PHC2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PHC2, EDR2, HPH2, PH2, polyhomeotic homolog 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602979 MGI: 1860454 HomoloGene: 75090 GeneCards: PHC2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • GO:0035328 Гетерохроматин • PRC1 complex • PcG protein complex • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • Сперматогенез • multicellular organism development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004427 NM_198040 NM_001330488 |
| | NM_001195083 NM_001195130 NM_018774 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001317417 NP_004418 NP_932157 |
| | NP_001182012 NP_001182059 NP_061244 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 33.32 – 33.43 Mb | Хр. 4: 128.55 – 128.65 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PHC2 (англ. Polyhomeotic homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 90 713[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MENELPVPHT | | SSSACATSST | | SGASSSSGCN | | NSSSGGSGRP | | TGPQISVYSG |
IPDRQTVQVI | | QQALHRQPST | | AAQYLQQMYA | | AQQQHLMLQT | | AALQQQHLSS |
AQLQSLAAVQ | | QASLVSNRQG | | STSGSNVSAQ | | APAQSSSINL | | AASPAAAQLL |
NRAQSVNSAA | | ASGIAQQAVL | | LGNTSSPALT | | ASQAQMYLRA | | QMLIFTPTAT |
VATVQPELGT | | GSPARPPTPA | | QVQNLTLRTQ | | QTPAAAASGP | | TPTQPVLPSL |
ALKPTPGGSQ | | PLPTPAQSRN | | TAQASPAGAK | | PGIADSVMEP | | HKKGDGNSSV |
PGSMEGRAGL | | SRTVPAVAAH | | PLIAPAYAQL | | QPHQLLPQPS | | SKHLQPQFVI |
QQQPQPQQQQ | | PPPQQSRPVL | | QAEPHPQLAS | | VSPSVALQPS | | SEAHAMPLGP |
VTPALPLQCP | | TANLHKPGGS | | QQCHPPTPDT | | GPQNGHPEGV | | PHTPQRRFQH |
TSAVILQLQP | | ASPPQQCVPD | | DWKEVAPGEK | | SVPETRSGPS | | PHQQAIVTAM |
PGGLPVPTSP | | NIQPSPAHET | | GQGIVHALTD | | LSSPGMTSGN | | GNSASSIAGT |
APQNGENKPP | | QAIVKPQILT | | HVIEGFVIQE | | GAEPFPVGRS | | SLLVGNLKKK |
YAQGFLPEKL | | PQQDHTTTTD | | SEMEEPYLQE | | SKEEGAPLKL | | KCELCGRVDF |
AYKFKRSKRF | | CSMACAKRYN | | VGCTKRVGLF | | HSDRSKLQKA | | GAATHNRRRA |
SKASLPPLTK | | DTKKQPTGTV | | PLSVTAALQL | | THSQEDSSRC | | SDNSSYEEPL |
SPISASSSTS | | RRRQGQRDLE | | LPDMHMRDLV | | GMGHHFLPSE | | PTKWNVEDVY |
EFIRSLPGCQ | | EIAEEFRAQE | | IDGQALLLLK | | EDHLMSAMNI | | KLGPALKIYA |
RISMLKDS |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Tonkin E., Hagan D.-M., Li W., Strachan T. (2002). Identification and characterisation of novel mammalian homologues of Drosophila polyhomeotic permits new insights into relationships between members of the polyhomeotic family. Hum. Genet. 111: 435—442. PMID 12384788 DOI:10.1007/s00439-002-0814-3
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
- Yannoni Y.M., Gaestel M., Lin L.L. (2004). P66(ShcA) interacts with MAPKAP kinase 2 and regulates its activity. FEBS Lett. 564: 205—211. PMID 15094067 DOI:10.1016/S0014-5793(04)00351-5
- Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3183 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8IXK0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |