NAB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2YUF

Ідентифікатори

Символи

NAB1, NGFI-A binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600800 MGI: 107564 HomoloGene: 4352 GeneCards: NAB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transcription factor binding • GO:0001104 transcription coregulator activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• Schwann cell differentiation • myelination • осифікація ендохондральна • regulation of epidermis development • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4664


17936

Ensembl


ENSG00000138386


ENSMUSG00000002881

UniProt


Q13506


Q61122

RefSeq (мРНК)


NM_005966 NM_001321312 NM_001321313 NM_001321314 NM_001321315


NM_008667

RefSeq (білок)


NP_001308241 NP_001308242 NP_001308243 NP_001308244 NP_005957


NP_032693

Локус (UCSC)

Хр. 2: 190.65 – 190.69 Mb

Хр. 1: 52.5 – 52.54 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NAB1 (англ. NGFI-A binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 487 амінокислот, а молекулярна маса — 54 401^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAALPRTLG	ELQLYRILQK	ANLLSYFDAF	IQQGGDDVQQ	LCEAGEEEFL
EIMALVGMAS	KPLHVRRLQK	ALRDWVTNPG	LFNQPLTSLP	VSSIPIYKLP
EGSPTWLGIS	CSSYERSSNA	REPHLKIPKC	AATTCVQSLG	QGKSDVVGSL
ALQSVGESRL	WQGHHATESE	HSLSPADLGS	PASPKESSEA	LDAAAALSVA
ECVERMAPTL	PKSDLNEVKE	LLKTNKKLAK	MIGHIFEMND	DDPHKEEEIR
KYSAIYGRFD	SKRKDGKHLT	LHELTVNEAA	AQLCVKDNAL	LTRRDELFAL
ARQISREVTY	KYTYRTTKSK	CGERDELSPK	RIKVEDGFPD	FQDSVQTLFQ
QARAKSEELA	ALSSQQPEKV	MAKQMEFLCN	QAGYERLQHA	ERRLSAGLYR
QSSEEHSPNG	LTSDNSDGQG	ERPLNLRMPN	LQNRQPHHFV	VDGELSRLYP
SEAKSHSSES	LGILKDYPHS	AFTLEKKVIK	TEPEDSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Garcia-Gutierrez P., Juarez-Vicente F., Gallardo-Chamizo F., Charnay P., Garcia-Dominguez M. (2011). The transcription factor Krox20 is an E3 ligase that sumoylates its Nab coregulators. EMBO Rep. 12: 1018—1023. PMID 21836637 DOI:10.1038/embor.2011.152
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7626 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13506 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.