LRBA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LRBA, BGL, CDC4L, CVID8, LAB300, LBA, LPS responsive beige-like anchor protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606453 MGI: 1933162 HomoloGene: 36205 GeneCards: LRBA |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • молекулярна функція |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • лізосома • ендоплазматичний ретикулум • мембрана |
---|
Біологічний процес | • GO:0022610 життєдіяльність |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001199282 NM_006726 NM_001364905 NM_001367550 |
| | NM_001077687 NM_001077688 NM_030695 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186211 NP_006717 NP_001351834 NP_001354479 |
| | NP_001071155 NP_001071156 NP_109620 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 150.26 – 151.02 Mb | Хр. 3: 86.13 – 86.69 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LRBA (англ. LPS responsive beige-like anchor protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 863 амінокислот, а молекулярна маса — 319 108[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASEDNRVPS | | PPPTGDDGGG | | GGREETPTEG | | GALSLKPGLP | | IRGIRMKFAV |
LTGLVEVGEV | | SNRDIVETVF | | NLLVGGQFDL | | EMNFIIQEGE | | SINCMVDLLE |
KCDITCQAEV | | WSMFTAILKK | | SIRNLQVCTE | | VGLVEKVLGK | | IEKVDNMIAD |
LLVDMLGVLA | | SYNLTVRELK | | LFFSKLQGDK | | GRWPPHAGKL | | LSVLKHMPQK |
YGPDAFFNFP | | GKSAAAIALP | | PIAKWPYQNG | | FTFHTWLRMD | | PVNNINVDKD |
KPYLYCFRTS | | KGLGYSAHFV | | GGCLIVTSIK | | SKGKGFQHCV | | KFDFKPQKWY |
MVTIVHIYNR | | WKNSELRCYV | | NGELASYGEI | | TWFVNTSDTF | | DKCFLGSSET |
ADANRVFCGQ | | MTAVYLFSEA | | LNAAQIFAIY | | QLGLGYKGTF | | KFKAESDLFL |
AEHHKLLLYD | | GKLSSAIAFT | | YNPRATDAQL | | CLESSPKDNP | | SIFVHSPHAL |
MLQDVKAVLT | | HSIQSAMHSI | | GGVQVLFPLF | | AQLDYRQYLS | | DEIDLTICST |
LLAFIMELLK | | NSIAMQEQML | | ACKGFLVIGY | | SLEKSSKSHV | | SRAVLELCLA |
FSKYLSNLQN | | GMPLLKQLCD | | HVLLNPAIWI | | HTPAKVQLML | | YTYLSTEFIG |
TVNIYNTIRR | | VGTVLLIMHT | | LKYYYWAVNP | | QDRSGITPKG | | LDGPRPNQKE |
MLSLRAFLLM | | FIKQLVMKDS | | GVKEDELQAI | | LNYLLTMHED | | DNLMDVLQLL |
VALMSEHPNS | | MIPAFDQRNG | | LRVIYKLLAS | | KSEGIRVQAL | | KAMGYFLKHL |
APKRKAEVML | | GHGLFSLLAE | | RLMLQTNLIT | | MTTYNVLFEI | | LIEQIGTQVI |
HKQHPDPDSS | | VKIQNPQILK | | VIATLLRNSP | | QCPESMEVRR | | AFLSDMIKLF |
NNSRENRRSL | | LQCSVWQEWM | | LSLCYFNPKN | | SDEQKITEMV | | YAIFRILLYH |
AVKYEWGGWR | | VWVDTLSITH | | SKVTFEIHKE | | NLANIFREQQ | | GKVDEEIGLC |
SSTSVQAASG | | IRRDINVSVG | | SQQPDTKDSP | | VCPHFTTNGN | | ENSSIEKTSS |
LESASNIELQ | | TTNTSYEEMK | | AEQENQELPD | | EGTLEETLTN | | ETRNADDLEV |
SSDIIEAVAI | | SSNSFITTGK | | DSMTVSEVTA | | SISSPSEEDA | | SEMPEFLDKS |
IVEEEEDDDY | | VELKVEGSPT | | EEANLPTELQ | | DNSLSPAASE | | AGEKLDMFGN |
DDKLIFQEGK | | PVTEKQTDTE | | TQDSKDSGIQ | | TMTASGSSAM | | SPETTVSQIA |
VESDLGQMLE | | EGKKATNLTR | | ETKLINDCHG | | SVSEASSEQK | | IAKLDVSNVA |
TDTERLELKA | | SPNVEAPQPH | | RHVLEISRQH | | EQPGQGIAPD | | AVNGQRRDSR |
STVFRIPEFN | | WSQMHQRLLT | | DLLFSIETDI | | QMWRSHSTKT | | VMDFVNSSDN |
VIFVHNTIHL | | ISQVMDNMVM | | ACGGILPLLS | | AATSATHELE | | NIEPTQGLSI |
EASVTFLQRL | | ISLVDVLIFA | | SSLGFTEIEA | | EKSMSSGGIL | | RQCLRLVCAV |
AVRNCLECQQ | | HSQLKTRGDK | | ALKPMHSLIP | | LGKSAAKSPV | | DIVTGGISPV |
RDLDRLLQDM | | DINRLRAVVF | | RDIEDSKQAQ | | FLALAVVYFI | | SVLMVSKYRD |
ILEPQNERHS | | QSCTETGSEN | | ENVSLSEITP | | AAFSTLTTAS | | VEESESTSSA |
RRRDSGIGEE | | TATGLGSHVE | | VTPHTAPPGV | | SAGPDAISEV | | LSTLSLEVNK |
SPETKNDRGN | | DLDTKATPSV | | SVSKNVNVKD | | ILRSLVNIPA | | DGVTVDPALL |
PPACLGALGD | | LSVEQPVQFR | | SFDRSVIVAA | | KKSAVSPSTF | | NTSIPTNAVS |
VVSSVDSAQA | | SDMGGESPGS | | RSSNAKLPSV | | PTVDSVSQDP | | VSNMSITERL |
EHALEKAAPL | | LREIFVDFAP | | FLSRTLLGSH | | GQELLIEGTS | | LVCMKSSSSV |
VELVMLLCSQ | | EWQNSIQKNA | | GLAFIELVNE | | GRLLSQTMKD | | HLVRVANEAE |
FILSRQRAED | | IHRHAEFESL | | CAQYSADKRE | | DEKMCDHLIR | | AAKYRDHVTA |
TQLIQKIINI | | LTDKHGAWGN | | SAVSRPLEFW | | RLDYWEDDLR | | RRRRFVRNPL |
GSTHPEATLK | | TAVEHVCIFK | | LRENSKATDE | | DILAKGKQSI | | RSQALGNQNS |
ENEILLEGDD | | DTLSSVDEKD | | LENLAGPVSL | | STPAQLVAPS | | VVVKGTLSVT |
SSELYFEVDE | | EDPNFKKIDP | | KILAYTEGLH | | GKWLFTEIRS | | IFSRRYLLQN |
TALEIFMANR | | VAVMFNFPDP | | ATVKKVVNYL | | PRVGVGTSFG | | LPQTRRISLA |
SPRQLFKASN | | MTQRWQHREI | | SNFEYLMFLN | | TIAGRSYNDL | | NQYPVFPWVI |
TNYESEELDL | | TLPTNFRDLS | | KPIGALNPKR | | AAFFAERYES | | WEDDQVPKFH |
YGTHYSTASF | | VLAWLLRIEP | | FTTYFLNLQG | | GKFDHADRTF | | SSISRAWRNS |
QRDTSDIKEL | | IPEFYYLPEM | | FVNFNNYNLG | | VMDDGTVVSD | | VELPPWAKTS |
EEFVHINRLA | | LESEFVSCQL | | HQWIDLIFGY | | KQQGPEAVRA | | LNVFYYLTYE |
GAVNLNSITD | | PVLREAVEAQ | | IRSFGQTPSQ | | LLIEPHPPRG | | SAMQVSPLMF |
TDKAQQDVIM | | VLKFPSNSPV | | THVAANTQPG | | LATPAVITVT | | ANRLFAVNKW |
HNLPAHQGAV | | QDQPYQLPVE | | IDPLIASNTG | | MHRRQITDLL | | DQSIQVHSQC |
FVITSDNRYI | | LVCGFWDKSF | | RVYSTDTGRL | | IQVVFGHWDV | | VTCLARSESY |
IGGNCYILSG | | SRDATLLLWY | | WNGKCSGIGD | | NPGSETAAPR | | AILTGHDYEV |
TCAAVCAELG | | LVLSGSQEGP | | CLIHSMNGDL | | LRTLEGPENC | | LKPKLIQASR |
EGHCVIFYEN | | GLFCTFSVNG | | KLQATMETDD | | NIRAIQLSRD | | GQYLLTGGDR |
GVVVVRQVSD | | LKQLFAYPGC | | DAGIRAMALS | | YDQRCIISGM | | ASGSIVLFYN |
DFNRWHHEYQ | | TRY |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі.
Література
- Wang J.-W., Howson J., Haller E., Kerr W.G. (2001). Identification of a novel lipopolysaccharide-inducible gene with key features of both A kinase anchor proteins and chs1/beige proteins. J. Immunol. 166: 4586—4595. PMID 11254716 DOI:10.4049/jimmunol.166.7.4586
- Feuchter A.E., Freeman J.D., Mager D.L. (1992). Strategy for detecting cellular transcripts promoted by human endogenous long terminal repeats: identification of a novel gene (CDC4L) with homology to yeast CDC4. Genomics. 13: 1237—1246. PMID 1505956 DOI:10.1016/0888-7543(92)90041-P
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1742 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P50851 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |