-K-RAS, CFC2, K-RAS2A, K-RAS2B, K-RAS4A, K-RAS4B, KI-RAS, KRAS1, KRAS2, NS, NS3, RALD, RASK2, K-ras, KRAS proto-oncogene, GTPase, c-Ki-ras2, OES, c-Ki-ras, K-Ras 2, 'C-K-RAS, K-Ras, Kirsten RAt Sarcoma virus, Kirsten Rat Sarcoma virus
Зовнішні ІД OMIM: 190070 MGI: 96680 HomoloGene: 37990 GeneCards: KRAS
Пов'язані генетичні захворювання
гострий мієлоїдний лейкоз, juvenile myelomonocytic leukemia, Noonan syndrome 3, large intestine adenocarcinoma, adenocarcinoma of the lung, недрібноклітинна карцинома легенів[1]
Реагує на сполуку
lonafarnib[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• LRR domain binding
• GDP binding
• GO:0032403 protein-containing complex binding
• GTP binding
• GMP binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• GO:0006184 GTPase activity
• identical protein binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• мембрана
• focal adhesion
• extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane
• клітинна мембрана
• мітохондрія
• membrane raft

Біологічний процес

• visual learning
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
• response to mineralocorticoid
• positive regulation of protein phosphorylation
• regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
• regulation of protein stability
• epidermal growth factor receptor signaling pathway
• positive regulation of MAP kinase activity
• cytokine-mediated signaling pathway
• negative regulation of cell differentiation
• stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
• response to glucocorticoid
• MAPK cascade
• axon guidance
• Fc-epsilon receptor signaling pathway
• positive regulation of nitric-oxide synthase activity
• forebrain astrocyte development
• endocrine signaling
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• homeostasis of number of cells within a tissue
• striated muscle cell differentiation
• Ras protein signal transduction
• epithelial tube branching involved in lung morphogenesis
• regulation of synaptic transmission, GABAergic
• actin cytoskeleton organization
• leukocyte migration
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• positive regulation of Rac protein signal transduction
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• positive regulation of cell population proliferation
• ERBB2 signaling pathway
• liver development
• positive regulation of cellular senescence
• жіноча вагітність
• response to isolation stress

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3845
16653
Ensembl
ENSG00000133703
ENSMUSG00000030265
UniProt
P01116
P32883
RefSeq (мРНК)
NM_004985
NM_033360
NM_001369786
NM_001369787
NM_021284
RefSeq (білок)
NP_004976
NP_203524
NP_001356715
NP_001356716
NP_004976.2
NP_067259
NP_001390169
NP_001390170
NP_001390171
NP_001390172
NP_001390173
NP_001390174
NP_001390175
Локус (UCSC) Хр. 12: 25.21 – 25.25 Mb Хр. 6: 145.16 – 145.2 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KRAS (англ. KRAS proto-oncogene, GTPase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 189 амінокислот, а молекулярна маса — 21 656[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGET
CLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQI
KRVKDSEDVPMVLVGNKCDLPSRTVDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQ
RVEDAFYTLVREIRQYRLKKISKEEKTPGCVKIKKCIIM

Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

  • McCoy M.S., Bargmann C.I., Weinberg R.A. (1984). Human colon carcinoma Ki-ras2 oncogene and its corresponding proto-oncogene. Mol. Cell. Biol. 4: 1577—1582. PMID 6092920 DOI:10.1128/MCB.4.8.1577
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Yamamoto F., Perucho M. (1984). Activation of a human c-K-ras oncogene. Nucleic Acids Res. 12: 8873—8885. PMID 6096811 DOI:10.1093/nar/12.23.8873
  • Serra R.W., Fang M., Park S.M., Hutchinson L., Green M.R. (2014). A KRAS-directed transcriptional silencing pathway that mediates the CpG island methylator phenotype. Elife. 3: E02313—E02313. PMID 24623306 DOI:10.7554/eLife.02313
  • Grimmond S.M., Raghavan D., Russell P.J. (1992). Detection of a rare point mutation in Ki-ras of a human bladder cancer xenograft by polymerase chain reaction and direct sequencing. Urol. Res. 20: 121—126. PMID 1553789 DOI:10.1007/BF00296523
  • Sharma M.K., Zehnbauer B.A., Watson M.A., Gutmann D.H. (2005). RAS pathway activation and an oncogenic RAS mutation in sporadic pilocytic astrocytoma. Neurology. 65: 1335—1336. PMID 16247081 DOI:10.1212/01.wnl.0000180409.78098.d7

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KRAS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з KRAS proto-oncogene, GTPase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6407 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
  6. ↑ UniProt, P01116 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»