PRPF4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1MZW, 3JCR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PRPF4, HPRP4, HPRP4P, PRP4, Prp4p, RP70, SNRNP60, pre-mRNA processing factor 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607795 MGI: 1917302 HomoloGene: 3446 GeneCards: PRPF4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
retinitis pigmentosa 70[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • U4 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • U6 snRNA binding |
---|
Клітинна компонента | • Тільце Кахаля • nuclear speck • spliceosomal complex • spliceosomal snRNP complex • U4/U6 snRNP • нуклеоплазма • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • клітинне ядро • U2-type precatalytic spliceosome |
---|
Біологічний процес | • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001244926 NM_004697 NM_001322266 NM_001322267 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001231855 NP_001309195 NP_001309196 NP_004688 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 113.28 – 113.29 Mb | Хр. 4: 62.33 – 62.35 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PRPF4 (англ. Pre-mRNA processing factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 58 449[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASSRASSTQ | | ATKTKAPDDL | | VAPVVKKPHI | | YYGSLEEKER | | ERLAKGESGI |
LGKDGLKAGI | | EAGNINITSG | | EVFEIEEHIS | | ERQAEVLAEF | | ERRKRARQIN |
VSTDDSEVKA | | CLRALGEPIT | | LFGEGPAERR | | ERLRNILSVV | | GTDALKKTKK |
DDEKSKKSKE | | EYQQTWYHEG | | PNSLKVARLW | | IANYSLPRAM | | KRLEEARLHK |
EIPETTRTSQ | | MQELHKSLRS | | LNNFCSQIGD | | DRPISYCHFS | | PNSKMLATAC |
WSGLCKLWSV | | PDCNLLHTLR | | GHNTNVGAIV | | FHPKSTVSLD | | PKDVNLASCA |
ADGSVKLWSL | | DSDEPVADIE | | GHTVRVARVM | | WHPSGRFLGT | | TCYDRSWRLW |
DLEAQEEILH | | QEGHSMGVYD | | IAFHQDGSLA | | GTGGLDAFGR | | VWDLRTGRCI |
MFLEGHLKEI | | YGINFSPNGY | | HIATGSGDNT | | CKVWDLRQRR | | CVYTIPAHQN |
LVTGVKFEPI | | HGNFLLTGAY | | DNTAKIWTHP | | GWSPLKTLAG | | HEGKVMGLDI |
SSDGQLIATC | | SYDRTFKLWM | | AE |
Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Horowitz D.S., Krainer A.R. (1997). A human protein required for the second step of pre-mRNA splicing is functionally related to a yeast splicing factor. Genes Dev. 11: 139—151. PMID 9000057 DOI:10.1101/gad.11.1.139
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
- Horowitz D.S., Kobayashi R., Krainer A.R. (1997). A new cyclophilin and the human homologues of yeast Prp3 and Prp4 form a complex associated with U4/U6 snRNPs. RNA. 3: 1374—1387. PMID 9404889
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRPF4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17349 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O43172 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |