POLR2J : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

POLR2J

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5FLM, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6

Ідентифікатори

Символи

POLR2J, POLR2J1, RPB11, RPB11A, RPB11m, hRPB14, polymerase (RNA) II subunit J, RNA polymerase II subunit J

Зовнішні ІД

OMIM: 604150 MGI: 109582 HomoloGene: 4542 GeneCards: POLR2J

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • LRR domain binding • protein dimerization activity • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро • РНК-полімераза II
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • RNA metabolic process • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • positive regulation of viral transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5439


20022

Ensembl


ENSG00000005075


ENSMUSG00000039771

UniProt


P52435


O08740

RefSeq (мРНК)


NM_006234 NM_001371100 NM_001393919


NM_011293

RefSeq (білок)


NP_006225 NP_001358029


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 7: 102.47 – 102.48 Mb

Хр. 5: 136.15 – 136.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POLR2J (англ. RNA polymerase II subunit J) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 117 амінокислот, а молекулярна маса — 13 293^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNAPPAFESF	LLFEGEKKIT	INKDTKVPNA	CLFTINKEDH	TLGNIIKSQL
LKDPQVLFAG	YKVPHPLEHK	IIIRVQTTPD	YSPQEAFTNA	ITDLISELSL
LEERFRVAIK	DKQEGIE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9197 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P52435 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.