RBPMS |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 5DET, 5CYJ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RBPMS, HERMES, RNA binding protein with multiple splicing, RNA binding protein, mRNA processing factor |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601558 MGI: 1334446 HomoloGene: 38238 GeneCards: RBPMS |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly(A) binding • nucleic acid binding • protein homodimerization activity • RNA binding • U1 snRNA binding • snRNA stem-loop binding • mRNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • P-body • cytoplasmic stress granule • U1 snRNP • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of SMAD protein signal transduction • GO:0001306 response to oxidative stress • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of nucleic acid-templated transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001008710 NM_001008711 NM_001008712 NM_006867 |
| | NM_001042674 NM_001042675 NM_001286168 NM_019733 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001008710 NP_001008711 NP_001008712 NP_006858 |
| | NP_001036139 NP_001036140 NP_001273097 NP_062707 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 30.38 – 30.57 Mb | Хр. 8: 34.27 – 34.42 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RBPMS (англ. RNA binding protein with multiple splicing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 196 амінокислот, а молекулярна маса — 21 802[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNNGGKAEKE | | NTPSEANLQE | | EEVRTLFVSG | | LPLDIKPREL | | YLLFRPFKGY |
EGSLIKLTSK | | QPVGFVSFDS | | RSEAEAAKNA | | LNGIRFDPEI | | PQTLRLEFAK |
ANTKMAKNKL | | VGTPNPSTPL | | PNTVPQFIAR | | EPYELTVPAL | | YPSSPEVWAP |
YPLYPAELAP | | ALPPPAFTYP | | ASLHAQMRWL | | PPSEATSQGW | | KSRQFC |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
- Teplova M., Farazi T.A., Tuschl T., Patel D.J. (2015). Structural basis underlying CAC RNA recognition by the RRM domain of dimeric RNA-binding protein RBPMS. Q. Rev. Biophys. 2015: 1—11. PMID 26347403 DOI:10.1017/S0033583515000207
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19097 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q93062 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |