PNKP |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2BRF, 2W3O | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PNKP, EIEE10, MCSZ, PNK, AOA4, polynucleotide kinase 3'-phosphatase, CMT2B2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605610 MGI: 1891698 HomoloGene: 5247 GeneCards: PNKP |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
spinocerebellar ataxia with axonal neuropathy type 2[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • polydeoxyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity • kinase activity • damaged DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • purine nucleotide binding • endonuclease activity • double-stranded DNA binding • hydrolase activity • ATP binding • polynucleotide 3'-phosphatase activity • nucleoside monophosphate kinase activity • polynucleotide kinase activity |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • мітохондрія |
---|
Біологічний процес | • DNA-dependent DNA replication • nucleotide-excision repair, DNA damage removal • positive regulation of telomere capping • фосфорилювання • positive regulation of telomere maintenance via telomerase • GO:0001306 response to oxidative stress • cellular response to DNA damage stimulus • nucleotide phosphorylation • positive regulation of telomerase activity • response to radiation • обмін речовин • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • polynucleotide 3' dephosphorylation • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • negative regulation of protein ADP-ribosylation • nucleoside monophosphate phosphorylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001290764 NM_001290766 NM_001290767 NM_021549 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 49.86 – 49.88 Mb | Хр. 7: 44.51 – 44.51 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PNKP (англ. Polynucleotide kinase 3'-phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 521 амінокислот, а молекулярна маса — 57 076[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGEVEAPGRL | | WLESPPGGAP | | PIFLPSDGQA | | LVLGRGPLTQ | | VTDRKCSRTQ |
VELVADPETR | | TVAVKQLGVN | | PSTTGTQELK | | PGLEGSLGVG | | DTLYLVNGLH |
PLTLRWEETR | | TPESQPDTPP | | GTPLVSQDEK | | RDAELPKKRM | | RKSNPGWENL |
EKLLVFTAAG | | VKPQGKVAGF | | DLDGTLITTR | | SGKVFPTGPS | | DWRILYPEIP |
RKLRELEAEG | | YKLVIFTNQM | | SIGRGKLPAE | | EFKAKVEAVV | | EKLGVPFQVL |
VATHAGLYRK | | PVTGMWDHLQ | | EQANDGTPIS | | IGDSIFVGDA | | AGRPANWAPG |
RKKKDFSCAD | | RLFALNLGLP | | FATPEEFFLK | | WPAAGFELPA | | FDPRTVSRSG |
PLCLPESRAL | | LSASPEVVVA | | VGFPGAGKST | | FLKKHLVSAG | | YVHVNRDTLG |
SWQRCVTTCE | | TALKQGKRVA | | IDNTNPDAAS | | RARYVQCARA | | AGVPCRCFLF |
TATLEQARHN | | NRFREMTDSS | | HIPVSDMVMY | | GYRKQFEAPT | | LAEGFSAILE |
IPFRLWVEPR | | LGRLYCQFSE | | G |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ali A.A., Jukes R.M., Pearl L.H., Oliver A.W. (2009). Specific recognition of a multiply phosphorylated motif in the DNA repair scaffold XRCC1 by the FHA domain of human PNK. Nucleic Acids Res. 37: 1701—1712. PMID 19155274 DOI:10.1093/nar/gkn1086
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PNKP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9154 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q96T60 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |