RAPH1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4GMV, 4GN1 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAPH1, ALS2CR18, ALS2CR9, LPD, PREL-2, PREL2, RMO1, RalGDS/AF-6, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609035 MGI: 1924550 HomoloGene: 71030 GeneCards: RAPH1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Філоподія • cell projection • цитоскелет • cell leading edge • мембрана • lamellipodium • гіалоплазма • клітинна мембрана • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • GO:0072468 сигнальна трансдукція • axon extension |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_025252 NM_203365 NM_213589 NM_001329728 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001316657 NP_976241 NP_998754 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 203.39 – 203.54 Mb | Хр. 1: 60.52 – 60.61 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAPH1 (англ. Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 250 амінокислот, а молекулярна маса — 135 256[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEQLSDEEID | | HGAEEDSDKE | | DQDLDKMFGA | | WLGELDKLTQ | | SLDSDKPMEP |
VKRSPLRQET | | NMANFSYRFS | | IYNLNEALNQ | | GETVDLDALM | | ADLCSIEQEL |
SSIGSGNSKR | | QITETKATQK | | LPVSRHTLKH | | GTLKGLSSSS | | NRIAKPSHAS |
YSLDDVTAQL | | EQASLSMDEA | | AQQSVLEDTK | | PLVTNQHRRT | | ASAGTVSDAE |
VHSISNSSHS | | SITSAASSMD | | SLDIDKVTRP | | QELDLTHQGQ | | PITEEEQAAK |
LKAEKIRVAL | | EKIKEAQVKK | | LVIRVHMSDD | | SSKTMMVDER | | QTVRQVLDNL |
MDKSHCGYSL | | DWSLVETVSE | | LQMERIFEDH | | ENLVENLLNW | | TRDSQNKLIF |
MERIEKYALF | | KNPQNYLLGK | | KETAEMADRN | | KEVLLEECFC | | GSSVTVPEIE |
GVLWLKDDGK | | KSWKKRYFLL | | RASGIYYVPK | | GKAKVSRDLV | | CFLQLDHVNV |
YYGQDYRNKY | | KAPTDYCLVL | | KHPQIQKKSQ | | YIKYLCCDDV | | RTLHQWVNGI |
RIAKYGKQLY | | MNYQEALKRT | | ESAYDWTSLS | | SSSIKSGSSS | | SSIPESQSNH |
SNQSDSGVSD | | TQPAGHVRSQ | | SIVSSVFSEA | | WKRGTQLEES | | SKARMESMNR |
PYTSLVPPLS | | PQPKIVTPYT | | ASQPSPPLPP | | PPPPPPPPPP | | PPPPPPPPLP |
SQSAPSAGSA | | APMFVKYSTI | | TRLQNASQHS | | GALFKPPTPP | | VMQSQSVKPQ |
ILVPPNGVVP | | PPPPPPPPPT | | PGSAMAQLKP | | APCAPSLPQF | | SAPPPPLKIH |
QVQHITQVAP | | PTPPPPPPIP | | APLPPQAPPK | | PLVTIPAPTS | | TKTVAPVVTQ |
AAPPTPTPPV | | PPAKKQPAFP | | ASYIPPSPPT | | PPVPVPPPTL | | PKQQSFCAKP |
PPSPLSPVPS | | VVKQIASQFP | | PPPTPPAMES | | QPLKPVPANV | | APQSPPAVKA |
KPKWQPSSIP | | VPSPDFPPPP | | PESSLVFPPP | | PPSPVPAPPP | | PPPPTASPTP |
DKSGSPGKKT | | SKTSSPGGKK | | PPPTPQRNSS | | IKSSSGAEHP | | EPKRPSVDSL |
VSKFTPPAES | | GSPSKETLPP | | PAAPPKPGKL | | NLSGVNLPGV | | LQQGCVSAKA |
PVLSGRGKDS | | VVEFPSPPSD | | SDFPPPPPET | | ELPLPPIEIP | | AVFSGNTSPK |
VAVVNPQPQQ | | WSKMSVKKAP | | PPTRPKRNDS | | TRLTQAEISE | | QPTMATVVPQ |
VPTSPKSSLS | | VQPGFLADLN | | RTLQRKSITR | | HGSLSSRMSR | | AEPTATMDDM |
ALPPPPPELL | | SDQQKAGYGG | | SHISGYATLR | | RGPPPAPPKR | | DQNTKLSRDW |
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Michael M., Vehlow A., Navarro C., Krause M. (2010). c-Abl, Lamellipodin, and Ena/VASP proteins cooperate in dorsal ruffling of fibroblasts and axonal morphogenesis. Curr. Biol. 20: 783—791. PMID 20417104 DOI:10.1016/j.cub.2010.03.048
- Quinn C.C., Pfeil D.S., Wadsworth W.G. (2008). CED-10/Rac1 mediates axon guidance by regulating the asymmetric distribution of MIG-10/lamellipodin. Curr. Biol. 18: 808—813. PMID 18499456 DOI:10.1016/j.cub.2008.04.050
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14436 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q70E73 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |