PSMD4

PSMD4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1P9C, 1P9D, 1UEL, 1YX4, 1YX5, 1YX6, 2KDE, 2KDF

Ідентифікатори
Символи PSMD4, AF, AF-1, ASF, MCB1, Rpn10, S5A, pUB-R5, proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, proteasome 26S subunit ubiquitin receptor, non-ATPase 4
Зовнішні ІД OMIM: 601648 MGI: 1201670 HomoloGene: 55691 GeneCards: PSMD4
Онтологія гена
Молекулярна функція

polyubiquitin modification-dependent protein binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
identical protein binding
RNA binding

Клітинна компонента

нуклеоплазма
Протеасома
клітинне ядро
гіалоплазма
proteasome accessory complex
proteasome regulatory particle, base subcomplex

Біологічний процес

regulation of cellular amino acid metabolic process
antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent
regulation of mRNA stability
positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
protein polyubiquitination
stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
MAPK cascade
Fc-epsilon receptor signaling pathway
NIK/NF-kappaB signaling
anaphase-promoting complex-dependent catabolic process
T cell receptor signaling pathway
negative regulation of canonical Wnt signaling pathway
proteasome assembly
proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway
negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle
protein deubiquitination
SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
трансмембранний транспорт
regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia
посттрансляційна модифікація
regulation of hematopoietic stem cell differentiation
ubiquitin-dependent protein catabolic process
interleukin-1-mediated signaling pathway
regulation of mitotic cell cycle phase transition

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5710
19185
Ensembl
ENSG00000159352
ENSMUSG00000005625
UniProt
P55036
O35226
RefSeq (мРНК)
NM_002810
NM_153822
NM_001330692
NM_001282017
NM_008951
RefSeq (білок)
NP_001317621
NP_002801
NP_001268946
NP_032977
Локус (UCSC) Хр. 1: 151.25 – 151.27 Mb Хр. 3: 94.94 – 94.95 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PSMD4 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 377 амінокислот, а молекулярна маса — 40 737[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVLESTMVCVDNSEYMRNGDFLPTRLQAQQDAVNIVCHSKTRSNPENNVG
LITLANDCEVLTTLTPDTGRILSKLHTVQPKGKITFCTGIRVAHLALKHR
QGKNHKMRIIAFVGSPVEDNEKDLVKLAKRLKKEKVNVDIINFGEEEVNT
EKLTAFVNTLNGKDGTGSHLVTVPPGPSLADALISSPILAGEGGAMLGLG
ASDFEFGVDPSADPELALALRVSMEEQRQRQEEEARRAAAASAAEAGIAT
TGTEDSDDALLKMTISQQEFGRTGLPDLSSMTEEEQIAYAMQMSLQGAEF
GQAESADIDASSAMDTSEPAKEEDDYDVMQDPEFLQSVLENLPGVDPNNE
AIRNAMGSLASQATKDGKKDKKEEDKK

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.

Література

  • Ferrell K., Deveraux Q., van Nocker S., Rechsteiner M. (1996). Molecular cloning and expression of a multiubiquitin chain binding subunit of the human 26S protease. FEBS Lett. 381: 143—148. PMID 8641424 DOI:10.1016/0014-5793(96)00101-9
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Young P., Deveraux Q., Beal R.E., Pickart C.M., Rechsteiner M. (1998). Characterization of two polyubiquitin binding sites in the 26 S protease subunit 5a. J. Biol. Chem. 273: 5461—5467. PMID 9488668 DOI:10.1074/jbc.273.10.5461
  • Kamitani T., Kito K., Fukuda-Kamitani T., Yeh E.T.H. (2001). Targeting of NEDD8 and its conjugates for proteasomal degradation by NUB1. J. Biol. Chem. 276: 46655—46660. PMID 11585840 DOI:10.1074/jbc.M108636200
  • Ko H.S., Uehara T., Tsuruma K., Nomura Y. (2004). Ubiquilin interacts with ubiquitylated proteins and proteasome through its ubiquitin-associated and ubiquitin-like domains. FEBS Lett. 566: 110—114. PMID 15147878 DOI:10.1016/j.febslet.2004.04.031
  • Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9561 (англ.) . Архів оригіналу за 29 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
  4. UniProt, P55036 (англ.) . Архів оригіналу за 11 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»