PITPNM1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PITPNM1, DRES9, NIR2, PITPNM, RDGB, RDGB1, RDGBA, RDGBA1, Rd9, phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608794 MGI: 1197524 HomoloGene: 3608 GeneCards: PITPNM1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • phosphatidylinositol transfer activity • phosphatidylcholine binding • phosphatidylinositol binding • phosphatidic acid binding • phospholipid transporter activity • calcium ion binding • receptor tyrosine kinase binding • phosphatidylcholine transporter activity |
---|
Клітинна компонента | • Golgi cisterna membrane • lipid droplet • комплекс Ґольджі • midbody • Борозна розщеплення • внутрішньоклітинний • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • цитоплазма • гіалоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • центр організації мікротрубочок • cell body |
---|
Біологічний процес | • protein transport • brain development • lipid metabolism • phototransduction • phosphatidylinositol biosynthetic process • phospholipid transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 67.49 – 67.51 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PITPNM1 (англ. Phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 244 амінокислот, а молекулярна маса — 134 848[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLIKEYHILL | | PMSLDEYQVA | | QLYMIQKKSR | | EESSGEGSGV | | EILANRPYTD |
GPGGSGQYTH | | KVYHVGSHIP | | GWFRALLPKA | | ALQVEEESWN | | AYPYTRTRYT |
CPFVEKFSIE | | IETYYLPDGG | | QQPNVFNLSG | | AERRQRILDT | | IDIVRDAVAP |
GEYKAEEDPR | | LYHSVKTGRG | | PLSDDWARTA | | AQTGPLMCAY | | KLCKVEFRYW |
GMQAKIEQFI | | HDVGLRRVML | | RAHRQAWCWQ | | DEWTELSMAD | | IRALEEETAR |
MLAQRMAKCN | | TGSEGSEAQP | | PGKPSTEARS | | AASNTGTPDG | | PEAPPGPDAS |
PDASFGKQWS | | SSSRSSYSSQ | | HGGAVSPQSL | | SEWRMQNIAR | | DSENSSEEEF |
FDAHEGFSDS | | EEVFPKEMTK | | WNSNDFIDAF | | ASPVEAEGTP | | EPGAEAAKGI |
EDGAQAPRDS | | EGLDGAGELG | | AEACAVHALF | | LILHSGNILD | | SGPGDANSKQ |
ADVQTLSSAF | | EAVTRIHFPE | | ALGHVALRLV | | PCPPICAAAY | | ALVSNLSPYS |
HDGDSLSRSQ | | DHIPLAALPL | | LATSSSRYQG | | AVATVIARTN | | QAYSAFLRSP |
EGAGFCGQVA | | LIGDGVGGIL | | GFDALCHSAN | | AGTGSRGSSR | | RGSMNNELLS |
PEFGPVRDPL | | ADGVEGLGRG | | SPEPSALPPQ | | RIPSDMASPE | | PEGSQNSLQA |
APATTSSWEP | | RRASTAFCPP | | AASSEAPDGP | | SSTARLDFKV | | SGFFLFGSPL |
GLVLALRKTV | | MPALEAAQMR | | PACEQIYNLF | | HAADPCASRL | | EPLLAPKFQA |
IAPLTVPRYQ | | KFPLGDGSSL | | LLADTLQTHS | | SLFLEELEML | | VPSTPTSTSG |
AFWKGSELAT | | DPPAQPAAPS | | TTSEVVKILE | | RWWGTKRIDY | | SLYCPEALTA |
FPTVTLPHLF | | HASYWESADV | | VAFILRQVIE | | KERPQLAECE | | EPSIYSPAFP |
REKWQRKRTQ | | VKIRNVTSNH | | RASDTVVCEG | | RPQVLSGRFM | | YGPLDVVTLT |
GEKVDVYIMT | | QPLSGKWIHF | | GTEVTNSSGR | | LTFPVPPERA | | LGIGVYPVRM |
VVRGDHTYAE | | CCLTVVARGT | | EAVVFSIDGS | | FTASVSIMGS | | DPKVRAGAVD |
VVRHWQDSGY | | LIVYVTGRPD | | MQKHRVVAWL | | SQHNFPHGVV | | SFCDGLTHDP |
LRQKAMFLQS | | LVQEVELNIV | | AGYGSPKDVA | | VYAALGLSPS | | QTYIVGRAVR |
KLQAQCQFLS | | DGYVAHLGQL | | EAGSHSHASS | | GPPRAALGKS | | SYGVAAPVDF |
LRKQSQLLRS | | RGPSQAEREG | | PGTPPTTLAR | | GKARSISLKL | | DSEE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, ліпідних краплях, апараті гольджі.
Література
- Ocaka L., Spalluto C., Wilson D.I., Hunt D.M., Halford S. (2005). Chromosomal localization, genomic organization and evolution of the genes encoding human phosphatidylinositol transfer protein membrane-associated (PITPNM) 1, 2 and 3. Cytogenet. Genome Res. 108: 293—302. PMID 15627748 DOI:10.1159/000081519
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tian D., Litvak V., Toledo-Rodriguez M., Carmon S., Lev S. (2002). Nir2, a novel regulator of cell morphogenesis. Mol. Cell. Biol. 22: 2650—2662. PMID 11909959 DOI:10.1128/MCB.22.8.2650-2662.2002
- Amarilio R., Ramachandran S., Sabanay H., Lev S. (2005). Differential regulation of endoplasmic reticulum structure through VAP-Nir protein interaction. J. Biol. Chem. 280: 5934—5944. PMID 15545272 DOI:10.1074/jbc.M409566200
- Litvak V., Dahan N., Ramachandran S., Sabanay H., Lev S. (2005). Maintenance of the diacylglycerol level in the Golgi apparatus by the Nir2 protein is critical for Golgi secretory function. Nat. Cell Biol. 7: 225—234. PMID 15723057 DOI:10.1038/ncb1221
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9003 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O00562 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |