LSM10 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

LSM10

Ідентифікатори

Символи

LSM10, MST074, MSTP074, U7 small nuclear RNA associated

Зовнішні ІД

OMIM: 617909 MGI: 2151045 HomoloGene: 13154 GeneCards: LSM10

Онтологія гена
Молекулярна функція	• U7 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone pre-mRNA DCP binding • RNA binding
Клітинна компонента	• Тільце Кахаля • U7 snRNP • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • histone mRNA metabolic process • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84967


116748

Ensembl


ENSG00000181817


ENSMUSG00000050188

UniProt


Q969L4


Q8QZX5

RefSeq (мРНК)


NM_032881


NM_001163266 NM_138721

RefSeq (білок)


NP_116270


NP_001156738 NP_620046

Локус (UCSC)

Хр. 1: 36.39 – 36.4 Mb

Хр. 4: 125.99 – 125.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LSM10 (англ. LSM10, U7 small nuclear RNA associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 123 амінокислот, а молекулярна маса — 14 080^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVSHSVKER	TISENSLIIL	LQGLQGRVTT	VDLRDESVAH	GRIDNVDAFM
NIRLAKVTYT	DRWGHQVKLD	DLFVTGRNVR	YVHIPDDVNI	TSTIEQQLQI
IHRVRNFGGK	GQGRWEFPPK	NCK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wagner E.J., Marzluff W.F. (2006). ZFP100, a component of the active U7 snRNP limiting for histone pre-mRNA processing, is required for entry into S phase. Mol. Cell. Biol. 26: 6702—6712. PMID 16914750 DOI:10.1128/MCB.00391-06

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17562 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q969L4 (англ.) . Архів оригіналу за 21 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.