PIDD1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2OF5

Ідентифікатори

Символи

PIDD1, LRDD, PIDD, p53-induced death domain protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605247 MGI: 1889507 HomoloGene: 11220 GeneCards: PIDD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• death receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • volume-sensitive anion channel activity • endopeptidase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • іонні канали
Біологічний процес	• positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of apoptotic signaling pathway • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of apoptotic process • regulation of apoptotic process • inorganic anion transport • anion transmembrane transport • protein autoprocessing • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • apoptotic signaling pathway • extrinsic apoptotic signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55367


57913

Ensembl


ENSG00000177595


ENSMUSG00000025507

UniProt


Q9HB75


Q9ERV7

RefSeq (мРНК)


NM_018494 NM_145886 NM_145887


NM_022654 NM_001360523 NM_001360524

RefSeq (білок)


NP_665893 NP_665894


NP_073145 NP_001347452 NP_001347453

Локус (UCSC)

Хр. 11: 0.8 – 0.81 Mb

Хр. 7: 141.02 – 141.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PIDD1 (англ. P53-induced death domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 910 амінокислот, а молекулярна маса — 99 712^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAATVEGPEL	EAAAAAGDAS	EDSDAGSRAL	PFLGGNRLSL	DLYPGGCQQL
LHLCVQQPLQ	LLQVEFLRLS	THEDPQLLEA	TLAQLPQSLS	CLRSLVLKGG
QRRDTLGACL	RGALTNLPAG	LSGLAHLAHL	DLSFNSLETL	PACVLQMRGL
GALLLSHNCL	SELPEALGAL	PALTFLTVTH	NRLQTLPPAL	GALSTLQRLD
LSQNLLDTLP	PEIGGLGSLL	ELNLASNRLQ	SLPASLAGLR	SLRLLVLHSN
LLASVPADLA	RLPLLTRLDL	RDNQLRDLPP	ELLDAPFVRL	QGNPLGEASP
DAPSSPVAAL	IPEMPRLFLT	SDLDSFPVTP	QGCSVTLACG	VRLQFPAGAT
ATPITIRYRL	LLPEPGLVPL	GPHDALLSHV	LELQPHGVAF	QQDVGLWLLF
TPPQARRCRE	VVVRTRNDNS	WGDLETYLEE	EAPQRLWAHC	QVPHFSWFLV
VSRPVSNACL	VPPEGTLLCS	SGHPGVKVIF	PPGATEEPRR	VSMQVVRMAG
RELQALLGEP	EAAVSPLLCL	SQSGPPSFLQ	PVTVQLPLPS	GITGLSLDRS
RLHLLYWAPP	AATWDDITAQ	VVLELTHLYA	RFQVTHFSWY	WLWYTTKNCV
GGLARKAWER	LRLHRVNLIA	LQRRRDPEQV	LLQCLPRNKV	DATLRRLLER
YRGPEPSDTV	EMFEGEEFFA	AFERGIDVDA	DRPDCVEGRI	CFVFYSHLKN
VKEVYVTTTL	DREAQAVRGQ	VSFYRGAVPV	RVPEEAEAAR	QRKGADALWM
ATLPIKLPRL	RGSEGPRRGA	GLSLAPLNLG	DAETGFLTQS	NLLSVAGRLG
LDWPAVALHL	GVSYREVQRI	RHEFRDDLDE	QIRHMLFSWA	ERQAGQPGAV
GLLVQALEQS	DRQDVAEEVR	AVLELGRRKY	QDSIRRMGLA	PKDPALPGSS
APQPPEPAQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Telliez J.-B., Bean K.M., Lin L.-L. (2000). LRDD, a novel leucine rich repeat and death domain containing protein. Biochim. Biophys. Acta. 1478: 280—288. PMID 10825539 DOI:10.1016/S0167-4838(00)00029-7
Lin Y., Ma W., Benchimol S. (2000). Pidd, a new death-domain-containing protein, is induced by p53 and promotes apoptosis. Nat. Genet. 26: 122—127. PMID 10973264 DOI:10.1038/79102
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tinel A., Tschopp J. (2004). The PIDDosome, a protein complex implicated in activation of caspase-2 in response to genotoxic stress. Science. 304: 843—846. PMID 15073321 DOI:10.1126/science.1095432
Janssens S., Tinel A., Lippens S., Tschopp J. (2005). PIDD mediates NF-kappaB activation in response to DNA damage. Cell. 123: 1079—1092. PMID 16360037 DOI:10.1016/j.cell.2005.09.036
Vakifahmetoglu H., Olsson M., Orrenius S., Zhivotovsky B. (2006). Functional connection between p53 and caspase-2 is essential for apoptosis induced by DNA damage. Oncogene. 25: 5683—5692. PMID 16652156 DOI:10.1038/sj.onc.1209569

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16491 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9HB75 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.