NDC1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NDC1, NET3, TMEM48, NDC1 transmembrane nucleoporin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610115 MGI: 1920037 HomoloGene: 41224 GeneCards: NDC1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинна мембрана • ядерна пора • actin cytoskeleton • клітинне ядро • spindle pole body • nuclear pore transmembrane ring • host cell |
---|
Біологічний процес | • mRNA transport • nuclear pore complex assembly • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • homologous chromosome pairing at meiosis • Сперматогенез • protein transport • regulation of cellular response to heat • GO:0022415 viral process • mRNA export from nucleus • GO:0046795 intracellular transport of virus • tRNA export from nucleus • spindle pole body duplication • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nuclear pore organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 53.77 – 53.84 Mb | Хр. 4: 107.22 – 107.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NDC1 (англ. NDC1 transmembrane nucleoporin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 674 амінокислот, а молекулярна маса — 76 305[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATAVSRPCA | | GRSRDILWRV | | LGWRIVASIV | | WSVLFLPICT | | TVFIIFSRID |
LFHPIQWLSD | | SFSDLYSSYV | | IFYFLLLSVV | | IIIISIFNVE | | FYAVVPSIPC |
SRLALIGKII | | HPQQLMHSFI | | HAAMGMVMAW | | CAAVITQGQY | | SFLVVPCTGT |
NSFGSPAAQT | | CLNEYHLFFL | | LTGAFMGYSY | | SLLYFVNNMN | | YLPFPIIQQY |
KFLRFRRSLL | | LLVKHSCVES | | LFLVRNFCIL | | YYFLGYIPKA | | WISTAMNLHI |
DEQVHRPLDT | | VSGLLNLSLL | | YHVWLCGVFL | | LTTWYVSWIL | | FKIYATEAHV |
FPVQPPFAEG | | SDECLPKVLN | | SNPPPIIKYL | | ALQDLMLLSQ | | YSPSRRQEVF |
SLSQPGGHPH | | NWTAISRECL | | NLLNGMTQKL | | ILYQEAAATN | | GRVSSSYPVE |
PKKLNSPEET | | AFQTPKSSQM | | PRPSVPPLVK | | TSLFSSKLST | | PDVVSPFGTP |
FGSSVMNRMA | | GIFDVNTCYG | | SPQSPQLIRR | | GPRLWTSASD | | QQMTEFSNPS |
PSTSISAEGK | | TMRQPSVIYS | | WIQNKREQIK | | NFLSKRVLIM | | YFFSKHPEAS |
IQAVFSDAQM | | HIWALEGLSH | | LVAASFTEDR | | FGVVQTTLPA | | ILNTLLTLQE |
AVDKYFKLPH | | ASSKPPRISG | | SLVDTSYKTL | | RFAFRASLKT | | AIYRITTTFG |
EHLNAVQASA | | EHQKRLQQFL | | EFKE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Schirmer E.C., Florens L., Guan T., Yates J.R. III, Gerace L. (2003). Nuclear membrane proteins with potential disease links found by subtractive proteomics. Science. 301: 1380—1382. PMID 12958361 DOI:10.1126/science.1088176
- Kind B., Koehler K., Lorenz M., Huebner A. (2009). The nuclear pore complex protein ALADIN is anchored via NDC1 but not via POM121 and GP210 in the nuclear envelope. Biochem. Biophys. Res. Commun. 390: 205—210. PMID 19782045 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.09.080
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25525 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9BTX1 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |