RAB3IP |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4LHX, 4LHY, 4LHZ, 4UJ3, 4UJ4, 4UJ5 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAB3IP, RABIN3, RABIN8, RAB3A interacting protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608686 MGI: 105933 HomoloGene: 32340 GeneCards: RAB3IP |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ciliary basal body • гіалоплазма • центросома • cell projection • цитоскелет • lamellipodium • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • protein localization to organelle • protein transport • Golgi to plasma membrane transport • protein targeting to membrane • cilium assembly • ciliary basal body-plasma membrane docking |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001024647 NM_001278402 NM_022456 NM_175623 NM_175624
| NM_175625 NM_175626 NM_175627 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001019818 NP_001265331 NP_071901 NP_783322 NP_783323
| NP_783324 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 69.74 – 69.82 Mb | Хр. 10: 116.74 – 116.79 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAB3IP (англ. RAB3A interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 53 021[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGLKKMKGLS | | YDEAFAMAND | | PLEGFHEVNL | | ASPTSPDLLG | | VYESGTQEQT |
TSPSVIYRPH | | PSALSSVPIQ | | ANALDVSELP | | TQPVYSSPRR | | LNCAEISSIS |
FHVTDPAPCS | | TSGVTAGLTK | | LTTRKDNYNA | | EREFLQGATI | | TEACDGSDDI |
FGLSTDSLSR | | LRSPSVLEVR | | EKGYERLKEE | | LAKAQRELKL | | KDEECERLSK |
VRDQLGQELE | | ELTASLFEEA | | HKMVREANIK | | QATAEKQLKE | | AQGKIDVLQA |
EVAALKTLVL | | SSSPTSPTQE | | PLPGGKTPFK | | KGHTRNKSTS | | SAMSGSHQDL |
SVIQPIVKDC | | KEADLSLYNE | | FRLWKDEPTM | | DRTCPFLDKI | | YQEDIFPCLT |
FSKSELASAV | | LEAVENNTLS | | IEPVGLQPIR | | FVKASAVECG | | GPKKCALTGQ |
SKSCKHRIKL | | GDSSNYYYIS | | PFCRYRITSV | | CNFFTYIRYI | | QQGLVKQQDV |
DQMFWEVMQL | | RKEMSLAKLG | | YFKEEL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.
Література
- Hattula K., Furuhjelm J., Arffman A., Peranen J. (2002). A Rab8-specific GDP/GTP exchange factor is involved in actin remodeling and polarized membrane transport. Mol. Biol. Cell. 13: 3268—3280. PMID 12221131 DOI:10.1091/mbc.E02-03-0143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yoshimura S., Gerondopoulos A., Linford A., Rigden D.J., Barr F.A. (2010). Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors. J. Cell Biol. 191: 367—381. PMID 20937701 DOI:10.1083/jcb.201008051
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16508 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96QF0 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |