RAD23B |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/15/Protein_RAD23B_PDB_1dv0.png/250px-Protein_RAD23B_PDB_1dv0.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1P1A, 1PVE, 1UEL | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAD23B, HHR23B, HR23B, P58, RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600062 MGI: 105128 HomoloGene: 37704 GeneCards: RAD23B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • single-stranded DNA binding • damaged DNA binding • polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin binding • proteasome binding |
---|
Клітинна компонента | • XPC complex • Протеасома • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • cellular response to DNA damage stimulus • nucleotide-excision repair • global genome nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • Сперматогенез • embryonic organ development • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • згортання білків • protein deubiquitination • cellular response to interleukin-7 • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ee/PBB_GE_RAD23B_201222_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAD23B_201222_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/78/PBB_GE_RAD23B_201223_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAD23B_201223_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_002874 NM_001244713 NM_001244724 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001231642 NP_001231653 NP_002865 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 107.28 – 107.33 Mb | Хр. 4: 55.35 – 55.39 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAD23B (англ. RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 409 амінокислот, а молекулярна маса — 43 171[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQVTLKTLQQ | | QTFKIDIDPE | | ETVKALKEKI | | ESEKGKDAFP | | VAGQKLIYAG |
KILNDDTALK | | EYKIDEKNFV | | VVMVTKPKAV | | STPAPATTQQ | | SAPASTTAVT |
SSTTTTVAQA | | PTPVPALAPT | | STPASITPAS | | ATASSEPAPA | | SAAKQEKPAE |
KPAETPVATS | | PTATDSTSGD | | SSRSNLFEDA | | TSALVTGQSY | | ENMVTEIMSM |
GYEREQVIAA | | LRASFNNPDR | | AVEYLLMGIP | | GDRESQAVVD | | PPQAASTGAP |
QSSAVAAAAA | | TTTATTTTTS | | SGGHPLEFLR | | NQPQFQQMRQ | | IIQQNPSLLP |
ALLQQIGREN | | PQLLQQISQH | | QEHFIQMLNE | | PVQEAGGQGG | | GGGGGSGGIA |
EAGSGHMNYI | | QVTPQEKEAI | | ERLKALGFPE | | GLVIQAYFAC | | EKNENLAANF |
LLQQNFDED |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wang G., Sawai N., Kotliarova S., Kanazawa I., Nukina N. (2000). Ataxin-3, the MJD1 gene product, interacts with the two human homologs of yeast DNA repair protein RAD23, HHR23A and HHR23B. Hum. Mol. Genet. 9: 1795—1803. PMID 10915768 DOI:10.1093/hmg/9.12.1795
- Batty D., Rapic'-Otrin V., Levine A.S., Wood R.D. (2000). Stable binding of human XPC complex to irradiated DNA confers strong discrimination for damaged sites. J. Mol. Biol. 300: 275—290. PMID 10873465 DOI:10.1006/jmbi.2000.3857
- Sugasawa K., Shimizu Y., Iwai S., Hanaoka F. (2002). A molecular mechanism for DNA damage recognition by the xeroderma pigmentosum group C protein complex. DNA Repair. 1: 95—107. PMID 12509299 DOI:10.1016/S1568-7864(01)00008-8
- Katiyar S., Li G., Lennarz W.J. (2004). A complex between peptide:N-glycanase and two proteasome-linked proteins suggests a mechanism for the degradation of misfolded glycoproteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 13774—13779. PMID 15358861 DOI:10.1073/pnas.0405663101
- Katiyar S., Lennarz W.J. (2005). Studies on the intracellular localization of hHR23B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 337: 1296—1300. PMID 16253613 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.09.192
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9813 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P54727 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |