PCDHGA11

Ідентифікатори

Символи

PCDHGA11, PCDH-GAMMA-A11, protocadherin gamma subfamily A, 11

Зовнішні ІД

OMIM: 606298 MGI: 1935228 HomoloGene: 110934 GeneCards: PCDHGA11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56105


93723

Ensembl


ENSG00000253873


ENSMUSG00000102742

UniProt


Q9Y5H2


Q91XY8

RefSeq (мРНК)


NM_032092 NM_018914 NM_032091


NM_033594

RefSeq (білок)


NP_061737 NP_114480 NP_114481


NP_291072

Локус (UCSC)

Хр. 5: 141.42 – 141.51 Mb

Хр. 18: 37.89 – 37.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHGA11 (англ. Protocadherin gamma subfamily A, 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 935 амінокислот, а молекулярна маса — 101 543^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANRLQRGDR	SRLLLLLCIF	LGTLRGFRAR	QIRYSVPEET	EKGSFVGNIS
KDLGLEPREL	AKRGVRIVSR	GKTQLFAVNP	RSGSLITAGR	IDREELCETV
SSCFLNMELL	VEDTLKIYGV	EVEIIDINDN	APSFQEDEVE	IKVSEHAIPG
ARFALPNARD	PDVGVNSLQS	YQLSPNNYFS	LQLRGRTDGA	KNPELVLEGS
LDREKEAAHL	LLLTALDGGD	PIRKGAVPIR	VVVLDVNDHI	PMFTQSVYRV
SVPENISSGT	RVLMVNATDP	DEGINGEVMY	SFRNMESKAS	EIFQLDSQTG
EVQVRGSLDF	EKYRFYEMEI	QGQDGGGLFT	TTTMLITVVD	VNDNAPEITI
TSSINSILEN	SPPGTVIALL	NVQDQDSGEN	GQVSCFIPNH	LPFKLEKTYG
NYYKLITSRV	LDRELVQSYN	ITLTATDQGS	PPLSAETHVW	LNVADDNDNP
PVFPHSSYSA	YIPENNPRGA	SIFSVTALDP	DSKQNALVTY	SLTDDTVQGV
PLSSYVSINS	NTGVLYALQS	FDYEQFRDLE	LRVIARDSGD	PPLSSNVSLS
LFVLDQNDNA	PEILYPALPT	DGSTGVELAP	RSAEPGYLVT	KVVAVDKDSG
QNAWLSYRLL	KASEPGLFAV	GEHTGEVRTA	RALLDRDALK	QSLVVAVQDH
GQPPLSATVT	LTVAVADSIP	EVLADLGSLE	SLANSETSDL	SLYLVVAVAA
VSCIFLVFVI	VLLALRLWRW	HKSRLLQASE	GGLAGMPTSH	FVGVDGVQAF
LQTYSHEVSL	IADSQKSHLI	FPQPNYGDTL	ISQESCEKSE	PLLIAEDSAI
ILGKCDPTSN	QQAPPNTDWR	FSQAQRPGTS	GSQNGDDTGT	WPNNQFDTEM
LQAMILASAS	EAADGSSTLG	GGAGTMGLSA	RYGPQFTLQH	VPDYRQNVYI
PGSNATLTNA	AGKRDGKAPA	GGNGNKKKSG	KKEKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8698 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y5H2 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.