| PTPRS |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 2FH7, 2YD2, 2YD3, 2YD9, 4BPC, 4PBX | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | PTPRS, PTPSIGMA, protein tyrosine phosphatase, receptor type S, R-PTP-S, R-PTP-sigma, protein tyrosine phosphatase receptor type S |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 601576 MGI: 97815 HomoloGene: 20626 GeneCards: PTPRS |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• hydrolase activity
• phosphoprotein phosphatase activity
• protein tyrosine phosphatase activity
• heparin binding
• chondroitin sulfate binding
• heparan sulfate proteoglycan binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• integral component of plasma membrane
• екзосома
• мембрана
• клітинна мембрана
• integral component of synaptic vesicle membrane
• integral component of postsynaptic density membrane
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• міжклітинні контакти
• аксон
• synaptic vesicle membrane
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• cell projection
• neuron projection
• перикаріон
• синапс
• postsynaptic membrane
• Schaffer collateral - CA1 synapse
• glutamatergic synapse
• integral component of presynaptic membrane
|
|---|
| Біологічний процес | • адгезія клітин
• GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання
• GO:0016576 protein dephosphorylation
• negative regulation of interferon-alpha production
• negative regulation of interferon-beta production
• negative regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway
• negative regulation of neuron projection development
• spinal cord development
• cerebellum development
• hippocampus development
• cerebral cortex development
• corpus callosum development
• negative regulation of axon extension
• peptidyl-tyrosine dephosphorylation
• negative regulation of collateral sprouting
• negative regulation of axon regeneration
• negative regulation of dendritic spine development
• establishment of endothelial intestinal barrier
• modulation of chemical synaptic transmission
• synapse organization
• regulation of postsynaptic density assembly
• synaptic membrane adhesion
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | NM_002850
NM_130853
NM_130854
NM_130855
NM_001394011
| NM_001394012
NM_001394013 |
| | NM_001252453
NM_001252455
NM_001252456
NM_011218 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_002841
NP_570923
NP_570924
NP_570925 |
| | NP_001239382
NP_001239384
NP_001239385
NP_035348 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 19: 5.16 – 5.34 Mb | Хр. 17: 56.72 – 56.78 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PTPRS (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type S) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 948 амінокислот, а молекулярна маса — 217 041[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MAPTWGPGMV | | SVVGPMGLLV | | VLLVGGCAAE | | EPPRFIKEPK | | DQIGVSGGVA |
| SFVCQATGDP | | KPRVTWNKKG | | KKVNSQRFET | | IEFDESAGAV | | LRIQPLRTPR |
| DENVYECVAQ | | NSVGEITVHA | | KLTVLREDQL | | PSGFPNIDMG | | PQLKVVERTR |
| TATMLCAASG | | NPDPEITWFK | | DFLPVDPSAS | | NGRIKQLRSE | | TFESTPIRGA |
| LQIESSEETD | | QGKYECVATN | | SAGVRYSSPA | | NLYVRELREV | | RRVAPRFSIL |
| PMSHEIMPGG | | NVNITCVAVG | | SPMPYVKWMQ | | GAEDLTPEDD | | MPVGRNVLEL |
| TDVKDSANYT | | CVAMSSLGVI | | EAVAQITVKS | | LPKAPGTPMV | | TENTATSITI |
| TWDSGNPDPV | | SYYVIEYKSK | | SQDGPYQIKE | | DITTTRYSIG | | GLSPNSEYEI |
| WVSAVNSIGQ | | GPPSESVVTR | | TGEQAPASAP | | RNVQARMLSA | | TTMIVQWEEP |
| VEPNGLIRGY | | RVYYTMEPEH | | PVGNWQKHNV | | DDSLLTTVGS | | LLEDETYTVR |
| VLAFTSVGDG | | PLSDPIQVKT | | QQGVPGQPMN | | LRAEARSETS | | ITLSWSPPRQ |
| ESIIKYELLF | | REGDHGREVG | | RTFDPTTSYV | | VEDLKPNTEY | | AFRLAARSPQ |
| GLGAFTPVVR | | QRTLQSKPSA | | PPQDVKCVSV | | RSTAILVSWR | | PPPPETHNGA |
| LVGYSVRYRP | | LGSEDPEPKE | | VNGIPPTTTQ | | ILLEALEKWT | | QYRITTVAHT |
| EVGPGPESSP | | VVVRTDEDVP | | SAPPRKVEAE | | ALNATAIRVL | | WRSPAPGRQH |
| GQIRGYQVHY | | VRMEGAEARG | | PPRIKDVMLA | | DAQWETDDTA | | EYEMVITNLQ |
| PETAYSITVA | | AYTMKGDGAR | | SKPKVVVTKG | | AVLGRPTLSV | | QQTPEGSLLA |
| RWEPPAGTAE | | DQVLGYRLQF | | GREDSTPLAT | | LEFPPSEDRY | | TASGVHKGAT |
| YVFRLAARSR | | GGLGEEAAEV | | LSIPEDTPRG | | HPQILEAAGN | | ASAGTVLLRW |
| LPPVPAERNG | | AIVKYTVAVR | | EAGALGPARE | | TELPAAAEPG | | AENALTLQGL |
| KPDTAYDLQV | | RAHTRRGPGP | | FSPPVRYRTF | | LRDQVSPKNF | | KVKMIMKTSV |
| LLSWEFPDNY | | NSPTPYKIQY | | NGLTLDVDGR | | TTKKLITHLK | | PHTFYNFVLT |
| NRGSSLGGLQ | | QTVTAWTAFN | | LLNGKPSVAP | | KPDADGFIMV | | YLPDGQSPVP |
| VQSYFIVMVP | | LRKSRGGQFL | | TPLGSPEDMD | | LEELIQDISR | | LQRRSLRHSR |
| QLEVPRPYIA | | ARFSVLPPTF | | HPGDQKQYGG | | FDNRGLEPGH | | RYVLFVLAVL |
| QKSEPTFAAS | | PFSDPFQLDN | | PDPQPIVDGE | | EGLIWVIGPV | | LAVVFIICIV |
| IAILLYKNKP | | DSKRKDSEPR | | TKCLLNNADL | | APHHPKDPVE | | MRRINFQTPD |
| SGLRSPLREP | | GFHFESMLSH | | PPIPIADMAE | | HTERLKANDS | | LKLSQEYESI |
| DPGQQFTWEH | | SNLEVNKPKN | | RYANVIAYDH | | SRVILQPIEG | | IMGSDYINAN |
| YVDGYRCQNA | | YIATQGPLPE | | TFGDFWRMVW | | EQRSATIVMM | | TRLEEKSRIK |
| CDQYWPNRGT | | ETYGFIQVTL | | LDTIELATFC | | VRTFSLHKNG | | SSEKREVRQF |
| QFTAWPDHGV | | PEYPTPFLAF | | LRRVKTCNPP | | DAGPIVVHCS | | AGVGRTGCFI |
| VIDAMLERIK | | PEKTVDVYGH | | VTLMRSQRNY | | MVQTEDQYSF | | IHEALLEAVG |
| CGNTEVPARS | | LYAYIQKLAQ | | VEPGEHVTGM | | ELEFKRLANS | | KAHTSRFISA |
| NLPCNKFKNR | | LVNIMPYEST | | RVCLQPIRGV | | EGSDYINASF | | IDGYRQQKAY |
| IATQGPLAET | | TEDFWRMLWE | | NNSTIVVMLT | | KLREMGREKC | | HQYWPAERSA |
| RYQYFVVDPM | | AEYNMPQYIL | | REFKVTDARD | | GQSRTVRQFQ | | FTDWPEQGVP |
| KSGEGFIDFI | | GQVHKTKEQF | | GQDGPISVHC | | SAGVGRTGVF | | ITLSIVLERM |
| RYEGVVDIFQ | | TVKMLRTQRP | | AMVQTEDEYQ | | FCYQAALEYL | | GSFDHYAT |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах, синаптосомах[en].
Література
- Pulido R., Serra-Pages C., Tang M., Streuli M. (1995). The LAR/PTP delta/PTP sigma subfamily of transmembrane protein-tyrosine-phosphatases: multiple human LAR, PTP delta, and PTP sigma isoforms are expressed in a tissue-specific manner and associate with the LAR-interacting protein LIP.1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11686—11690. PMID 8524829 DOI:10.1073/pnas.92.25.11686
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
- Jeon T.J., Chien P.N., Chun H.J., Ryu S.E. (2013). Structure of the catalytic domain of protein tyrosine phosphatase sigma in the sulfenic acid form. Mol. Cells. 36: 55—61. PMID 23820885 DOI:10.1007/s10059-013-0033-x
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9681 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13332 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
