NOP56

Ідентифікатори

Символи

NOP56, NOL5A, SCA36, NOP56 ribonucleoprotein

Зовнішні ІД

OMIM: 614154 MGI: 1914384 HomoloGene: 4660 GeneCards: NOP56

Пов'язані генетичні захворювання

spinocerebellar ataxia type 36^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone methyltransferase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • snoRNA binding • RNA binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • box C/D RNP complex • sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex • small-subunit processome • pre-snoRNP complex • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • ядерце
Біологічний процес	• rRNA processing • rRNA modification • ribosome biogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10528


67134

Ensembl


ENSG00000101361


ENSMUSG00000027405

UniProt


O00567


Q9D6Z1

RefSeq (мРНК)


NM_006392


NM_024193

RefSeq (білок)


NP_006383


NP_077155

Локус (UCSC)

Хр. 20: 2.65 – 2.66 Mb

Хр. 2: 130.12 – 130.12 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NOP56 (англ. NOP56 ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 66 050^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVLLHVLFEH	AVGYALLALK	EVEEISLLQP	QVEESVLNLG	KFHSIVRLVA
FCPFASSQVA	LENANAVSEG	VVHEDLRLLL	ETHLPSKKKK	VLLGVGDPKI
GAAIQEELGY	NCQTGGVIAE	ILRGVRLHFH	NLVKGLTDLS	ACKAQLGLGH
SYSRAKVKFN	VNRVDNMIIQ	SISLLDQLDK	DINTFSMRVR	EWYGYHFPEL
VKIINDNATY	CRLAQFIGNR	RELNEDKLEK	LEELTMDGAK	AKAILDASRS
SMGMDISAID	LINIESFSSR	VVSLSEYRQS	LHTYLRSKMS	QVAPSLSALI
GEAVGARLIA	HAGSLTNLAK	YPASTVQILG	AEKALFRALK	TRGNTPKYGL
IFHSTFIGRA	AAKNKGRISR	YLANKCSIAS	RIDCFSEVPT	SVFGEKLREQ
VEERLSFYET	GEIPRKNLDV	MKEAMVQAEE	AAAEITRKLE	KQEKKRLKKE
KKRLAALALA	SSENSSSTPE	ECEEMSEKPK	KKKKQKPQEV	PQENGMEDPS
ISFSKPKKKK	SFSKEELMSS	DLEETAGSTS	IPKRKKSTPK	EETVNDPEEA
GHRSGSKKKR	KFSKEEPVSS	GPEEAVGKSS	SKKKKKFHKA	SQED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Gautier T., Berges T., Tollervey D., Hurt E. (1997). Nucleolar KKE/D repeat proteins Nop56p and Nop58p interact with Nop1p and are required for ribosome biogenesis. Mol. Cell. Biol. 17: 7088—7098. PMID 9372940 DOI:10.1128/MCB.17.12.7088
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Watkins N.J., Dickmanns A., Luhrmann R. (2002). Conserved stem II of the box C/D motif is essential for nucleolar localization and is required, along with the 15.5K protein, for the hierarchical assembly of the box C/D snoRNP. Mol. Cell. Biol. 22: 8342—8352. PMID 12417735 DOI:10.1128/MCB.22.23.8342-8352.2002
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
McKeegan K.S., Debieux C.M., Boulon S., Bertrand E., Watkins N.J. (2007). A dynamic scaffold of pre-snoRNP factors facilitates human box C/D snoRNP assembly. Mol. Cell. Biol. 27: 6782—6793. PMID 17636026 DOI:10.1128/MCB.01097-07
McKeegan K.S., Debieux C.M., Watkins N.J. (2009). Evidence that the AAA+ proteins TIP48 and TIP49 bridge interactions between 15.5K and the related NOP56 and NOP58 proteins during box C/D snoRNP biogenesis. Mol. Cell. Biol. 29: 4971—4981. PMID 19620283 DOI:10.1128/MCB.00752-09

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NOP56 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15911 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00567 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.