NOP2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NOP2, NOL1, NOP120, NSUN1, p120, NOP2 nucleolar protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 164031 MGI: 107891 HomoloGene: 135865 GeneCards: NOP2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity • rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • ядерце • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • rRNA processing • Метилювання • rRNA base methylation • maturation of LSU-rRNA • positive regulation of cell population proliferation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • ribosomal large subunit assembly • regulation of signal transduction by p53 class mediator • ribosome biogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001033714 NM_001258308 NM_001258309 NM_001258310 NM_006170 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001028886 NP_001245237 NP_001245238 NP_001245239 NP_006161 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 6.56 – 6.57 Mb | Хр. 6: 125.11 – 125.12 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NOP2 (англ. NOP2 nucleolar protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 812 амінокислот, а молекулярна маса — 89 302[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGRKLDPTKE | | KRGPGRKARK | | QKGAETELVR | | FLPAVSDENS | | KRLSSRARKR |
AAKRRLGSVE | | APKTNKSPEA | | KPLPGKLPKG | | ISAGAVQTAG | | KKGPQSLFNA |
PRGKKRPAPG | | SDEEEEEEDS | | EEDGMVNHGD | | LWGSEDDADT | | VDDYGADSNS |
EDEEEGEALL | | PIERAARKQK | | AREAAAGIQW | | SEEETEDEEE | | EKEVTPESGP |
PKVEEADGGL | | QINVDEEPFV | | LPPAGEMEQD | | AQAPDLQRVH | | KRIQDIVGIL |
RDFGAQREEG | | RSRSEYLNRL | | KKDLAIYYSY | | GDFLLGKLMD | | LFPLSELVEF |
LEANEVPRPV | | TLRTNTLKTR | | RRDLAQALIN | | RGVNLDPLGK | | WSKTGLVVYD |
SSVPIGATPE | | YLAGHYMLQG | | ASSMLPVMAL | | APQEHERILD | | MCCAPGGKTS |
YMAQLMKNTG | | VILANDANAE | | RLKSVVGNLH | | RLGVTNTIIS | | HYDGRQFPKV |
VGGFDRVLLD | | APCSGTGVIS | | KDPAVKTNKD | | EKDILRCAHL | | QKELLLSAID |
SVNATSKTGG | | YLVYCTCSIT | | VEENEWVVDY | | ALKKRNVRLV | | PTGLDFGQEG |
FTRFRERRFH | | PSLRSTRRFY | | PHTHNMDGFF | | IAKFKKFSNS | | IPQSQTGNSE |
TATPTNVDLP | | QVIPKSENSS | | QPAKKAKGAA | | KTKQQLQKQQ | | HPKKASFQKL |
NGISKGADSE | | LSTVPSVTKT | | QASSSFQDSS | | QPAGKAEGIR | | EPKVTGKLKQ |
RSPKLQSSKK | | VAFLRQNAPP | | KGTDTQTPAV | | LSPSKTQATL | | KPKDHHQPLG |
RAKGVEKQQL | | PEQPFEKAAF | | QKQNDTPKGP | | QPPTVSPIRS | | SRPPPAKRKK |
SQSRGNSQLL | | LS |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесмнг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ren Y., Busch R.K., Perlaky L., Busch H. (1998). The 58-kDa microspherule protein (MSP58), a nucleolar protein, interacts with nucleolar protein p120. Eur. J. Biochem. 253: 734—742. PMID 9654073 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2530734.x
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Sloan K.E., Bohnsack M.T., Watkins N.J. (2013). The 5S RNP couples p53 homeostasis to ribosome biogenesis and nucleolar stress. Cell Rep. 5: 237—247. PMID 24120868 DOI:10.1016/j.celrep.2013.08.049
- Sharma S., Yang J., Watzinger P., Kotter P., Entian K.D. (2013). Yeast Nop2 and Rcm1 methylate C2870 and C2278 of the 25S rRNA, respectively. Nucleic Acids Res. 41: 9062—9076. PMID 23913415 DOI:10.1093/nar/gkt679
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7867 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P46087 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |