RBM6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RBM6, 3G2, DEF-3, DEF3, HLC-11, NY-LU-12, g16, RNA binding motif protein 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606886 MGI: 1338037 HomoloGene: 31336 GeneCards: RBM6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001167582 NM_005777 NM_001349190 NM_001349191 NM_001349192
| NM_001349193 NM_001349194 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001161054 NP_005768 NP_001336119 NP_001336120 NP_001336121
| NP_001336122 NP_001336123 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 49.94 – 50.1 Mb | Хр. 9: 107.65 – 107.75 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RBM6 (англ. RNA binding motif protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 123 амінокислот, а молекулярна маса — 128 644[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MWGDSRPANR | | TGPFRGSQEE | | RFAPGWNRDY | | PPPPLKSHAQ | | ERHSGNFPGR |
DSLPFDFQGH | | SGPPFANVEE | | HSFSYGARDG | | PHGDYRGGEG | | PGHDFRGGDF |
SSSDFQSRDS | | SQLDFRGRDI | | HSGDFRDREG | | PPMDYRGGDG | | TSMDYRGREA |
PHMNYRDRDA | | HAVDFRGRDA | | PPSDFRGRGT | | YDLDFRGRDG | | SHADFRGRDL |
SDLDFRAREQ | | SRSDFRNRDV | | SDLDFRDKDG | | TQVDFRGRGS | | GTTDLDFRDR |
DTPHSDFRGR | | HRSRTDQDFR | | GREMGSCMEF | | KDREMPPVDP | | NILDYIQPST |
QDREHSGMNV | | NRREESTHDH | | TIERPAFGIQ | | KGEFEHSETR | | EGETQGVAFE |
HESPADFQNS | | QSPVQDQDKS | | QLSGREEQSS | | DAGLFKEEGG | | LDFLGRQDTD |
YRSMEYRDVD | | HRLPGSQMFG | | YGQSKSFPEG | | KTARDAQRDL | | QDQDYRTGPS |
EEKPSRLIRL | | SGVPEDATKE | | EILNAFRTPD | | GMPVKNLQLK | | EYNTGYDYGY |
VCVEFSLLED | | AIGCMEANQG | | TLMIQDKEVT | | LEYVSSLDFW | | YCKRCKANIG |
GHRSSCSFCK | | NPREVTEAKQ | | ELITYPQPQK | | TSIPAPLEKQ | | PNQPLRPADK |
EPEPRKREEG | | QESRLGHQKR | | EAERYLPPSR | | REGPTFRRDR | | ERESWSGETR |
QDGESKTIML | | KRIYRSTPPE | | VIVEVLEPYV | | RLTTANVRII | | KNRTGPMGHT |
YGFIDLDSHA | | EALRVVKILQ | | NLDPPFSIDG | | KMVAVNLATG | | KRRNDSGDHS |
DHMHYYQGKK | | YFRDRRGGGR | | NSDWSSDTNR | | QGQQSSSDCY | | IYDSATGYYY |
DPLAGTYYDP | | NTQQEVYVPQ | | DPGLPEEEEI | | KEKKPTSQGK | | SSSKKEMSKR |
DGKEKKDRGV | | TRFQENASEG | | KAPAEDVFKK | | PLPPTVKKEE | | SPPPPKVVNP |
LIGLLGEYGG | | DSDYEEEEEE | | EQTPPPQPRT | | AQPQKREEQT | | KKENEEDKLT |
DWNKLACLLC | | RRQFPNKEVL | | IKHQQLSDLH | | KQNLEIHRKI | | KQSEQELAYL |
ERREREGKFK | | GRGNDRREKL | | QSFDSPERKR | | IKYSRETDSD | | RKLVDKEDID |
TSSKGGCVQQ | | ATGWRKGTGL | | GYGHPGLASS | | EEAEGRMRGP | | SVGASGRTSK |
RQSNETYRDA | | VRRVMFARYK | | ELD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mishra M., Akatsu H., Heese K. (2011). The novel protein MANI modulates neurogenesis and neurite-cone growth. J. Cell. Mol. Med. 15: 1713—1725. PMID 20716133 DOI:10.1111/j.1582-4934.2010.01134.x
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Lerman M.I., Minna J.D. (2000). The 630-kb lung cancer homozygous deletion region on human chromosome 3p21.3: identification and evaluation of the resident candidate tumor suppressor genes. Cancer Res. 60: 6116—6133. PMID 11085536
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9903 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P78332 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |