PCDH17 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDH17, PCDH68, PCH68, protocadherin 17 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611760 MGI: 2684924 HomoloGene: 8700 GeneCards: PCDH17 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane |
---|
Біологічний процес | • presynaptic active zone assembly • adult behavior • regulation of synaptic vesicle clustering • negative regulation of synaptic transmission • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • synapse assembly • synaptic membrane adhesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 57.63 – 57.73 Mb | Хр. 14: 84.68 – 84.78 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDH17 (англ. Protocadherin 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 159 амінокислот, а молекулярна маса — 126 229[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYLSICCCFL | | LWAPALTLKN | | LNYSVPEEQG | | AGTVIGNIGR | | DARLQPGLPP |
AERGGGGRSK | | SGSYRVLENS | | APHLLDVDAD | | SGLLYTKQRI | | DRESLCRHNA |
KCQLSLEVFA | | NDKEICMIKV | | EIQDINDNAP | | SFSSDQIEMD | | ISENAAPGTR |
FPLTSAHDPD | | AGENGLRTYL | | LTRDDHGLFG | | LDVKSRGDGT | | KFPELVIQKA |
LDREQQNHHT | | LVLTALDGGE | | PPRSATVQIN | | VKVIDSNDNS | | PVFEAPSYLV |
ELPENAPLGT | | VVIDLNATDA | | DEGPNGEVLY | | SFSSYVPDRV | | RELFSIDPKT |
GLIRVKGNLD | | YEENGMLEID | | VQARDLGPNP | | IPAHCKVTVK | | LIDRNDNAPS |
IGFVSVRQGA | | LSEAAPPGTV | | IALVRVTDRD | | SGKNGQLQCR | | VLGGGGTGGG |
GGLGGPGGSV | | PFKLEENYDN | | FYTVVTDRPL | | DRETQDEYNV | | TIVARDGGSP |
PLNSTKSFAI | | KILDENDNPP | | RFTKGLYVLQ | | VHENNIPGEY | | LGSVLAQDPD |
LGQNGTVSYS | | ILPSHIGDVS | | IYTYVSVNPT | | NGAIYALRSF | | NFEQTKAFEF |
KVLAKDSGAP | | AHLESNATVR | | VTVLDVNDNA | | PVIVLPTLQN | | DTAELQVPRN |
AGLGYLVSTV | | RALDSDFGES | | GRLTYEIVDG | | NDDHLFEIDP | | SSGEIRTLHP |
FWEDVTPVVE | | LVVKVTDHGK | | PTLSAVAKLI | | IRSVSGSLPE | | GVPRVNGEQH |
HWDMSLPLIV | | TLSTISIILL | | AAMITIAVKC | | KRENKEIRTY | | NCRIAEYSHP |
QLGGGKGKKK | | KINKNDIMLV | | QSEVEERNAM | | NVMNVVSSPS | | LATSPMYFDY |
QTRLPLSSPR | | SEVMYLKPAS | | NNLTVPQGHA | | GCHTSFTGQG | | TNASETPATR |
MSIIQTDNFP | | AEPNYMGSRQ | | QFVQSSSTFK | | DPERASLRDS | | GHGDSDQADS |
DQDTNKGSCC | | DMSVREALKM | | KTTSTKSQPL | | EQEPEECVNC | | TDECRVLGHS |
DRCWMPQFPA | | ANQAENADYR | | TNLFVPTVEA | | NVETETYETV | | NPTGKKTFCT |
FGKDKREHTI | | LIANVKPYLK | | AKRALSPLLQ | | EVPSASSSPT | | KACIEPCTST |
KGSLDGCEAK | | PGALAEASSQ | | YLPTDSQYLS | | PSKQPRDPPF | | MASDQMARVF |
ADVHSRASRD | | SSEMGAVLEQ | | LDHPNRDLGR | | ESVDAEEVVR | | EIDKLLQDCR |
GNDPVAVRK |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14267 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O14917 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |