NCOR1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2EQR, 3H52, 3KMZ, 3N00, 4MDD, 4WVD | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NCOR1, N-CoR, N-CoR1, PPP1R109, TRAC1, hN-CoR, nuclear receptor corepressor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600849 MGI: 1349717 HomoloGene: 38166 GeneCards: NCOR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase binding • thyroid hormone receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • sequence-specific DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • histone deacetylase complex • мембрана • transcription repressor complex • Sin3 complex • spindle microtubule • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • mitotic spindle |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • spindle assembly • negative regulation of JNK cascade • regulation of fatty acid transport • циркадний ритм • transcription, DNA-templated • regulation of lipid metabolic process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • locomotor rhythm • ритмічний процес |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001190438 NM_001190440 NM_006311 |
| | NM_001252313 NM_011308 NM_177229 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001177367 NP_001177369 NP_006302 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 16.03 – 16.22 Mb | Хр. 11: 62.21 – 62.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NCOR1 (англ. Nuclear receptor corepressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 440 амінокислот, а молекулярна маса — 270 210[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSSSGYPPNQ | | GAFSTEQSRY | | PPHSVQYTFP | | NTRHQQEFAV | | PDYRSSHLEV |
SQASQLLQQQ | | QQQQLRRRPS | | LLSEFHPGSD | | RPQERRTSYE | | PFHPGPSPVD |
HDSLESKRPR | | LEQVSDSHFQ | | RVSAAVLPLV | | HPLPEGLRAS | | ADAKKDPAFG |
GKHEAPSSPI | | SGQPCGDDQN | | ASPSKLSKEE | | LIQSMDRVDR | | EIAKVEQQIL |
KLKKKQQQLE | | EEAAKPPEPE | | KPVSPPPVEQ | | KHRSIVQIIY | | DENRKKAEEA |
HKIFEGLGPK | | VELPLYNQPS | | DTKVYHENIK | | TNQVMRKKLI | | LFFKRRNHAR |
KQREQKICQR | | YDQLMEAWEK | | KVDRIENNPR | | RKAKESKTRE | | YYEKQFPEIR |
KQREQQERFQ | | RVGQRGAGLS | | ATIARSEHEI | | SEIIDGLSEQ | | ENNEKQMRQL |
SVIPPMMFDA | | EQRRVKFINM | | NGLMEDPMKV | | YKDRQFMNVW | | TDHEKEIFKD |
KFIQHPKNFG | | LIASYLERKS | | VPDCVLYYYL | | TKKNENYKAL | | VRRNYGKRRG |
RNQQIARPSQ | | EEKVEEKEED | | KAEKTEKKEE | | EKKDEEEKDE | | KEDSKENTKE |
KDKIDGTAEE | | TEEREQATPR | | GRKTANSQGR | | RKGRITRSMT | | NEAAAASAAA |
AAATEEPPPP | | LPPPPEPIST | | EPVETSRWTE | | EEMEVAKKGL | | VEHGRNWAAI |
AKMVGTKSEA | | QCKNFYFNYK | | RRHNLDNLLQ | | QHKQKTSRKP | | REERDVSQCE |
SVASTVSAQE | | DEDIEASNEE | | ENPEDSEVEA | | VKPSEDSPEN | | ATSRGNTEPA |
VELEPTTETA | | PSTSPSLAVP | | STKPAEDESV | | ETQVNDSISA | | ETAEQMDVDQ |
QEHSAEEGSV | | CDPPPATKAD | | SVDVEVRVPE | | NHASKVEGDN | | TKERDLDRAS |
EKVEPRDEDL | | VVAQQINAQR | | PEPQSDNDSS | | ATCSADEDVD | | GEPERQRMFP |
MDSKPSLLNP | | TGSILVSSPL | | KPNPLDLPQL | | QHRAAVIPPM | | VSCTPCNIPI |
GTPVSGYALY | | QRHIKAMHES | | ALLEEQRQRQ | | EQIDLECRSS | | TSPCGTSKSP |
NREWEVLQPA | | PHQVITNLPE | | GVRLPTTRPT | | RPPPPLIPSS | | KTTVASEKPS |
FIMGGSISQG | | TPGTYLTSHN | | QASYTQETPK | | PSVGSISLGL | | PRQQESAKSA |
TLPYIKQEEF | | SPRSQNSQPE | | GLLVRAQHEG | | VVRGTAGAIQ | | EGSITRGTPT |
SKISVESIPS | | LRGSITQGTP | | ALPQTGIPTE | | ALVKGSISRM | | PIEDSSPEKG |
REEAASKGHV | | IYEGKSGHIL | | SYDNIKNARE | | GTRSPRTAHE | | ISLKRSYESV |
EGNIKQGMSM | | RESPVSAPLE | | GLICRALPRG | | SPHSDLKERT | | VLSGSIMQGT |
PRATTESFED | | GLKYPKQIKR | | ESPPIRAFEG | | AITKGKPYDG | | ITTIKEMGRS |
IHEIPRQDIL | | TQESRKTPEV | | VQSTRPIIEG | | SISQGTPIKF | | DNNSGQSAIK |
HNVKSLITGP | | SKLSRGMPPL | | EIVPENIKVV | | ERGKYEDVKA | | GETVRSRHTS |
VVSSGPSVLR | | STLHEAPKAQ | | LSPGIYDDTS | | ARRTPVSYQN | | TMSRGSPMMN |
RTSDVTISSN | | KSTNHERKST | | LTPTQRESIP | | AKSPVPGVDP | | VVSHSPFDPH |
HRGSTAGEVY | | RSHLPTHLDP | | AMPFHRALDP | | AAAAYLFQRQ | | LSPTPGYPSQ |
YQLYAMENTR | | QTILNDYITS | | QQMQVNLRPD | | VARGLSPREQ | | PLGLPYPATR |
GIIDLTNMPP | | TILVPHPGGT | | STPPMDRITY | | IPGTQITFPP | | RPYNSASMSP |
GHPTHLAAAA | | SAERERERER | | EKERERERIA | | AASSDLYLRP | | GSEQPGRPGS |
HGYVRSPSPS | | VRTQETMLQQ | | RPSVFQGTNG | | TSVITPLDPT | | AQLRIMPLPA |
GGPSISQGLP | | ASRYNTAADA | | LAALVDAAAS | | APQMDVSKTK | | ESKHEAARLE |
ENLRSRSAAV | | SEQQQLEQKT | | LEVEKRSVQC | | LYTSSAFPSG | | KPQPHSSVVY |
SEAGKDKGPP | | PKSRYEEELR | | TRGKTTITAA | | NFIDVIITRQ | | IASDKDARER |
GSQSSDSSSS | | LSSHRYETPS | | DAIEVISPAS | | SPAPPQEKLQ | | TYQPEVVKAN |
QAENDPTRQY | | EGPLHHYRPQ | | QESPSPQQQL | | PPSSQAEGMG | | QVPRTHRLIT |
LADHICQIIT | | QDFARNQVSS | | QTPQQPPTST | | FQNSPSALVS | | TPVRTKTSNR |
YSPESQAQSV | | HHQRPGSRVS | | PENLVDKSRG | | SRPGKSPERS | | HVSSEPYEPI |
SPPQVPVVHE | | KQDSLLLLSQ | | RGAEPAEQRN | | DARSPGSISY | | LPSFFTKLEN |
TSPMVKSKKQ | | EIFRKLNSSG | | GGDSDMAAAQ | | PGTEIFNLPA | | VTTSGSVSSR |
GHSFADPASN | | LGLEDIIRKA | | LMGSFDDKVE | | DHGVVMSQPM | | GVVPGTANTS |
VVTSGETRRE | | EGDPSPHSGG | | VCKPKLISKS | | NSRKSKSPIP | | GQGYLGTERP |
SSVSSVHSEG | | DYHRQTPGWA | | WEDRPSSTGS | | TQFPYNPLTM | | RMLSSTPPTP |
IACAPSAVNQ | | AAPHQQNRIW | | EREPAPLLSA | | QYETLSDSDD |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Wang J., Hoshino T., Redner R.L., Kajigaya S., Liu J.M. (1998). ETO, fusion partner in t(8;21) acute myeloid leukemia, represses transcription by interaction with the human N-CoR/mSin3/HDAC1 complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 10860—10865. PMID 9724795 DOI:10.1073/pnas.95.18.10860
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Harding H.P., Atkins G.B., Jaffe A.B., Seo W.J., Lazar M.A. (1997). Transcriptional activation and repression by RORalpha, an orphan nuclear receptor required for cerebellar development. Mol. Endocrinol. 11: 1737—1746. PMID 9328355 DOI:10.1210/mend.11.11.0002
- Underhill C., Qutob M.S., Yee S.P., Torchia J. (2000). A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1. J. Biol. Chem. 275: 40463—40470. PMID 11013263 DOI:10.1074/jbc.M007864200
- Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2. Mol. Cell. 9: 611—623. PMID 11931768 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
- Yoon H.-G., Chan D.W., Reynolds A.B., Qin J., Wong J. (2003). N-CoR mediates DNA methylation-dependent repression through a methyl CpG binding protein Kaiso. Mol. Cell. 12: 723—734. PMID 14527417 DOI:10.1016/j.molcel.2003.08.008
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7672 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75376 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |