MBD3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MB7

Ідентифікатори

Символи

MBD3, methyl-CpG binding domain protein 3

Зовнішні ІД

OMIM: 603573 MGI: 1333812 HomoloGene: 2917 GeneCards: MBD3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• methyl-CpG binding • DNA binding • nucleosomal DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • histone deacetylase activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0035328 Гетерохроматин • хромосома • NuRD complex • цитоплазма • Хроматин • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• response to estradiol • гістогенез • embryonic organ development • regulation of DNA methylation • in utero embryonic development • GO:1904578 response to organic cyclic compound • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • heart development • DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • histone acetylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0010260 старіння людини • brain development • response to nutrient levels • transcription, DNA-templated • regulation of signal transduction by p53 class mediator • histone deacetylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


53615


17192

Ensembl


ENSG00000071655


ENSMUSG00000035478

UniProt


O95983


Q9Z2D8

RefSeq (мРНК)


NM_003926 NM_001281453 NM_001281454


NM_013595 NM_001306143

RefSeq (білок)


NP_001268382 NP_001268383


NP_001293072 NP_038623

Локус (UCSC)

Хр. 19: 1.57 – 1.59 Mb

Хр. 10: 80.23 – 80.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MBD3 (англ. Methyl-CpG binding domain protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 844^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERKRWECPA	LPQGWEREEV	PRRSGLSAGH	RDVFYYSPSG	KKFRSKPQLA
RYLGGSMDLS	TFDFRTGKML	MSKMNKSRQR	VRYDSSNQVK	GKPDLNTALP
VRQTASIFKQ	PVTKITNHPS	NKVKSDPQKA	VDQPRQLFWE	KKLSGLNAFD
IAEELVKTMD	LPKGLQGVGP	GCTDETLLSA	IASALHTSTM	PITGQLSAAV
EKNPGVWLNT	TQPLCKAFMV	TDEDIRKQEE	LVQQVRKRLE	EALMADMLAH
VEELARDGEA	PLDKACAEDD	DEEDEEEEEE	EPDPDPEMEH	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins. Mol. Cell. Biol. 18: 6538—6547. PMID 9774669 DOI:10.1128/MCB.18.11.6538
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tatematsu K., Yamazaki T., Ishikawa F. (2000). MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase. Genes Cells. 5: 677—688. PMID 10947852 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x
Saito M., Ishikawa F. (2002). The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2. J. Biol. Chem. 277: 35434—35439. PMID 12124384 DOI:10.1074/jbc.M203455200
Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. (2002). Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3. J. Biol. Chem. 277: 40958—40966. PMID 12183469 DOI:10.1074/jbc.M207467200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6918 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O95983 (англ.) . Архів оригіналу за 11 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.