PCDHA12

Ідентифікатори

Символи

PCDHA12, PCDH-ALPHA12, protocadherin alpha 12

Зовнішні ІД

OMIM: 606318 MGI: 1298408 HomoloGene: 135720 GeneCards: PCDHA12

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56137


12943

Ensembl


ENSG00000251664


ENSMUSG00000007440

UniProt


Q9UN75


Q91Y20

RefSeq (мРНК)


NM_031864 NM_018903


NM_009961

RefSeq (білок)


NP_061726 NP_114070


NP_034091

Локус (UCSC)

Хр. 5: 140.88 – 141.01 Mb

Хр. 18: 37.14 – 37.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHA12 (англ. Protocadherin alpha 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 101 652^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVIIGPRGPG	SQRLLLSLLL	LAAWEVGSGQ	LHYSVYEEAK	HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV	PRLFRVASKR	HGDLLEVNLQ	NGILFVNSRI	DREKLCGRSA
ECSIHLEVIV	DRPLQVFHVD	VEVKDINDNP	PVFREREQKV	PVSESAPLDS
HFPLEGASDA	DIGVNSLLTY	ALSLNENFEL	KIKTKKDKSI	LPELVLRKLL
DREQTPKLNL	LLMVIDGGKP	ELTGSVQIQI	TVLDVNDNGP	AFDKPSYKVV
LSENVQNDTR	VIQLNASDPD	EGLNGEISYG	IKMILPVSEK	CMFSINPDTG
EIRIYGELDF	EENNAYEIQV	NAIDKGIPSM	AGHSMVLVEV	LDVNDNVPEV
MVTSLSLPVQ	EDAQVGTVIA	LISVSDRDSG	ANGQVICSLT	PHVPFKLVST
YKNYYSLVLD	SALDRESVSA	YELVVTARDG	GSPSLWATAR	VSVEVADVND
NAPAFAQPEY	TVFVKENNPP	GCHIFTVSAW	DADAQKNALV	SYSLVERRVG
EHALSSYVSV	HAESGKVYAL	QPLDHEELEL	LQFQVSARDA	GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND	NAPALLATPA	GSAGGAVSEL	VPRSVGAGHV	VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE	LQPAAVGAHI	PFHVGLYTGE	ISTTRILDEA	DAPRHRLLVL
VKDHGEPALT	STATVLVSLV	ENGQAPKTSS	RASVGAVDPE	AALVDINVYL
IIAICAVSSL	LVLTLLLYTA	LRCSAPPTVS	RCAPGKPTLV	CSSAVGSWSY
SQQRRQRVCS	AESPPKTDLM	AFSPSLQLSR	EDCLNPPSEP	RQPNPDWRYS
ASLRAGMHSS	VHLEEAGILR	AGPGGPDQQW	PTVSSATPEP	EAGEVSPPVG
AGVNSNSWTF	KYGPGNPKQS	GPGELPDKFI	IPGSPAIISI	RQEPTNSQID
KSDFITFGKK	EETKKKKKKK	KGNKTQEKKE	KGNSTTDNSD	Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8666 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UN75 (англ.) . Архів оригіналу за 9 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.