OTUD6B : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

OTUD6B

Ідентифікатори

Символи

OTUD6B, DUBA-5, DUBA5, CGI-77, OTU domain containing 6B, IDDFSDA, OTU deubiquitinase 6B

Зовнішні ІД

OMIM: 612021 MGI: 1919451 HomoloGene: 6064 GeneCards: OTUD6B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase
Клітинна компонента	• eukaryotic translation initiation factor 4F complex
Біологічний процес	• протеоліз • проліферація • protein deubiquitination • negative regulation of translation • proteasome assembly • positive regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51633


72201

Ensembl


ENSG00000155100


ENSMUSG00000040550

UniProt


Q8N6M0


Q8K2H2

RefSeq (мРНК)


NM_001286745 NM_016023


NM_152812

RefSeq (білок)


NP_001273674 NP_057107


NP_690025

Локус (UCSC)

Хр. 8: 91.07 – 91.09 Mb

Хр. 4: 14.81 – 14.83 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OTUD6B (англ. OTU domain containing 6B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 33 813^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAVLTEELD	EEEQLLRRHR	KEKKELQAKI	QGMKNAVPKN	DKKRRKQLTE
DVAKLEKEME	QKHREELEQL	KLTTKENKID	SVAVNISNLV	LENQPPRISK
AQKRREKKAA	LEKEREERIA	EAEIENLTGA	RHMESEKLAQ	ILAARQLEIK
QIPSDGHCMY	KAIEDQLKEK	DCALTVVALR	SQTAEYMQSH	VEDFLPFLTN
PNTGDMYTPE	EFQKYCEDIV	NTAAWGGQLE	LRALSHILQT	PIEIIQADSP
PIIVGEEYSK	KPLILVYMRH	AYGLGEHYNS	VTRLVNIVTE	NCS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24281 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8N6M0 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.