LGR4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4KT1, 4QXE, 4QXF

Ідентифікатори

Символи

LGR4, BNMD17, GPR48, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, DPSL

Зовнішні ІД

OMIM: 606666 MGI: 1891468 HomoloGene: 10226 GeneCards: LGR4

Пов'язані генетичні захворювання

остеопороз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • G protein-coupled receptor activity • protein-hormone receptor activity • G protein-coupled peptide receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана
Біологічний процес	• hair follicle development • G protein-coupled receptor signaling pathway • диференціація клітин • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • male genitalia development • metanephric nephron tubule morphogenesis • ритмічний процес • metanephric glomerulus development • процес імунної системи • epithelial cell proliferation • Wnt signaling pathway • tube morphogenesis • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • cell differentiation involved in metanephros development • intestinal stem cell homeostasis • epithelial cell proliferation involved in renal tubule morphogenesis • циркадний ритм • canonical Wnt signaling pathway involved in metanephric kidney development • digestive tract development • вроджений імунітет • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • bone remodeling • circadian regulation of gene expression • Сперматогенез • osteoblast differentiation • bone mineralization • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • activation of adenylate cyclase activity • hormone-mediated signaling pathway • negative regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55366


107515

Ensembl


ENSG00000205213


ENSMUSG00000050199

UniProt


Q9BXB1


A2ARI4

RefSeq (мРНК)


NM_018490 NM_001346432


NM_172671

RefSeq (білок)


NP_001333361 NP_060960


NP_766259

Локус (UCSC)

Хр. 11: 27.37 – 27.47 Mb

Хр. 2: 109.75 – 109.84 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LGR4 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 951 амінокислот, а молекулярна маса — 104 475^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGPLGLLCF	LALGLLGSAG	PSGAAPPLCA	APCSCDGDRR	VDCSGKGLTA
VPEGLSAFTQ	ALDISMNNIT	QLPEDAFKNF	PFLEELQLAG	NDLSFIHPKA
LSGLKELKVL	TLQNNQLKTV	PSEAIRGLSA	LQSLRLDANH	ITSVPEDSFE
GLVQLRHLWL	DDNSLTEVPV	HPLSNLPTLQ	ALTLALNKIS	SIPDFAFTNL
SSLVVLHLHN	NKIRSLSQHC	FDGLDNLETL	DLNYNNLGEF	PQAIKALPSL
KELGFHSNSI	SVIPDGAFDG	NPLLRTIHLY	DNPLSFVGNS	AFHNLSDLHS
LVIRGASMVQ	QFPNLTGTVH	LESLTLTGTK	ISSIPNNLCQ	EQKMLRTLDL
SYNNIRDLPS	FNGCHALEEI	SLQRNQIYQI	KEGTFQGLIS	LRILDLSRNL
IHEIHSRAFA	TLGPITNLDV	SFNELTSFPT	EGLNGLNQLK	LVGNFKLKEA
LAAKDFVNLR	SLSVPYAYQC	CAFWGCDSYA	NLNTEDNSLQ	DHSVAQEKGT
ADAANVTSTL	ENEEHSQIII	HCTPSTGAFK	PCEYLLGSWM	IRLTVWFIFL
VALFFNLLVI	LTTFASCTSL	PSSKLFIGLI	SVSNLFMGIY	TGILTFLDAV
SWGRFAEFGI	WWETGSGCKV	AGFLAVFSSE	SAIFLLMLAT	VERSLSAKDI
MKNGKSNHLK	QFRVAALLAF	LGATVAGCFP	LFHRGEYSAS	PLCLPFPTGE
TPSLGFTVTL	VLLNSLAFLL	MAVIYTKLYC	NLEKEDLSEN	SQSSMIKHVA
WLIFTNCIFF	CPVAFFSFAP	LITAISISPE	IMKSVTLIFF	PLPACLNPVL
YVFFNPKFKE	DWKLLKRRVT	KKSGSVSVSI	SSQGGCLEQD	FYYDCGMYSH
LQGNLTVCDC	CESFLLTKPV	SCKHLIKSHS	CPALAVASCQ	RPEGYWSDCG
TQSAHSDYAD	EEDSFVSDSS	DQVQACGRAC	FYQSRGFPLV	RYAYNLPRVK
D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, біологічні ритми, диференціація клітин, сигнальний шлях Wnt, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Loh E.D., Broussard S.R., Kolakowski L.F. Jr. (2001). Molecular characterization of a novel glycoprotein hormone G-protein-coupled receptor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 282: 757—764. PMID 11401528 DOI:10.1006/bbrc.2001.4625
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Carmon K.S., Gong X., Lin Q., Thomas A., Liu Q. (2011). R-spondins function as ligands of the orphan receptors LGR4 and LGR5 to regulate Wnt/beta-catenin signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 11452—11457. PMID 21693646 DOI:10.1073/pnas.1106083108

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LGR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13299 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BXB1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.