MRE11 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MRE11, ATLD, HNGS1, MRE11B, MRE11A, MRE11 homolog A, double strand break repair nuclease, MRE11 homolog, double strand break repair nuclease |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600814 MGI: 1100512 HomoloGene: 4083 GeneCards: MRE11 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ataxia-telangiectasia-like disorder[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • manganese ion binding • GO:0004003 DNA helicase activity • single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3'-5' exonuclease activity • nuclease activity • endonuclease activity • double-stranded DNA binding • endodeoxyribonuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • cadherin binding • identical protein binding • 3'-5'-exodeoxyribonuclease activity • 5'-3' exonuclease activity |
---|
Клітинна компонента | • site of double-strand break • гіалоплазма • PML body • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • теломера • хромосома • Mre11 complex • replication fork |
---|
Біологічний процес | • reciprocal meiotic recombination • DNA recombination • telomere maintenance via telomerase • positive regulation of kinase activity • mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling • telomeric 3' overhang formation • negative regulation of apoptotic process • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • sister chromatid cohesion • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of telomere maintenance • DNA duplex unwinding • homologous chromosome pairing at meiosis • negative regulation of DNA endoreduplication • double-strand break repair • GO:0007126 мейоз • double-strand break repair via homologous recombination • positive regulation of protein autophosphorylation • проліферація • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • GO:0022415 viral process • double-strand break repair via nonhomologous end joining • positive regulation of type I interferon production • regulation of mitotic recombination • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • DNA double-strand break processing • strand displacement • реплікація ДНК • DNA synthesis involved in DNA repair • regulation of signal transduction by p53 class mediator • telomere maintenance • meiotic DNA double-strand break formation • mitochondrial double-strand break repair via homologous recombination • DNA strand resection involved in replication fork processing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_005590 NM_005591 NM_001330347 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001317276 NP_005581 NP_005582 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 94.42 – 94.49 Mb | Хр. 9: 14.7 – 14.75 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MRE11 (англ. MRE11 homolog, double strand break repair nuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 80 593[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSTADALDDE | | NTFKILVATD | | IHLGFMEKDA | | VRGNDTFVTL | | DEILRLAQEN |
EVDFILLGGD | | LFHENKPSRK | | TLHTCLELLR | | KYCMGDRPVQ | | FEILSDQSVN |
FGFSKFPWVN | | YQDGNLNISI | | PVFSIHGNHD | | DPTGADALCA | | LDILSCAGFV |
NHFGRSMSVE | | KIDISPVLLQ | | KGSTKIALYG | | LGSIPDERLY | | RMFVNKKVTM |
LRPKEDENSW | | FNLFVIHQNR | | SKHGSTNFIP | | EQFLDDFIDL | | VIWGHEHECK |
IAPTKNEQQL | | FYISQPGSSV | | VTSLSPGEAV | | KKHVGLLRIK | | GRKMNMHKIP |
LHTVRQFFME | | DIVLANHPDI | | FNPDNPKVTQ | | AIQSFCLEKI | | EEMLENAERE |
RLGNSHQPEK | | PLVRLRVDYS | | GGFEPFSVLR | | FSQKFVDRVA | | NPKDIIHFFR |
HREQKEKTGE | | EINFGKLITK | | PSEGTTLRVE | | DLVKQYFQTA | | EKNVQLSLLT |
ERGMGEAVQE | | FVDKEEKDAI | | EELVKYQLEK | | TQRFLKERHI | | DALEDKIDEE |
VRRFRETRQK | | NTNEEDDEVR | | EAMTRARALR | | SQSEESASAF | | SADDLMSIDL |
AEQMANDSDD | | SISAATNKGR | | GRGRGRRGGR | | GQNSASRGGS | | QRGRADTGLE |
TSTRSRNSKT | | AVSASRNMSI | | IDAFKSTRQQ | | PSRNVTTKNY | | SEVIEVDESD |
VEEDIFPTTS | | KTDQRWSSTS | | SSKIMSQSQV | | SKGVDFESSE | | DDDDDPFMNT |
SSLRRNRR |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном марганцю. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Paull T.T., Gellert M. (1998). The 3' to 5' exonuclease activity of Mre 11 facilitates repair of DNA double-strand breaks. Mol. Cell. 1: 969—979. PMID 9651580 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80097-0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Trujillo K.M., Yuan S.-S.F., Lee E.Y.-H.P., Sung P. (1998). Nuclease activities in a complex of human recombination and DNA repair factors Rad50, Mre11, and p95. J. Biol. Chem. 273: 21447—21450. PMID 9705271 DOI:10.1074/jbc.273.34.21447
- Zhu X.-D., Kuester B., Mann M., Petrini J.H.J., de Lange T. (2000). Cell-cycle-regulated association of RAD50/MRE11/NBS1 with TRF2 and human telomeres. Nat. Genet. 25: 347—352. PMID 10888888 DOI:10.1038/77139
- Lee J.-H., Paull T.T. (2004). Direct activation of the ATM protein kinase by the Mre11/Rad50/Nbs1 complex. Science. 304: 93—96. PMID 15064416 DOI:10.1126/science.1091496
- Balasubramanian N., Bai P., Buchek G., Korza G., Weller S.K. (2010). Physical interaction between the herpes simplex virus type 1 exonuclease, UL12, and the DNA double-strand break-sensing MRN complex. J. Virol. 84: 12504—12514. PMID 20943970 DOI:10.1128/JVI.01506-10
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з MRE11 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7230 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P49959 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |